|
|
Mycobacterium tuberculosis - stavba a funkce buněčné stěny
Kukrálová, Simona ; Janďourek, Ondřej (vedoucí práce) ; Jílek, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví Uchazeč: Bc. Simona Kukrálová Školitel: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. Název diplomové práce: Mycobacterium tuberculosis - stavba a funkce buněčné stěny Mycobacterium tuberculosis je intracelulárním patogenem způsobujícím onemocnění zvané tuberkulóza, které stále spadá spolu s jinými vybranými onemocněními do hlavních příčin úmrtnosti na světě. Odhaduje se, že více jak milion lidí ročně tomuto onemocnění podlehne. Pozoruhodná stavba buněčné stěny mykobakterií má velký vliv na samotnou léčbu tuberkulózy společně se stále vyšším výskytem multirezistentních a extenzivně rezistentních kmenů především u Mycobacterium tuberculosis. Výzkumu mykobakterií je věnována velká pozornost. Snaha o nalezení nových sloučenin s antimykobakteriálním účinkem působících na jednotlivé komponenty buněčné stěny, nejlépe na buněčnou stěnu jakožto celek, je dnes stále aktuální a je součástí různých programů na národní i nadnárodní úrovni. Tato diplomová práce v teoretické části shrnuje současné poznatky o mykobakteriích s důrazem na buněčnou stěnu, epidemiologii tuberkulózy a možnosti terapie tohoto infekčního onemocnění. V experimentální části se zabývá...
|
|
|
Základy současné antimykobakteriální léčby
Šilhavá, Kristýna ; Janďourek, Ondřej (vedoucí práce) ; Diepoltová, Adéla (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Farmacie Autor: Kristýna Šilhavá Vedoucí práce: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. Název diplomové práce: Základy současné antimykobakteriální léčby Tato diplomová práce má v teoretické části za cíl shrnout informace týkající se mykobakterií, mykobakteriálních infekcí, a především jejich léčby. Infekce způsobené mykobakteriemi jsou rozšířené po celém světě a každoročně se jimi nakazí velká část populace. Nejčastěji se jedná o plicní formy, ale zasažen může být prakticky jakýkoliv orgán lidského těla. Jedná se o nemoci léčitelné, léčí se kombinacemi antimykobakteriálních léčiv, avšak v současné době stále narůstá počet případů s lékově rezistentními formami mykobakteriálních onemocnění, a proto je kladen důraz na vývoj a zkoušení nových léčiv, kterými by bylo možné tyto odolné formy nemocí v budoucnu léčit. Experimentální část je pak věnována testování nově syntetizovaných antimykobakteriálních sloučenin, které probíhalo pomocí mikrodiluční bujónové metody na 5 kmenech rodu Mycobacterium (M. smegmatis, M. aurum, M. avium, M. kansasii a M. tuberculosis H37Ra). Výsledky testování jsou interpretovány a vyhodnocovány z hlediska vztahu chemické struktury látek a jejich účinnosti. Sloučeniny...
|
|
|
Rezistence mykobakterií vůči současně používaným antimykobakteriálním léčivům
Lanková, Markéta ; Janďourek, Ondřej (vedoucí práce) ; Konečná, Klára (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Farmacie Kandidát: Markéta Lanková Školitel: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. Název diplomové práce: Rezistence mykobakterií vůči současně používaným antimykobakteriálním léčivům Klíčová slova: Mykobakterie, Mykobakeriózy, Rezistence, Antimykobakteriální léčiva, Mikrodiluční bujonová metoda, Minimální inhibiční koncentrace Úspěšná léčba mykobakteriálních onemocnění je v současné době často konfrontována s klesajícím účinkem antituberkulotik a dalších antimikrobních látek, které se v terapii mykobakteriálních onemocnění často používají. Cílem teoretické části práce bylo zaměřit se na komplexní zhodnocení problematiky rezistence vůči současným terapeutikům, která se v boji proti odolným mykobakteriálním kmenům používají, dále shrnout základní charakteristiku rodu Mycobacterium, věnovat se rezistentní TBC i NTM a u jednotlivých terapeutik popsat dosud známé mechanismy účinku a rezistence, které jsou spolu často provázány. Výskyt vysoce rezistentních mykobakteriálních kmenů neustále zvyšuje riziko vzniku a šíření závažných, život ohrožujících infekcí. Mechanismy vzniku rezistence vyplývají buď z přirozených vlastností buňky, nebo se postupně rozvíjí na základě vnějších stimulů, což je častější...
|
|
|
Sloučeniny přírodního původu aktivní vůči mykobakteriím (rešerše)
Kunáková, Martina ; Krátký, Martin (vedoucí práce) ; Vinšová, Jarmila (oponent)
Hlavnou témou bakalárskej práce sú zlúčeniny vyizolované z prírodných zdrojov, ktoré výrazným spôsobom prispievajú k nalezeniu nových liečebných metód v mnohých medicínskych problémoch. Cieľom práce, bolo zamerať sa konkrétne na také zlúčeniny, ktoré preukázali značnú antimykobakteriálnu aktivitu voči patogénom z rodu Mycobacterium, a to hlavne voči M. tuberculosis. V teoretickej časti sa upriamuje pozornosť na samotný rod Mycobacterium a jeho základnú charakteristiku. Okrem toho, sa práca zamerala aj na konkrétne druhy spôsobujúce netuberkulózne formy ochorenia a aj na tie, ktoré stoja za prepuknutím tuberkulózy v ľudskom organizme. Poslednou kapitolou teoretickej časti je samotná tuberkulóza a jej stručný popis spolu s liečbou a problematikou, ktorá sa počas liečby preukazuje vo forme rezistencie. V nasledujúcej časti sú už popísané konkrétne zlúčeniny, ktoré majú antimykobakteriálny účinok a majú potenciál k výrobe nových liečív. Kľúčové slová: aldehydy, alkaloidy, antituberkulotiká, esenciálne oleje, Mycobacterium tuberculosis, mykobaktérie, naftochinóny, rezistencia, sinice, steroidné hormony, terpény, triterpény, tuberkulóza, zlúčeniny prírodného pôvodu
|
|
|
In vitro screening potenciálních antimykobakteriálně účinných sloučenin na rychle rostoucích kmenech rodu Mycobacterium
Židková, Lenka ; Janďourek, Ondřej (vedoucí práce) ; Jílek, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Odborný pracovník v laboratorních metodách Kandidát: Bc. Lenka Lyčková Školitel: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. Název diplomové práce: In vitro screening potenciálních antimykobakteriálně účinných sloučenin na rychle rostoucích kmenech rodu Mycobacterium Cílem této práce je zjištění účinnosti nových sloučenin pro možnou budoucí léčbu onemocnění tuberkulózou. Pro zjištění minimální inhibiční koncentrace sloučenin byla použita mikrodiluční bujónová metoda s již ověřeným postupem na kmenech Mycobacterium aurum a Mycobacterium smegmatis. V teoretické části je shrnutá epidemiologická situace posledních let s globálními trendy incidence a mortality TBC ve světě i ČR, včetně výhledových plánů na nápravu ve stanoveném časovém horizontu. Dále jsou v této práci popsány mykobakterie v hlavním zastoupení s M. tuberculosis. Onemocnění tuberkulóza - její historie, formy, diagnostika a léčba antituberkulotiky, které jsou rozděleny podle linií použití a látky nové, či ve vývoji. Experimentální část obsahuje kvalitativní i kvantitativní metody testování mykobakterií a detailněji zachycuje mikrodiluční bujónovou metodu, použitou v tomto měření. Součástí jsou testované kmeny mykobakterií a jejich základní...
|
|
|
Regulace mykobakteriální transkripce
Kafka, Vojtěch ; Krásný, Libor (vedoucí práce) ; Dostálová, Hana (oponent)
RNA polymeráza (RNAP) je enzym katalyzující syntézu RNA řetězce a uplatňuje se jako hlavní enzym transkripce. RNAP u mykobakterií je odlišná od ostatních bakteriálních RNA polymeráz. Pro svoji funkci vyžaduje speciální transkripční faktory, jako jsou RbpA nebo CarD. Zároveň se na mykobakteriální RNA polymerázu váže malá RNA (sRNA) Ms1, která reguluje množství polymerázy v buňce. V naší laboratoři byl také objeven protein MoaB2 jako nový vazebný partner interagující s mykobakteriální A (gen sigA), podjednotkou RNAP, významnou pro rozpoznání počáteční sekvence promotoru a iniciaci transkripce. Funkce MoaB2 v regulaci transkripce a genové exprese je doposud neznámá. Prvním cílem této diplomové práce je přispět k objasnění mechanismu, jakým Ms1 reguluje množství RNAP. Výsledky ukázaly, že tato regulace je na úrovni transkripce a to na úrovni ovlivnění aktivity promotorů řídících expresi rpoB-rpoC, které kódují katalytické podjenotky RNAP. Druhým cílem této práce je charakterizovat interakce MoaB2 s proteiny transkripčního aparátu. Výsledky potvrdily interakci MoaB2 se A a k této interakci není potřebná ani RNAP ani transkripční faktory RbpA a CarD. Role N-terminální domény A pro interakci s MoaB2 nebyla prozatím potvrzena. Shrnuto, tato práce významně přispívá k našemu pochopení mykobakteriálního...
|
|
|
Patogeneze infekčního onemocnění způsobeného bakterií Mycobacterium tuberculosis
Doležalová, Klára ; Janďourek, Ondřej (vedoucí práce) ; Kovařík, Miroslav (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní program: Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví Autor: Bc. Klára Doležalová Vedoucí diplomové práce: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. Název diplomové práce: Patogeneze infekčního onemocnění způsobeného bakterií Mycobacterium tuberculosis Teoretická část této diplomové práce se zabývá tuberkulózou, kdy je hlavní část zaměřena právě na patogenezi tohoto onemocnění. Tuberkulóza představuje vysoce nakažlivou nemoc vedoucí k celkovému vyčerpání organismu. Za hlavního původce tuberkulózy je považována bakterie Mycobacterium tuberculosis, která se do dýchacích cest dostává formou kapének při kontaktu s nakaženým a vede k tvorbě granulomů. Pro tuberkulózu je typická tvorba granulomů převážně s kaseózní nekrózou. Důležitá je správná diagnostika onemocnění a vhodně zvolená léčba. Léčba spočívá v dlouhodobém podávání kombinace antituberkulotik. Nežádoucí komplikací při léčbě je vznik rezistence, ať už na jedno či více antituberkulotik. Experimentální část se věnuje testování antimykobakteriální aktivity potenciálních antituberkulotik. Při testování antimykobakteriální aktivity byla použita mikrodiluční bujónová metoda, díky níž byla zjištěna minimální inhibiční koncentrace, tj. nejnižší...
|
|
|
Mycobacterium tuberculosis - stavba a funkce buněčné stěny
Kukrálová, Simona ; Janďourek, Ondřej (vedoucí práce) ; Jílek, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví Uchazeč: Bc. Simona Kukrálová Školitel: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. Název diplomové práce: Mycobacterium tuberculosis - stavba a funkce buněčné stěny Mycobacterium tuberculosis je intracelulárním patogenem způsobujícím onemocnění zvané tuberkulóza, které stále spadá spolu s jinými vybranými onemocněními do hlavních příčin úmrtnosti na světě. Odhaduje se, že více jak milion lidí ročně tomuto onemocnění podlehne. Pozoruhodná stavba buněčné stěny mykobakterií má velký vliv na samotnou léčbu tuberkulózy společně se stále vyšším výskytem multirezistentních a extenzivně rezistentních kmenů především u Mycobacterium tuberculosis. Výzkumu mykobakterií je věnována velká pozornost. Snaha o nalezení nových sloučenin s antimykobakteriálním účinkem působících na jednotlivé komponenty buněčné stěny, nejlépe na buněčnou stěnu jakožto celek, je dnes stále aktuální a je součástí různých programů na národní i nadnárodní úrovni. Tato diplomová práce v teoretické části shrnuje současné poznatky o mykobakteriích s důrazem na buněčnou stěnu, epidemiologii tuberkulózy a možnosti terapie tohoto infekčního onemocnění. V experimentální části se zabývá...
|
|
|
Tvorba biofilmu Mycobacterium smegmatis na skleněných a zirkoniových kuličkách-proteomová studie
Sitařová, Barbora ; Weiser, Jaroslav (vedoucí práce) ; Zikánová, Blanka (oponent)
Tvorba biofilmů Mycobacterium smegmatis na skleněných a zirkoniových mikrokuličkách - proteomová studie Tvorba biofilmů je univerzální strategie bakterií pro přežití, tvorbou biofilmu bakterie získávají řadu výhod oproti planktonním buňkám. Přibližně 99% světové bakteriální populace se nachází ve formě biofilmů. Existence mikrobiálních biofilmů má pro lidstvo pozitivní i negativní dopad. Biofilmy předurčují úspěšnost patogena zvýšenou rezistencí vůči antibiotikům a imunitní reakci hostitelského organismu. Mykobakterie, které mají schopnost vytvářet biofilmy na různých povších se liší od ostatních bakterií unikátní stavbou buněčné stěny. Ta poskytuje bakterii vysokou odolnost vůči fyzikálnímu a chemickému poškození. To je jeden z důvodů proč je Mycobacterium tuberculosis považováno za velmi potentního patogena. Studium mykobakteriálních biofilmů je motivováno snahou zdokonalit a nalézt nové léčebné postupy. Tato práce je zaměřena na morfologickou a proteomickou srovnávací analýzu biofilmů získaných kultivací Mycobacterium smegmatis na povrchu skleněných a silica- zirkoniových mikrokuliček, biofilmu na povrchu média a planktonicky žijící kultury. Pro analýzu plovoucího biofilmu jsme vytvořili techniku přípravy preparátu umožňující pozorování v SEM. Ukázali jsme, že plovoucí biofilm vzniká ze shluků...
|
|
|
Ser/Thr proteinkinázy u mykobakterií
Borovcová, Taťána ; Doubravová, Linda (vedoucí práce) ; Konopásek, Ivo (oponent)
Mycobacterium tuberculosis kóduje 11 Ser/Thr proteinkináz. Tyto proteinkinázy jsou strukturně příbuzné eukaryotickým proteinkinázám. Fosfoproteom obsahuje stovky proteinů fosforylovaných na Ser/Thr zbytcích, které ovlivňují všechny aspekty biologie buňky, což podporuje kritickou roli fosforylace na regulaci fyziologie. Důležitou roli na regulaci mají zejména proteinkinázy PknA, PknB, PknG a PknL, tyto proteinkinázy se vyskytují u všech druhů mykobakterií. Pro M. tuberculosis jsou však esenciální pouze PknA a PknB, které regulují tvar buňky, skrze regulaci syntézy buněčné stěny, a buněčné dělení. Další důležitou proteinkinázou je PknG, která ač není esenciální pro růst, je nezbytná pro virulenci, jelikož podporuje přežití patogenu uvnitř makrofágů hostitele. Ser/Thr proteinkinázy proto představují zajímavý cíl pro výzkum inhibitorů využitelných pro léčbu tuberkulózy.
|
host ::
RSS.