|
|
Role SMN komplexu v biogenezi snRNP částic
Hanušková, Klára ; Staněk, David (vedoucí práce) ; Šubrtová, Adriána (oponent)
Malé jaderné ribonukleoproteinové částice (snRNP) jsou esenciální složkou spliceosomu, dynamického proteinového komlexu zajišťujícího RNA sestřih. Tyto částice jsou složeny z jedné malé jaderné RNA, podle níž nesou svůj název, kruhu sedmi Sm nebo LSm proteinů a dalších přidatných proteinů. Všechny snRNP podstupují složitou cestou zrání, probíhající v jádře a cytoplasmě buňky. Jedním z důležitých faktorů biogeneze snRNP je SMN komplex, který je složen z proteinů SMN, Gemin2-8 a Unrip. Jeho nejdůležitější funkcí je zprostředkování sestavení Sm core domény v cytoplasmě buňky, za pomoci proteinového komplexu PRMT5. Dále se také SMN komplex zapojuje do modifikace snRNA, importu snRNP do jádra, nebo samotného sestavení sestřihového komplexu. I přes více jak dvě dekády výzkumů nejsou některé funkce SMN komplexu a jeho částic zcela odhaleny a není tedy zcela jasné v jak velké míře tento komplex ovlivňuje nejen biogenezi snRNP, ale i celého spliceosomu. Cílem této práce je, dle dostupných výzkumů, hlubší popis SMN komplexu a pochopení jeho funkcí v biogenezi snRNP částic. Klíčová slova: SMN komplex, snRNP, snRNA, Sm protein, sestřihový komplex
|
|
|
Využití HPLC v chirálních separacích VIII.
Šlapáková, Tereza ; Horáček, Ondřej (vedoucí práce) ; Lochman, Lukáš (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Studentka: Bc. Tereza Šlapáková Vedoucí diplomové práce: RNDr. Ondřej Horáček, Ph.D. Konzultant diplomové práce: doc. PharmDr. Radim Kučera, Ph.D. Název diplomové práce: Využití HPLC v chirálních separacích VIII. Karborany jsou vysoce stabilní, hydrofobní, anorganické sloučeniny, které vychází z ikosahedrální struktury tvořené z atomů bóru. Někteří zástupci karboranů jsou chirální, což je dáno především asymetrickou substitucí. S ohledem na možné budoucí využití chirálních karboranů v praxi je nutné vyvinout rychlé metody, které umožní spolehlivé rozdělení enantiomerů. Pro aplikaci do praxe je výhodná především metoda vysokoúčinné kapalinové chromatografie, jelikož je široce využívaná, robustní a aplikovatelná do velkého spektra oborů. Cílem práce bylo otestovat chování chirálních karboranů na polysacharidových kolonách v HPLC. Nejprve byl proveden screening gradientovou metodou s využitím šesti chirálních stacionárních fází na bázi polysacharidů, složkou A mobilní fáze byl 50 mmol/l NaClO4, složkou B ACN či MeOH. Následně proběhl převod gradientové metody na izokratickou. Dalším cílem bylo optimalizovat podmínky a vytvořit tak databázi separací, která může sloužit k dalšímu...
|
|
|
Glucose effect on lipid metabolism homestasis in pancreatic β-cells
Stokičová, Linda ; Holendová, Blanka (vedoucí práce) ; Horáková, Olga (oponent)
Lipidy jsou důležitou součástí β-buněk. Nejenomže jsou nezbytnou strukturní složkou buněčných membrán a zdrojem energie, ale hrají nepostradatelnou roli ve fyziologii β-buněk. Jejich metabolismus je těsně propojen s metabolismem glukózy, zásadní molekulou pro β-buňky. Přítomnost lipidů je důležitá pro glukózou stimulovanou sekreci inzulinu a jejich metabolismus je nezbytný pro správnou funkci β-buněk. Lipidy jsou skladovány v tukových kapénkách ve formě triacylglycerolů, retinol esterů a cholesterol esterů. Tyto dynamické buněčné struktury jsou důležité pro metabolismus lipidů a ochranu buňky před různými typy stresu. Chronické vystavování β-buněk glukóze a lipidům vede ale k narušení GL/NEFA cyklu (cyklus glycerolu a volných mastných kyselin), glukolipotoxicitě a dále k dysfunkci β-buněk, jejich dediferenciaci, insulinové rezistenci a diabetu 2. typu. Experimentální část je zaměřena na charakteristiku lipidového metabolismu v β-buňkách ve spojení s metabolismem glukózy a redoxním prostředím. Glukózou indukovaná exprese proteinů účastnících se lipidového metabolismu (aktivace mastných kyselin, lipolýza, lipogeneze, atd.) a efekt pozměněného redoxního prostředí byly analyzovány v INS1E buněčné linii β-buněk a izolovaných myších pankreatických ostrůvcích. Množství tukových kapének bylo závislé na...
|
|
|
Stanovení účinných látek a případných degradačních produktů v historickém vzorku přípravku Algena z roku 1981
Bauerová, Markéta ; Nesměrák, Karel (vedoucí práce) ; Kozlík, Petr (oponent)
Tableta Algena bylo léčivo volně dostupné na trhu v druhé polovině dvacátého století v Československu. Algena byla užívána především protibolestem.Tableta obsahuje čtyřiúčinné látky: aminofenazon,aprobarbital, fenacetin a kofein. Cílem této práce bylo analyzovat účinné látky v historické tabletě Algeny z roku 1981, stanovit jejich koncentrace a případné rozkladné produkty. Aby byly tyto cíle splněny, bylo třeba vyvinout a optimalizovat RP-HPLC metodu s UV detekcí. Dále byla použita HPLC-MS, která měla sloužit k odhalení případných degradačních produktů. Separace probíhala na koloně XBridge® BEH C18 (150×3,0 mm; 2,5 µm), byla použita binární gradientová eluce, kdy první složkou byl 0,1% roztok octové kyseliny ve vodě, druhou složkou byl methanol. Stanovené obsahy účinných látek (vzhledem k deklarovanému obsahu výrobcem) byly: amino- fenazon 97,0 %, aprobarbital 89,2 %, fenacetin 96,0 % a kofein 93,2 %. Hmotnostní detekcí nebyly prokázány žádné degradační produkty stanovovaných látek. Klíčová slova: Algena, aminofenazon, aprobarbital, degradace, fenacetin, kofein, RP-HPLC
|
|
| |
|
|
Vliv trupové stabilizace na rychlost odhodu u vícebojařů
Hanuliaková, Júlia ; Žáková, Lenka (vedoucí práce) ; Stupková, Michaela (oponent)
Název práce: Vliv trupové stabilizace na rychlost odhodu u vícebojařů Vymezení problému: Nedílnou součástí atletického víceboje jsou vrhačské disciplíny. Stabilní trup je potřebnou složkou kinematického řetězce při generaci síly během házení. Hod a vrh bývá obvykle neefektivní, pokud svaly nohou a trupu nejsou schopny vyvinout dostatečnou sílu nebo nedochází k přenosu energie do odhodové paže. Práce se zabývá vlivem trupové stabilizace na odhodovou rychlost. Cíl práce: Zjistit, zda je možné zvýšit odhodovou rychlost u vícebojařů pomocí cvičení zaměřených na zlepšení trupové stabilizace. Metody: Měření odhodové rychlosti pomocí sportovního radaru, zhodnocení úrovně trupové stabilizace pomocí stereotypu kliku dle Jandy, testu medvěda a hlubokého dřepu dle Koláře a McGillʹs torso muscular endurance test battery. Výsledky: Během desetitýdenní intervence zaměřené na trupovou stabilizaci u experimentální skupiny došlo k průměrnému zlepšení odhodové rychlosti o 5,76 km/h (8,9 %). Kontrolní skupina, pokračující ve standardním tréninku, zaznamenala pouze mírné zlepšení odhodové rychlosti o 1 km/h (2 %). Při hodnocení trupové stabilizace došlo po intervenci u experimentální skupiny k vylepšení hodnocení, zatímco u kontrolní skupiny nebylo pozorováno zhoršení nebo došlo k mírnému zlepšení. Hodnocení trupové...
|
|
|
Vývoj aktivních doplňků s probiotickou složkou
Cveček, Jan ; Dzurická, Lucia (oponent) ; Márová, Ivana (vedoucí práce)
Předmětem této bakalářské práce bylo prozkoumat antimikrobiální aktivitu probiotických bakterií a zjistit, jaký vliv na ni mají prebiotika a izoláty z rostlin. Probiotika jsou bakterie, které mají zdravotní benefity pro člověka. Jejich hlavní použití je v potravinářském průmyslu, jako startovacích kultur fermentace, kdy při tomto procesu produkují antimikrobiální látky, které podporují odolnost vůči patogenním bakteriím a prodlužují dobu trvanlivosti fermentovaných potravin. Díky jejich antimikrobiálním vlastnostem je vyvíjena snaha najít další využití těchto metabolických produktů v potravinářském průmyslu. Nicméně další uplatnění probiotik je velice limitující, protože se jedná o živé organismy. Postup, který by mohl napomoci využití živých probiotik, je jejich enkapsulace s prebiotiky. V experimentální části bakalářské práce byl sledován nárůst probiotik v komerčním médiu a v minimálním médiu. Minimální médium je vhodné pro izolaci, metabolických produktů, jako jsou kyselina mléčná a bakteriociny. Dále byl sledován vliv obohaceného média o kombinace prebiotika-inulinu a esenciálních olejů z oregana a tymiánu na produkci biomasy. V druhé části byla analyzována kyselina mléčná a antimikrobiální aktivita kultur v jednotlivých médiích a kultur v komerčním médiu s aditivy. Pomocí antimikrobiálních testů bylo prokázáno, že esenciální olej z tymiánu a inulin mají pozitivní vliv na antimikrobiální působení probiotik. Pomocí výsledků z první a druhé části měření bylo minimální médium prokázáno jako nevhodné pro kultivaci vybraných probiotik, protože nárůst a antimikrobiální aktivita izolátů z tohoto média byla velice nízká. V třetí části byly zhotoveny částice pomocí enkapsulace probiotik s prebiotiky a esenciálními oleji a byl sledován nárůst probiotické kultury z daných částic. Výsledkem bylo, že probiotika z částic se během 15 dní postupně uvolňovaly do média a narůstaly. Následně bylo navrženo využití těchto částic v potravinářském průmyslu a jejich další zkoumání.
|
|
|
Financial time series analysis based on innovative Machine Learning Signal Processing approaches
Tshiangomba, Reagan Kasonsa ; Sehnalová, Pavla (oponent) ; Cicone, Antonio (vedoucí práce)
Forecasting financial time series has been classified as one of the most challenging problems in the last decade due to its non-stationarity and non-linear properties. On one hand, statistical techniques have been found incapable of accurately predicting financial time series. On the other hand, machine learning techniques have achieved remarkable results, but they do not provide an explicit way of handling the non-stationarity property of financial time series. The proposed approach leverages the capabilities of signal processing decomposition techniques to address the non-stationarity property of financial time series. The signal decomposition technique employed in this work is iterative filtering (IF), which generates intrinsic mode functions (IMFs). These generated IMFs, along with the original signal, are used to produce a time-frequency representation of the financial time series, called IMFogram. Two types of data, namely the IMFs and IMFogram, are utilized to train a fusion neural network for predicting the financial time series. One entry component of the fusion neural network is an artificial neural network (ANN) taking the IMFs as input. The other entry component of the fusion neural network is a convolutional neural network (CNN), which takes the IMFogram as input. The outputs of the ANN and the CNN are concatenated for a regression task. We show the application of this newly developed approach to financial data, NASDAQ series to be precise. And we report its performance in different scenarios of boundary conditions.
|
|
|
Virtuální zprovoznění robotizovaného výukového systému
Dejmek, Tomáš ; Knoflíček, Radek (oponent) ; Vetiška, Jan (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá virtuálním zprovozněním robotizovaného systému. Tento systém se nachází v prostorách Ústavu výrobních strojů, systémů a robotiky VUT v Brně. Virtuální zprovoznění se stává v posledních letech nepostradatelnou složkou při tvorbě automatizovaných pracovišť. Má vliv na snižování nákladů a prostojů ve výrobě. Práce obsahuje teoretickou část, která se věnuje rešerši témat spojených s virtuálním zprovozněním. To je zde uvedeno do širších souvislostí s pojmem Průmysl 4.0. Následuje popis částí robotizovaného systému a popis operací, které má systém provést. Praktická část se věnuje popisu tvorby simulačního modelu v softwaru RobotStudio. Na to navazuje část poslední, která přibližuje tvorbu výukových materiálů. Tyto materiály jsou textové soubory obsahující detailní postup pro práci s programem RobotStudio. Výstupem této práce je virtuální zprovoznění a tvorba výukových podkladů.
|
|
|
Od trusu k prostřenému ubrusu. Molekulární analýza potravy raka signálního
ŠKRABÁNEK, Jan
Tato bakalářská práce měla za cíl analyzovat potravu raka signálního v Křesánovském potoce během roku 2020, v měsících od dubna do října. Dalším cílem bylo najít a otestovat vhodné markery pro analýzu potravy. Tyto markery jsou podrobněji popsány v textu této práce. Analyzovali jsme potravu raka signálního pomocí izolované DNA ze vzorků fekálních pelet odebíraných každý měsíc. Pomocí skupinově specifických DNA markerů jsme se zaměřili na klíčové potravní skupiny makrozoobenthosu. Tyto skupiny jsou Heptageniidae (markery Hpt28Sf + Hpt28Sr), Ephemeroptera (Epa28Sf + Epa28Sr), Integripalpia a Spicipalpia (Inspi18Sf + Inspi18Sr), Plecoptera (Ple-gen A269 + Ple-gen S268), Chironomidae (Chiro18Sf + Chiro18Sr) a Gammaridae (Gamae28Sf + Gamae28Sr). V potravě byla také analyzována makrofyta Characeae (CHA677 + CHA1681R) a dvouděložné rostliny (MYR152F + MYR1696R).Výsledky ukázaly, že potrava raka signálního se v průběhu sezóny měnila. Během celé sezóny byly nejčastější potravní skupinou Gammaridae, nalezené v 54,1 % vzorků fekálních pelet. Skupiny Heptageniidae, Integripalpia/Spicipalpia byly také hojně zastoupené (detekovány ve 31,3 % vzorků). Skupina Plecoptera se objevila ve 20,8 % vzorků fekálních pelet, zatímco Chironomidae a Characeae byly nalezeny v 10,4 %. Dvouděložné rostliny byly zastoupeny v 8,3 % vzorků. Nejméně početnou skupinou byly Ephemeroptera, které byla detekována pouze v jednom vzorku fekálních pelet (2,1 %).V dubnu byly Gammaridae nejvýznamnější složkou potravy, a Heptageniidae byli drouhou nejzastoupěnější skupinou.V květnu byla strava pestřejší, ale Gammaridae zůstaly hlavním zdrojem potravy (nalezeny v 6 vzorcích) následované Integripalpia/Spicipalpia (v 5 vzorcích). V červnu byly Gammaridae přítomny ve všech vzorcích, zatímco Heptageniidae a Integripalpia/Spicipalpia byly významné. V červenci byly Heptageniidae nejčastější potravní skupinou (v 5 vzorcích), druhou byly Gammaridae (nalezeny ve 4 vzorcích). V srpnu a říjnu nebyly ve vzorcích nalezeny žádné potravní skupiny, a v září byly Gammaridae přítomni pouze v jednom vzorku fekálních pelet. Celkově tato studie poskytuje přehled o sezónních změnách v potravě raka signálního a markerech určených pro její analýzu.
|
host ::
RSS.