|
|
Záchrana genetické diverzity borovice blatky (Pinus uncinata subsp. uliginosa) subendemitu České republiky‚ v centru jejího areálu kombinovanou metodou biomonitorignu‚ kontrolovaného opylení a mikropropagace
Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, Brno ; Výzkumný ústav lesního hospodářství a myslivosti, v.v.i., Jíloviště-Strnady ; Výzkumný ústav Silva Taroucy pro krajinu a okrasné zahradnictví, v.v.i., Průhonice ; Vlašínová, Helena ; Havel, Ladislav ; Souček, Jiří ; Kaňák, Jan ; Janík, David ; Král, Kamil ; Hort, Libor ; Vrška, Tomáš ; Pospíšková, Markéta ; Businský, Roman ; Vejsadová, Hana
Cílem projektu je vhodným managementem ochránit a posílit cenný genofond ohrožené borovice blatky v České republice o geneticky čisté potomstvo. Analýzou DNA ověřit genetickou čistotu reprezentativních jedinců vybraných podle fenotypu pro kontrolované opylení. Získané geneticky čisté osivo použít jako výchozí materiál pro reprodukci borovice blatky v in vitro a ex vitro podmínkách. V roce 2007 byly řešeny tyto úkoly: 1. Základní terénní měření vybraného jádrového území PR Borkovická blata. 2. Provedení asanačních zásahů na uvedené lokalitě, odstranění vybraných fertilních jedinců Pinus sylvestris. 3. Analýza prostorové struktury stromového patra. 4. Zajištění fyzikálních, výživových a růstově regulačních podmínek indukce in vitro regenerace v metodických pokusech z osiva Arboreta Sofronka. 5. Metodické pokusy pro optimalizaci postupu izolace DNA.
|
|
|
Genetická diverzita ohrožených druhů ryb – nezbytný základ efektivní ochrany biodiverzity
Ústav živočišné fysiologie a genetiky AV ČR, v.v.i., Liběchov ; Ústav biologie obratlovců AV ČR, v.v.i., Brno ; Lusk, Stanislav
Hlavním cílem projektu je identifikace vnitrodruhové genetické diverzity ohrožených druhů mihulí a ryb v ČR (2 druhy mihulí a 20 druhů ryb). Výsledky získané v rámci řešení projektu jednoznačně prokázaly, že dosud nerespektovaná „vnitrodruhová“ nebo "genetická" diverzita je nesmírně cenný fenomén, který má vysokou hodnotu a je nezbytné realizovat opatření, které zásadním způsobem sníží rizika jeho narušení a devastace, v krajním případě zamezí jeho zániku. Získané výsledky nastolují i některé problémy. Jednak je to problém ochrany vnitrodruhové diverzity u druhů, které nejsou posuzovány jako ohrožené, a které nejsou z hlediska legislativního předmětem ochrany. Jako příklad lze uvést situaci u hrouzka obecného. S tím souvisí další problém, tj. kdy poznatky o genetické diverzitě vedou k tomu, že místo jednoho druhu, který je předmětem ochrany, determinujeme několik druhů, jak je tomu např. u hrouzka běloploutvého. Popis výsledků řešení a prezentační výstupy výsledků řešení projektu.
|
|
| |
|
| |
|
|
Záchrana genetické diverzity borovice blatky (Pinus uncinata subsp
Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně ; Výzkumný ústav lesního hospodářství a myslivosti, v.v.i., Jíloviště-Strnady ; Výzkumný ústav Silva Taroucy pro krajinu a okrasné zahradnictví, v.v.i., Průhonice ; Vlašínová, Helena ; Havel, Ladislav ; Souček, Jiří ; Kaňák, Jan ; Unar, Pavel ; Janík, David ; Král, Kamil ; Unar, Pavel ; Hort, Libor ; Vrška, Tomáš ; Kochánková, Jana ; Lukášová, Miroslava ; Businský, Roman ; Vejsadová, Hana
Cílem projektu je vhodným managementem ochránit a posílit cenný genofond ohrožené borovice blatky v České republice o geneticky čisté potomstvo. Analýzou DNA ověřit genetickou čistotu reprezentativních jedinců vybraných podle fenotypu pro kontrolované opylení. Získané geneticky čisté osivo použít jako výchozí materiál pro reprodukci borovice blatky v in vitro a ex vitro podmínkách. Byla sledována věková struktura stromového patra zaměřeného jádrového území PR Borkovická blata. Byla vybrána další série kvalitních starších genofondových stromů.
|
|
| |
|
|
Fylogeografie a genetická variabilita \kur{Diuraphis noxia} (\kur{Aphididae})
PAŠÍKOVSKÝ, Jiří
Podstatou práce byl výzkum genetické variability přírodních populací Diuraphis noxia (Aphididae) pomocí mikrosatelitních markerů a markerů pro EPIC-PCR. Prvním cílem bylo zavedení metody pro mikrosatelitní lokusy a její optimalizace Diuraphis noxia. Poté následovalo zavedení metody EPIC-PCR a její optimalizace pro Diuraphis noxia. Poté následovala samotná pilotní studie, ve které byli analyzováni jedinci ze 47 lokalit z celého světa. Pomocí mikrosatelitních markerů byla potvrzena očekávaná variabilita mezi jednotlivými populacemi i uvnitř populací. Metodou EPIC-PCR byla zjištěna největší genetická variabilita mezi Chile a Alžírskem za použití markeru pro cytochrom C. Tyto poznatky lze dále využit ke komplexní studii Diuraphis noxia.
|
|
|
Genetická diverzita populací lipana (Thymallus thymallus L.) v České republice odvozená z mikrosatelitových markerů
Papoušek, Ivo ; Halačka, Karel ; Kohout, Jan ; Šlechta, Vlastimil ; Vetešník, Lukáš ; Mendel, Jan
Lipan patří mezi nejhodnotnější druhy lososových vod České republiky. Genetická diverzita dvanácti populací lipana ze všech tří povodí České republiky byla zhodnocena pomocí dvou multiplexních analýz deseti mikrosatelitových lokusů. Byly zjištěny alelové frekvence a testovány genotypové frekvence na odchylku od Hardy-Weinbergovy rovnováhy. Vztahy mezi jednotlivými populacemi byly zhodnoceny faktoriální korespondenční analýzou a analýzou hlavních koordinát. Analýza multilokusových mikrosatelitových genotypů ze tří úmoří České republiky prokázala, že v českých populacích lipana existuje významná genetická variabilita. Nicméně tato variabilita nemá žádnou geografickou strukturu, jedinci z jednotlivých úmoří netvoří oddělené skupiny. Zdá se, že původní genetická struktura českých populací lipana byla již ztracena v důsledku uniformizace umělým hospodařením.
|
|
|
Populační a genetická struktura pstruha obecného a lipana podhorního jako základ úspěšného rybářského obhospodařování
Halačka, Karel ; Papoušek, Ivo ; Kohout, Jan ; Vetešník, Lukáš ; Lusk, Stanislav ; Mendel, Jan ; Šlechta, Vlastimil
Cílem práce bylo poznání dynamiky populací lososovitých ryb. Pozornost byla zaměřena zejména na genetickou diverzitu populací pstruha obecného a lipana, dále pak na vybrané morfologické znaky (struktura pokožky). Genetické analýzy pomocí D-loop a cytochromu b ukázaly extrémní uniformitu našich populací v rámci všech třech úmořích. Vlivem antropogenních zásahů (umělé reprodukce spojená s převozy násad či generačních ryb) byl zcela narušen výsledek přirozené diverzifikace vedoucí ke vzniku místních, daným podmínkám přizpůsobených subpopulací (naprostá většina jedinců byla jednotného (atlantského) holotypu). Srovnávací studie zabývající se strukturou a dynamikou pokožky pstruha obecného, duhového, sivena amerického a lipana ukázala výrazné rozdíly zejména v zastoupení sekrečních buněk. Jejich nižší podíl v lipana může souviset citlivostí k zaplísnění v povýtěrovém období.
|
|
|
Rybí osídlení a genetická diverzita populace hrouzka obecného z Divoké Orlice u Kostelce nad Orlicí
Mendel, Jan ; Lusková, Věra ; Lusk, Stanislav ; Halačka, Karel
Bylo zkoumáno rybí osídlení dvou úseků (ř.km 46,7 a 49,1) Divoké Orlice u Kostelce nad Orlicí. Vedle druhů charakteristických pro lososové vody – pstruh obecný, lipan podhorní, střevle potoční, vranka obecná tam byly zastoupeny i druhy charakteristické pro rybí společenstvo parmového typu – parma obecná, jelec tloušť, jelec proudník, hrouzek obecný. Byl zjištěn i výskyt mihule potoční. Celková abundace byla 4.294 a 6.612 kusů, biomasa 363,8 a 509,7 kg v přepočtu na 1 ha vodní plochy. Analýza alozymů ukázala, že genetická diverzita tamní populace hrouzka obecného je průměrná ve srovnání s jinými zkoumanými populacemi v ČR a SR. Aplikace RAPD metody prokázala výskyt dvou identifikačních márkerů pro jedince ze zkoumané populace. Genetická analýza mtDNA poskytla jedinečný haplotyp, kterým se jedinci ze zkoumané populace odlišovali od jedinců z jiných zkoumaných populací v ČR a SR.
|
host ::
RSS.