|
| |
|
|
Význam S1 podmísta intramembránových proteas z rodiny rhomboidů pro katalýzu a návrh inhibitorů
Kučerová, Jolana ; Stříšovský, Kvido (vedoucí práce) ; Hodek, Petr (oponent)
Tato bakalářská práce se zabývá vývojem specifických inhibitorů intramembránových proteas z rodiny rhomboidů. Tyto inhibitory jsou potřebné pro buněčně biologické studium rhomboidových proteas i jejich potenciální farmakologické zacílení. Intramembránové proteasy z rodiny rhomboidů jsou spojovány s různými onemocněními, jako například malárií, Parkinsonovou chorobou, rakovinou, či toxoplazmózou. Laboratoř školitele nedávno objevila první skupinu takovýchto inhibitorů, peptidyl ketoamidy. Pro jejich plné využití je nutné vlastnosti a možnosti modifikace těchto látek blíže prozkoumat. Cílem této práce bylo prostřednictvím syntetických fluorogenních substrátů a enzymové kinetiky ověřit možnosti využití S1 podmísta v aktivním místě rhomboidu pro návrh inhibitorů se zvýšenou účinností a selektivitou, a také pomocí variant substrátů se záměnami v P1 pozici za nepřirozené aminokyseliny prozkoumat mechanismus transferu vody do aktivního místa rhomboidové proteasy. Ze srovnání rychlosti štěpení deseti fluorogenních substrátů s modifikací v P1 pozici rhomboidem GlpG z E. coli bylo zjištěno, že nejlépe přijímané postranní řetězce aminokyselin v P1 pozici (vážící se do S1 podmísta) jsou pro GlpG -CH2-CH3 a -CH3. Tento trend se potvrdil i u peptidyl ketoamidových inhibitorů. Ze studia substrátů a inhibitorů...
|
|
|
Scavenger receptor - trypsinová peptidáza IrSRP-1 z klíštěte \kur{I. ricinus}
SINGEROVÁ, Barbora
Scavenger receptors are a large family of structurally diverse molecules that have been implicated in a range of biological functions. In this work, a newly identified multi-domain scavenger receptor-serine protease IrSRP-1 from the tick Ixodes ricinus is characterized. IrSRP-1 is related to the serine protease Sp22D from the mosquito Anopheles gambiae. IrSRP-1 is expressed mainly in the tick gut but also in hemocytes, Malpighian tubules, tracheas and ovaries of fully fed females. This was confirmed with Western blots and immunohistological labeling with antibodies raised against recombinantly expressed IrSRP-1 trypsine-like domain. According to acquired qRT-PCR profiles relative expression of IrSRP-1 is strongly up-regulated during female feeding and remains unchanged in ticks experimentally injected with various microbes. Functional characterization by RNA interference revealed that lowering IrSRP1 expression leads to a higher mortality rate during tick female feeding.
|
|
|
Molecular and biochemical characterization of serine protease SmSP1 in \kur{Schistosoma mansoni}
OPAVSKÝ, David
SmSP1 is a chimerical serine protease consisted of three domains (cub, LDLa and trypsin-like) and found in Schistosoma mansoni. Its characterization was performed by molecular techniques such as PCR screen, qRT-PCR and RNA interference (RNAi) to gain information about expression profile, level expression and susceptibility to RNAi. Further, protein expression was carried out to gain an antigen for immunization and recombinant for biochemical studies. Results of PCR screen and qRT-PCR suggested possible function of SmSP1 in egg and adult stages but SmSP1 gene was not found susceptible to RNAi in NTS. Recombinant from E. coli was successfully used for immunization. Active recombinant was likely expressed in Pichia pastoris but expression conditions are unstable and expression optimization is necessary.
|
host ::
RSS.