Název:
Molekulární profilování k odhalení nových signatur u nádorových onemocnění
Překlad názvu:
Molecular Profiling to Reveal Novel Signatures in Cancer
Autoři:
Matyašovská, Natália ; Palička, Vladimír (vedoucí práce) ; Fričová, Dominika (oponent) ; Matoušková, Petra (oponent) Typ dokumentu: Disertační práce
Rok:
2024
Jazyk:
eng
Abstrakt: [eng][cze] 11 Summary ENG While reliable biomarkers for personalized management of pancreatic neuroendocrine tumors (PanNETs) remains limited, transcriptomic profiling of microRNAs (miRNAs) and mRNAs has shown promise in segregating PanNET subtypes and predicting treatment response. Since miRNAs are key post-transcriptional regulators of mRNA expression, integrating data on dysregulated miRNAs and mRNAs could provide critical insights into the molecular pathogenesis of PanNETs. This study aimed to investigate the role of mRNA and miRNA expression in the molecular pathogenesis, clinical presentation, and prognosis of PanNETs compared to non- diseased controls. RNA sequencing was performed to identify differentially expressed mRNAs, with a focused analysis on clinicopathological biomarkers. PanNET samples were also classified into distinct molecular subtypes based on their transcriptomic profiles. miRNA sequencing was conducted to detect differentially expressed miRNAs, which were validated using quantitative real-time PCR and public datasets. An integrative analysis of miRNA- mRNA interactions was then performed to uncover regulatory networks and functional pathways. The results revealed significant dysregulation, with 715 upregulated and 702 downregulated genes identified in PanNETs. Pathway analysis provided insights...10 Summary CZE Zatímco spolehlivé biomarkery pro personalizovanou léčbu neuroendokrinních nádorů slinivky břišní (PanNET) jsou stále omezené, transkriptomické profilování mikroRNA (miRNA) a mRNA se ukázalo jako slibné pro segregaci podtypů PanNET a předpovídání odpovědi na léčbu. Vzhledem k tomu, že miRNA jsou klíčovými posttranskripčními regulátory exprese mRNA, mohla by integrace údajů o dysregulovaných miRNA a mRNA poskytnout zásadní poznatky o molekulární patogenezi PanNEN. Cílem této studie bylo prozkoumat úlohu exprese mRNA a miRNA v molekulární patogenezi, klinické prezentaci a prognóze PanNETů ve srovnání s kontrolními skupinami bez onemocnění. Bylo provedeno sekvenování RNA za účelem identifikace rozdílně exprimovaných mRNA se zaměřením na klinicko-patologické biomarkery. Vzorky PanNET byly také rozděleny do odlišných molekulárních podtypů na základě transkriptomických profilů. Sekvenování miRNA bylo provedeno za účelem detekce rozdílně exprimovaných miRNA, které byly validovány pomocí kvantitativní PCR v reálném čase a veřejných souborů dat. Poté byla provedena integrativní analýza interakcí miRNA-mRNA s cílem odhalit regulační sítě a funkční dráhy. Výsledky odhalily významnou dysregulaci 715 upregulovaných a 702 downregulovaných genů v PanNET. Analýza drah umožnila nahlédnout do molekulárních...
host ::
