|
|
Updating XML data
Mikuš, Tomáš ; Pokorný, Jaroslav (vedoucí práce) ; Holubová, Irena (oponent)
Aktualizácia XML dát je veľmi široká oblasť, ktorá musí riešiť niekoľko neľahkých problémov. Od návrhu jazyka s dostatočnou vyjadrovacou silou až po úložisko XML dát schopné zmeny aplikovať. Spôsobov ako sa s nimi vysporiadať je niekoľko. Z tohoto pohľadu je práca veľmi úzko špecializovaná len na jazyk XQuery. Teda jeho rozšírenie pre aktualizácie, pre ktoré bolo doporučenie, konzorciom W3C, zverejnené len nedávno. Ďalšou špecializáciou tejto práce je zameranie sa len na XML dáta uložené v objektovorelačnej databáze, s tým, že úložisko bude vynucovať validitu dokumentov voči schéme popísanej v jazyku XML Schema. Táto požiadavka v kombinácií s možnosťou dáta v úložisku aktualizovať, kladie na úložisko protichodné požiadavky. V práci je navrhnutý jazyk, ktorý vychádza z jazyka XQuery, navrhnuté a implementované vyhodnocovanie aktualizačných požiadaviek tohoto jazyka nad úložiskom a popis a implementácia samotného úložiska v objektovorelačnej databáze.
|
|
|
Možnosti a význam dlouhodobé kultivace embryonálních buněk různých živočišných druhů
Houdek, Zbyněk ; Vožeh, František (vedoucí práce) ; Bártová, Eva (oponent) ; Pokorný, Jaroslav (oponent)
Embryonální buňky uvnitř blastocysty, které se dále dělí a diferencují v buňky všech tkání organismu se nazývají embryonální kmenové (ES) buňky. Využití lidských ES buněk formou transplantací je jednou z možných cest regenerativní medicíny. Předložená práce zahrnuje studium 2 různých linií myších pluripotentních buněk - embryonálních karcinomových buněk (EC) P19 a ES buněk linie D3. Buňky jsme kultivovali v základním kultivačním médiu s fetálním bovinním sérem (FBS) a navíc u ES buněk s leukemickým inhibičním faktorem (LIF). Tyto složky zajišťují jejich pluripotenci a sebeobnovu. Následovala jejich neurodiferenciace změnou kultivačního média, bez FBS a u ES buněk i bez LIF. Naopak do média byla přidávána k indukci neurodiferenciace retinová kyselina (RA) a u ES buněk byla navíc zařazena kultivace embryoidních tělísek (EBs). Pluripotence a neurodiferenciace buněk byla ověřena molekulárně-biologickými metodami, kterými byly zjištěny u obou linií nediferencovaných buněk markery pluripotence a po jejich neurodiferenciaci přítomnost neuronálních markerů. Následovaly transplantace, při nichž byly myší EC P19 buňky trvale transfekované genem pro zeleně fluoreskující protein (GFP) aplikovány do zdravého mozečku myší typu wild (WT) a postiženého mozečku myší typu Lurcher (Lc). Byly použity nediferencované buňky...
|
|
|
Fuzzy databáze založená na E-R schématu
Plachý, Milan ; Pokorný, Jaroslav (vedoucí práce) ; Kopecký, Michal (oponent)
Tento text je určen především zájemcům o oblast fuzzy logiky a její aplikaci v rámci relačních databází. Věnuje se návrhu fuzzyfikované relační databáze a samotné implementaci některé z možností. Text je rozdělen na dvě části: teoretické aspekty fuzzyfikace a samotnou implementační část. Rozšíření databáze je zvoleno na základě fuzzy E-R modelu, aby bylo možné co nejlépe specifikovat požadavky reálného světa. Dále popisuje stávající řešení v rámci různých úrovní fuzzyfikace (fuzzy množiny, FSQL). Součástí práce je i návrh a implementace jednoduchého programu pro dotazování nad fuzzyfikovanou databází. Práce by dále měla sloužit jako návod při návrhu a vytvoření konkrétního řešení.
|
|
|
Robot Localization
Obdržálek, David ; Pokorný, Jaroslav (vedoucí práce) ; Borovac, Branislav A. (oponent) ; Gottscheber, Achim (oponent)
Název práce: Lokalizace robotů Autor: RNDr. David Obdržálek Katedra: Katedra softwarového inženýrství Vedoucí práce: Prof. RNDr. Jaroslav Pokorný, CSs., Katedra softwarového inženýrství Abstrakt: Lokalizace je v robotice jednou z nejdůležitějších oblastí základní podpory pro úspěšné plnění úkolů robotů. Tato práce uvádí přehled některých lokalizačních metod, které jsou dále použity v praktické implementaci na reálných robotech. Pro implementaci byl také vybrán a konkretizován mechanismus Monte Carlo lokalizace (MCL), který představuje velmi úspěšnou pravděpodobnostní metodu pro lokalizaci robota i v situacích, kdy údaje získané ze senzorů nejsou zcela v souladu s realitou. Vzniklý lokalizační mechanismus byl úspěšně nasazen na několika robotech. Dále práce uvádí způsob, jak použít jednoduchý a chybami zatížený přijímač GPS signálu pro úspěšnou lokalizaci robota na grafem zadané mapě. Klíčová slova: robotika, lokalizace, GPS, Monte Carlo lokalizace
|
|
|
Analýza a problémy Top-K dotazu nad relační databází
Čech, Martin ; Pokorný, Jaroslav (vedoucí práce) ; Eckhardt, Alan (oponent)
Kvůli zvýšení kapacit úložných zařízení a rychlosti počítačových sítí v posledních letech roste potřeba efektivně třídit a prohledávat data. Výsledky dotazů o tísících záznamech pro uživatele často bývají velmi nepřehledné. Pro uživatele může být v takové situaci mnohem výhodnější přístup, kdy definuje omezení na data (filtr) a ohodnocení záznamů (priorita), přičemž ho zajímá pouze několik nejlepších výsledných záznamů. Tato práce se zabývá problematikou tzv. top-k dotazů, rozšířením relační algebry o nové operátory a jejich implementací v databázovém systému. Zaměřuje se přitom zejména na optimalizaci operací spojení a třídění. Součástí práce je implementace a srovnání některých top-k algoritmů v samostatné .NET knihovně NRank.
|
|
|
Methods for effective querying of RDF data
Dokulil, Jiří ; Pokorný, Jaroslav (vedoucí práce) ; Svátek, Vojtěch (oponent) ; Benczúr, András (oponent)
RDF je jedním ze základních stavebních kamenů sémantického webu. Je to nízkoúrovňový formát, který lze pouít pro vývoj sémantických aplikací. Schopnost položit a efektivně vyhodnotit dotaz je při tvorbě těchto aplikací nezbytnou podmínkou. Tato práce přistupuje k problému dotazování nad RDF daty ze tří stran. Za prvé, popisuje nástroj pro vizualizaci RDF dat, který umožňuje vývojářům získat lepší představu o struktuře a obsahu dat. Za druhé, práce popisuje rozšíření jazyka XQuery, které nám umožnilo přidat do něj možnost zpracování RDF dat. Hlavní myšlenkou je zavedení záznamů jakožto nového druhu hodnot. Posledním aspektem zahrnutým v této práci je otázka efektivního vyhodnocení dotazů. Za tímto účelem jsme navrhli platformu Bobox, která výrazně zjednodušuje vývoj aplikací pro paralelní zpracování rozsáhlých dat a podporuje kódovou i datovou paralelizaci.
|
|
|
Vylepšení víceproudé komprese
Unger, Lukáš ; Žemlička, Michal (vedoucí práce) ; Pokorný, Jaroslav (oponent)
Víceproudá komprese je založena na transformaci, která se výrazně liší od ostatních transformací běžně používaných pro kompresi dat. Diplomová práce se zaměřuje na použití této metody pro kompresi textových souborů v přirozeném jazyce. Cílem práce je nalézt vhodné způsoby předzpracování textu, umožňující Víceproudé kompresi dosáhnout lepších kompresních poměrů, a dále se tato práce zaměřuje na nalezení nejvhodnějších způsobů kódování jednotlivých proudů. Praktickou částí práce je implementace některých transformačních algoritmů do projektu XBW.
|
|
|
Conceptual Modeling for XML
Nečaský, Martin ; Pokorný, Jaroslav (vedoucí práce) ; Krátký, Michal (oponent) ; Thalheim, Bernhardt (oponent)
XML is a popular format for data representation. As the amount of data represented in XML grows, it is necessary to concentrate on the process of modeling XML schemes of the XML representations. However, modeling the XML schemes on the level f XML schema languages, such as XML Schema, has some drawbacks. A natural idea to improve this situation is to model the XML schemes rst on the conceptual level. It is motivated by the world of relational databases where we also start modeling the data fi rst on the conceptual level. In this thesis we focus on conceptual modeling for XML. We start with a motivating example to point out to several problems that can arise when using only XML schema languages for modeling XML schemes. We discuss how modeling the data rst on the conceptual level can help. We also show that conceptual modeling for XML has some speci cs that should be taken into account by a conceptual model for XML. Mainly, we show that it is necessary to separate the conceptual modeling process to two parts. First, we need to model the data independently of its representation in XML. Second, we need to model how the data is represented in di erent types of XML documents. In the next step, we analyze in detail existing approaches to conceptual modeling for XML and show their limitations. In the main part of...
|
|
|
Retinoid regulation of target gene transcription and antitumor activity of retinoid related molecules
Raška, Ivan ; Broulík, Petr (vedoucí práce) ; Kostrouch, Zdeněk (oponent) ; Pokorný, Jaroslav (oponent)
Nuclear Retinoic Acid (RA) Receptors (RARs) activate gene expression through dynamic interactions with coregulators in coordination with the ligand and phosphorylation processes. In the first part of this work, we showed that during RA-dependent activation of the RARq isotype, the pi 60 coactivator pCIP/ACTR/AIВ-1 /RAC-3/TRAM-1 /SRC-3 was phosphorylated by p38MAPK. SRC-3 phosphorylation was correlated to an initial facilitation of RARa-target genes activation, via the control of the dynamics of the interactions of the coactivator with RARa. Then phosphorylation inhibited transcription via promoting the degradation of SRC-3. In line with this, inhibition of p38MAPK markedly enhanced RARa-mediated transcription and RA-dependent induction of cell differentiation. SRC-3 phosphorylation and degradation occurred only within the context of RARa complexes, suggesting that the RAR isotype defined a phosphorylation code through dictating the accessibility of the coactivator to p38MAPK. We proposed a model in which RARa transcriptional activity was regulated by SRC-3 through coordinated events that are fine- tuned by RA and p38MAPK. The retinoid related molecules (RRMs), ST1926 and CD437, are promising anti-cancer agents. In the second part of this work, we compared the RAR trans-activating properties of the two RRMs...
|
|
|
Vliv transplantace tkáně mozečku a fyzické aktivity na schopnost prostorové orientace u mutantních myší typu Lurcher
Cendelín, Jan ; Vožeh, František (vedoucí práce) ; Mareš, Jan (oponent) ; Pokorný, Jaroslav (oponent)
Mutantní myši typu Lurcher jsou modelem olivocerebelární degenerace. Jedná se o heterozygoty nesoucí mutaci genu pro 52 podjednotku glutamátového receptoru. Porucha receptoru vyvolává excitotoxickou apoptózu Purkyňových buněk, jejichž zánik vede k sekundárnímu úbytku granulárních buněk mozečku a neuronů dolní olivy. Mutanti Lurcher trpí ataxií a poruchou prostorového učení a orientace. Cílem práce bylo posoudit vliv transplantace embryonální mozečkové tkáně a nucené fyzické aktivity i jejich kombinace na schopnost prostorové orientace u mutantních myší typu Lurcher a sledovat přežívání mozečkového transplantátu u dospělých a mladých mutantních myší Lurcher a dospělých myší typu wild. Pro sledování přežívání transplantátu jsme použili dospělé myši typu wild a mladé a dospělé myši typu Lurcher kmene B6CBA. Ke zkoumání vlivu transplantace a nucené aktivity na schopnost prostorové orientace jsme použili dospělé a mladé myši Lurcher téhož kmene. Transplantát získaný z myších embryí bez mutace typu Lurcher byl aplikován do oblasti mozečku příjemce ve formě solidních kousků tkáně. Kontrolním zvířatům bylo aplikováno samotné vehikulum. Nucená fyzická aktivita spočívala v opakovaném tréninku na rotarodu. Prostorová orientace byla testována v Morrisově bludišti 9 týdnů po operaci. Histologické vyšetření přítomnosti...
|
host ::
RSS.