Název: Metody vícenásobného zarovnávání nukleotidových sekvencí
Překlad názvu: Methods for multialignment of nucleotide sequences
Autoři: Trněný, Ondřej ; Škutková, Helena (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2013
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Ke správnému pochopení vlastností a účelu biologických sekvencí je nezbytně nutné mít možnost je mezi s sebou porovnávat a ze získaných informací vyvozovat jejich vlastnosti, účel a evoluční historii. K rozšíření již existující báze znalostí mohou velkou mírou přispět metody pro vícenásobné zarovnávaní sekvencí, které umožňují nahlížet na již známá fakta ve zcela novém světle dosud neznámých informací o vztazích mezi často na první pohled nepodobnými sekvencemi. Pro provádění této analýzy proto bylo navrženo několik algoritmů, na jejichž základě následně vznikly programy umožňující komplexní analýzu obsáhlých dat. Jedním z nich je algoritmus progresivního zarovnání, který je v rámci této práce implementován. To be able to understand characteristics and purpose of biological sequences correctly, it is crucial to have a possibility to sort and compare them. Because of this need and to extend existing knowledge pool, numerous methods were proposed. Especially in field of multiple sequences alignment. Methods for multiple sequences alignment may provide various valuable information about sequences which failed to show enough similarity in pairwise alignment. According to this, several algorithms were implemented in various computer applications which provide a way to analyse huge sets of data. One of those, the progressive alignment algorithm, is implemented as a part of this thesis
Klíčová slova: ClustalW; ClustalX; Matlab; objektové programování; Progresivní zarovnání; párové zarovnání; T-Coffee; vícenásobné zarovnání; ClustalW; ClustalX; Matlab; Multiple sequences alignment; Object oriented programming; Pairwise alignment; Progressive alignment algorithm; T-Coffee

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/25934

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-220010


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce