|
Simulace šíření infekčních onemocnění v lidské populaci
Křištof, Jiří ; Šimek, Václav (oponent) ; Strnadel, Josef (vedoucí práce)
Cílem této práce je vytvoření epidemiologického modelu pro simulaci šíření infekčního onemocnění covid-19. Vytvořený SVLIHDRS model staví na kompartmentových modelech, implementován je poté jako Markovský řetězec se spojitým časem. Pro realizaci je využit nástroj UPPAAL. Při porovnání výstupů simulace s pozorovanými daty byla určena hodnota Spearmanova koeficientu 0,8940 pro infekční jedince, pro zemřelé 0,9987, průměrné hodnoty biasu jsou poté 12510,7285, respektive 316,2697. Výsledky této práce umožňují provádět dlouhodobou předpověď vývoje epidemie infekce covid-19.
|
|
Globální epidemiologie Staphylococcus aureus vyskytujících se ve zdravotnických zařízeních a v komunitě
Mrázková, Pavlína ; Tkadlec, Jan (vedoucí práce) ; Balíková Novotná, Gabriela (oponent)
Staphylococcus aureus je důležitým lidským patogenem, který je zodpovědný za široké spektrum infekcí vyskytujících se mezi pacienty ve zdravotnickém prostředí a v komunitě. Velká pozornost je věnována kmenům rezistentních na methicilin (MRSA), avšak i kmeny na methicilin citlivé (MSSA) zůstávají hlavní příčinou infekcí. Epidemiologie S. aureus, zejména kmenů MRSA, vykazovala v posledních letech rychlý vývoj, je charakteristická výskytem epidemických linií, které dominují v určitých geografických oblastech. Techniky molekulární typizace umožnily identifikovat hlavní úspěšné linie MRSA a MSSA, díky čemuž je možné pozorovat jejich rozšíření a zároveň reportovat prevalenci sledovaných klonů na daném území. Pro pochopení evoluce a šíření S. aureus, stejně jako pro nasazení efektivních preventivních opatření proti šíření tohoto nebezpečného patogenu, je znalost epidemiologie kmenů S. aureus naprosto nezbytná. V rámci bakalářské práce bude nejprve představen recentní přehled metod využívaných pro klonální analýzu Staphylococcus aureus. Dále bude provedena rešerše literatury s cílem vytvořit přehled o dominantních liniích S. aureus a MRSA cirkulujících v nemocnicích a komunitě s důrazem na situaci v České republice a v Evropě. Klíčová slova: Staphylococcus aureus, MSSA, epidemiologie, MRSA, klonální...
|
|
Výskyt Eboly v Africe v letech 2016–2021 a vliv rizikového chování místních obyvatel na šíření původce onemocnění
Horák, Filip
Bakalářská práce poskytuje základní informace o původci onemocnění Ebola zahrnující příznaky, přenos, diagnózu, léčbu, prevenci a dopady. Teoretická část také obsahuje popis epidemií způsobených virem Eboly od jeho objevení roku 1976 do konce západoafrické epidemie roku 2016. Následně se v prvním segmentu praktické části zaměřuje výzkum na průběh a analýzu epidemií způsobených virem Eboly v Africe v období od vyhasnutí velké epidemie, tedy od druhé poloviny roku 2016 do konce roku 2021. Tento segment taktéž poskytuje informace o financování a o aktuální vakcinační strategii. Druhý segment praktické části analyzuje dotazníkové šetření realizované ve třech afrických zemích (Ghana, Jihoafrická republika a Nigérie). Dotazníkové šetření analyzuje povědomí, dopady a rizikové chování afrických obyvatel v návaznosti na onemocnění způsobené virem Eboly.
|
|
Epidemiologie, komorbidity a kvalita života u pacientů s psoriázou
Hugo, Jan ; Gkalpakiotis, Spyridon (vedoucí práce) ; Kodet, Ondřej (oponent) ; Slonková, Veronika (oponent)
Psoriáza je komplexní systémovou chorobu, řazenou mezi imunitně podmíněná zánětlivá onemocnění (IMID, Immune-Mediated Inflammatory Disease). Přestože sama o sobě neohrožuje život pacientů, mívá dramatický dopad na jejich kvalitu života, a nese riziko rozvoje řady komorbidit. Proto i s ohledem na skutečnost, že se jedná o jednu z nejčastějších chronických dermatóz, postihující více než 100 milionů osob po celém světě, vyhodnotila WHO psoriázu jako závažný celosvětový zdravotní problém. Cílem léčby je dostat chorobu pod dlouhodobou kontrolu, dosáhnout co nejmenšího počtu viditelných projevů a minimální aktivity tvorby nových, kdy u pacientů s těžkou formou psoriázy je nezbytná systémová terapie. To bylo ale dlouho dobu velmi obtížné, protože preparáty konvenční systémové terapie často neměly dostatečnou účinnost, a navíc kvůli nežádoucím účinkům a nutnosti častých laboratorní vyšetření nebyly ani vhodné k dlouhodobému podávání. Díky intenzivnímu výzkumu a lepšímu porozumění etiopatogeneze psoriázy však došlo k vyvinutí cílené biologické terapie, která představuje výrazný pokrok stran účinnosti i bezpečnosti. Jedná se ale o terapii novou, takže řada otázek, zejména u novějších generací biologické terapie, stále není zodpovězena. Naše práce se proto zaměřila na získání a analyzování dat z reálné...
|
|
Epidemiologická analýza sexuálně přenosných infekcí v Česku
Sekera, Jan Carlos
Sexuálně přenosné infekce patří k onemocněním, které vykazují nárůst a představují velký zdravotní problém především mezi mladou populací. Mají přímý dopad na sexuálně reprodukční zdraví prostřednictvím stigmatizace, neplodnosti, rakoviny a těhotenských komplikací a mohou zvýšit riziko HIV. Disertační práce se zaměřuje na epidemiologickou situaci sexuálně přenosných infekcí v Česku. Snaží se doplnit chybějící údaje o této skupině onemocnění a přispět tak analýzou k lepšímu pochopení vývoje a současného stavu v Česku. Práce je koncipována jako soubor článků. V rámci disertační práce autor úvodem představuje kontext svého odborného zaměření v rámci oblasti poznání, prostřednictvím publikovaných studií. Publikované studie, které tvoří tuto disertační práci, se zaměřovaly na čtyři významné oblasti problematiky sexuálně přenosných infekcí: zdravotní gramotnost, socio-demografickou analýzu injekčních uživatelů drog, testování na HIV v době pandemie a na regionální rozdíly. První ze souboru zařazených prací analyzovala úroveň zdravotní gramotnosti v oblasti problematiky HIV/AIDS. Poznatky o nerovnostech ve zdravotní gramotnosti jsou zásadním předpokladem pro aplikaci preventivních opatření. Druhá ze zařazených studií se zaměřovala na analýzu sexuálně přenosných infekcí v populaci injekčních uživatelů...
|
|
Epidemiologická analýza sexuálně přenosných infekcí v Česku
Sekera, Jan Carlos ; Dzúrová, Dagmar (vedoucí práce) ; Pikhart, Hynek (oponent) ; Rob, Filip (oponent)
Sexuálně přenosné infekce patří k onemocněním, které vykazují nárůst a představují velký zdravotní problém především mezi mladou populací. Mají přímý dopad na sexuálně reprodukční zdraví prostřednictvím stigmatizace, neplodnosti, rakoviny a těhotenských komplikací a mohou zvýšit riziko HIV. Disertační práce se zaměřuje na epidemiologickou situaci sexuálně přenosných infekcí v Česku. Snaží se doplnit chybějící údaje o této skupině onemocnění a přispět tak analýzou k lepšímu pochopení vývoje a současného stavu v Česku. Práce je koncipována jako soubor článků. V rámci disertační práce autor úvodem představuje kontext svého odborného zaměření v rámci oblasti poznání, prostřednictvím publikovaných studií. Publikované studie, které tvoří tuto disertační práci, se zaměřovaly na čtyři významné oblasti problematiky sexuálně přenosných infekcí: zdravotní gramotnost, socio-demografickou analýzu injekčních uživatelů drog, testování na HIV v době pandemie a na regionální rozdíly. První ze souboru zařazených prací analyzovala úroveň zdravotní gramotnosti v oblasti problematiky HIV/AIDS. Poznatky o nerovnostech ve zdravotní gramotnosti jsou zásadním předpokladem pro aplikaci preventivních opatření. Druhá ze zařazených studií se zaměřovala na analýzu sexuálně přenosných infekcí v populaci injekčních uživatelů...
|
|
Epidemické modely s vakcinací a behaviorálními změnami
LUNGA, Petr
Práce se věnuje kompartmentovým modelům používaným v matematické epidemiologii k modelování dynamiky infekčních onemocnění. Cílem práce bylo seznámit se se základními principy a metodami, které jsou v tomto oboru využívány a naučit se samostatně vytvářet modely a správně interpretovat jejich výsledky. První dvě kapitoly se věnují úvodu do problematiky a tzv. SIR modelům, které jsou základním nástrojem epidemiologického modelování. Další kapitoly obsahují rozšíření základních modelů o vakcinaci a změny chování v populaci. V poslední kapitole jsou dva vlastní modely, které využívají principy z předchozích kapitol. Modely v celé práci jsou simulovány v programu AnyLogic.
|
|
Vybrané aspekty léčby metotrexátem u pacientů s revmatoidní artritidou
Hloch, Karel ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Souček, Miroslav (oponent) ; Tomčík, Michal (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra sociální a klinické farmacie Kandidát: Mgr. Karel Hloch Školitel: prof. PharmDr. Petr Pávek, Ph.D.; doc. MUDr. Tomáš Soukup (konzultant), Ph.D.; PharmDr. Martin Doseděl, Ph.D. (konzultant) Název disertační práce: Vybrané aspekty léčby metotrexátem u pacientů s revmatoidní artritidou Úvod a cíle Revmatoidní artritida (RA) je autoimunitní onemocnění spojené s chronickým zánětem kloubů, které způsobuje jejich otok a bolest. Prevalence tohoto onemocnění je v obecné populaci přibližně 1 %. Vyšší morbidita a úmrtnost u pacientů s RA je spojena se zvýšenou zánětlivou aktivitou související s kardiovaskulárními onemocněními (KVO). Metotrexát (MTX), léčivo s imunosupresivní aktivitou, je lékem první volby při léčbě RA. Zdá se, že jeho hlavní protizánětlivý účinek je zprostředkován zvýšeným uvolňováním purinového nukleosidu adenosinu. Stav pacientů se zánětlivými onemocněními je ovlivněn aktivací adenosinových receptorů A2a a A3. Vysoká spotřeba kofeinu (antagonisty adenosinových receptorů) může proto vést ke změně účinnosti léčby MTX. 1) Cílem první, retrospektivně-prospektivní, observační, průřezové studie bylo zjistit, zda pacienti s RA, kteří nebyli léčeni MTX (skupina MTX 0) v čase zařazení do studie, byli ve vyšším riziku KVO než...
|
|
Leishmaniózy a jejich přenašeči v západní Africe
Hošková, Anna ; Dvořák, Vít (vedoucí práce) ; Sádlová, Jovana (oponent)
Leishmanióza je parazitární onemocnění přenášené flebotomy. V západní Africe se leishmaniózy vyskytují endemicky a setkáme se zde s kožní, viscerální a mukokutánní formou onemocnění. Nejčastější formou nemoci je v této oblasti kožní leishmanióza, kterou způsobují druhy Leishmania major, Leishmania tropica a nový, zatím nepopsaný druh Leishmania sp. z Ghany. Původci viscerální leishmaniózy jsou druhy Leishmania donovani a Leishmania infantum. Potvrzeným přenašečem druhu L. major je v tomto regionu Phlebotomus duboscqi. Vektoři druhu Leishmania sp. z Ghany ani přenašeči viscerální leishmaniózy nejsou v západní Africe známi. Za potenciální alternativní přenašeče jsou v této oblasti považováni flebotomové z rodu Sergentomyia nebo tiplíci. Potvrzenými rezervoárovými hostiteli druhu L. major jsou v některých státech hlodavci Tatera gambiana, Arvicanthis niloticus a Mastomys erythroleucus, ve většině států ale potvrzeni nejsou. Rezervoároví hostitelé viscerální leishmaniózy jsou hlavně psi. Některé státy západní Afriky bývaly francouzské kolonie a ve Francii žije hodně lidí afrického původu, kteří jezdí navštěvovat své příbuzné do západní Afriky. Tím hrozí import leishmanióz do neendemických oblastí. Cílem této bakalářské práce je shrnout současné poznatky o výskytu leishmanióz v západní Africe a...
|
|
Epidemiologické modelování šíření nemoci Covid-19
Motlíčková, Klára ; Ředina, Richard (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá matematickým kompartmentovým modelováním pandemie COVID-19. Jsou zde přiblíženy základní epidemiologické modely a uvedeno šest studií, které se zabývají chováním viru SARS-CoV-2 za různých podmínek. Na modelu SIR je proveden odhad parametrů, výpočetně pro první a čtvrtou vlnu epidemie, dále pomocí algoritmu v prostředí MATLAB provedena optimalizace pro všechny vlny epidemie v ČR a také pro čtvrtou vlnu epidemie na modelu SEIR. Pro model SIR je také modelován vliv protiepidemických opatření.
|