|
Využití kometového testu pro stanovení poškození DNA v průběhu protinádorové chemoterapie.
Voříšková, Jana ; Kovařík, Miroslav (vedoucí práce) ; Pávek, Petr (oponent)
Ve své práci jsem se zabývala měřením poškození DNA v lymfocytech izolovaných z periferní lidské krve během chemoterapeutické léčby. Pacientům s diagnózou bronchogenního karcinomu byla podávána kombinace derivátů platiny (cis- platina nebo karboplatina) a dalších chemoterapeutických látek (gemcitabin, paclitaxel nebo vinorelbin). Celá chemoterapie probíhá ve 4 cyklech. My jsme měřili poškození DNA během 1. a 3. cyklu a 3 týdny po posledním absolvovaném cyklu chemoterapie. Detekci poškození DNA jsme prováděli metodou comet assay pro její spolehlivost a přesnost. Lymfocyty byly izolovány z plné krve pomocí média LSM Lymphocyte a poté byla provedena alkalická verze kometového testu. Hodnotili jsme vznik jednořetězcových zlomů (SSB) a tvorbu křížových vazeb (ICL). Pro detekci křížových vazeb byly lymfocyty inkubovány v přítomnosti 200 µM styrenoxidu (SO). Inkubace periferních lidských lymfocytů s 200 µM SO vede k tvorbě zlomů v DNA a ke vzniku komet. Pokud jsou v DNA přítomné křížové vazby, alkalické rozplétání je blokováno a dojde ke snížení hodnoty % DNA v ohonu (% tail DNA). Komety byly poté barveny ethidium bromidem a analyzovány softwarem LUCIA Comet Assay. Počet jednořetězcových zlomů v DNA byl před započetím chemoterapie poměrně nízký, ihned po zahájení léčby však byl patrný nárůst tohoto typu...
|
|
Měření finanční nákazy pomocí CAViaR metody: Aplikace na Evropu
Tomanová, Petra ; Zouhar, Jan (vedoucí práce) ; Formánek, Tomáš (oponent)
Cílem této diplomové práce je zkoumat, zda došlo ke změnám v závislostech mezi výnosy akciových indexů evropských zemí v obdobích krize oproti klidnému období, a zda jsou tyto změny asymetrické. Použitý přístup je založen na podmíněné pravděpodobnosti, že náhodná proměnná spadne pod určitý kvantil zatímco další náhodné proměnné také spadnou pod odpovídající kvantily. V čase měnící se podmíněné kvantily jsou modelovány Conditional Autoregressive Value at Risk via Regression Quantiles (CAViaR) metodou. Kromě jednorozměrných podmíněných autoregresních modelů je uvažováno i jejich vektorové rozšíření. Ve druhém kroku jsou následně odhadnuty podmíněné pravděpodobnosti pomocí OLS regrese. Model je zobecněn pro účely měření závislostí mezi více než dvěma časovými řadami najednou a související problém dimenzionality je diskutován pro daná data. Dále je model rozšířen tak, aby umožnil zkoumat, jak rozdělení výnosů jedné země ovlivňuje rozdělení výnosů v ostatních uvažovaných zemí se zvoleným zpožděním. Výsledky dokumentují významné prohloubení závislostí mezi výnosy akciových indexů evropských zemí pro takzvané medvědí trhy během krizí mezi roky 1990 a 2015. Přidání kontrolní proměnné pro dny s vysokou volatilitou do modelu nemá velký vliv na výsledky. Pro účely srovnání jsou v práci uvedeny výsledky pro země Latinské Ameriky.
|
|
New Integral Formulae in Hypercomplex Analysis
Sikora, Martin ; Souček, Vladimír (vedoucí práce) ; Krýsl, Svatopluk (oponent) ; Vanžura, Jiří (oponent)
Název práce: Nové integrální formule v hyperkomplexní analýze Autor: Mgr. Martin Sikora Katedra (ústav): Matematický ústav Univerzity Karlovy Vedoucí diplomové práce: prof. RNDr. Vladimír Souček, DrSc., MÚ UK e-mail vedoucího: soucek@karlin.mff.cuni.cz Abstrakt: Diracova rovnice pro funkce s hodnotami v Cliffordově algebře na Minkowského prostoru sudé dimenze může být chápána jako hyperbolický systém parciálních diferenciálních rovnic. Ukážeme jak zrekonstruovat řešení z počátečních dat zadaných na horním listu hyperboloidu. Odvodíme inte- grální formuli, která vyjadřuje hodnotu funkce ve zvoleném bodě jako integrál přes kompaktní cykl zadaný průnikem nulového kužele s horním listem hyper- boloidu v Minkowského prostoru. Zajímáme se taktéž o ultra-hyperbolický případ, kdy Diracova rovnice dává ultra-hyperbolický systém parciálních diferenciálních rovnic. Dokážeme rovněž obdobu Cauchyovy formule druhého řádu pro holomorfní funkce s hodnotami v (n−1)-vektorech. Tato formule re- produkuje hodnoty funkce uvnitř omezené oblasti v 2n-dimenzionálním kom- plexním prostoru prostřednictvím integrace přes charakteristickou hranici této oblasti. Klíčová slova: Diracova rovnice, Cliffordova algebra, integrální formule, charakteristická hranice, Minkowského prostor, ultra-hyperbolický prostor 1
|
|
Workforce Optimisation
Pacinda, Štefan ; Barták, Roman (vedoucí práce) ; Klusáček, Dalibor (oponent)
Název práce: Optimalizace pracovních sil Autor: Štefan Pacinda Katedra / Ústav: Katedra teoretické informatiky a matematické logiky Vedoucí diplomové práce: doc. RNDr. Roman Barták Ph.D., KTIML Abstrakt: Optimalizace pracovních sil se zabývá udržováním produktivity pracovní síly například v nemocnicích, či dopravních společnostech. Zahrnuje problém rozhodování o nutnosti použití jednotlivých dovedností v každém okamžiku, stejně jako rozhodování o množství vyžadovaného personálu. Po těchto rozhodnutí následuje řešení problému alokování určitých zaměstnanců ke směnám za současného plnění požadavků na dovednosti ale i jiných omezení odvozených z na příklad právních regulací, odborových dohod a vlastních preferencí. Tato práce se zabývá optimalizací pracovních sil, tedy optimálním nasazením personálu na směny za účelem pokrytí požadavků na zdroje, které se mění v čase. V této práci je řešený problém detailně rozebrán, popsán a namodelován jako problém celočíselného programování. Jsou zde prezentovány detaily o implementaci a vyčerpávající analýza a experimenty s instancí problém z praxe za účelem prokázání naplnění cílů, které si práce klade. Klíčová slova: Rostering, Optimalizace pracovních sil, Rozvrhování směn
|
|
Použití metaheuristik pro řešení okružních dopravních úloh
Novák, Vít ; Fábry, Jan (vedoucí práce) ; Melechovský, Jan (oponent)
Okružní dopravní problémy jsou jedny z nejvýznamnějších představitelů skupiny klasických optimalizačních kombinatorických problémů. Úloha obchodního cestujícího a úlohy z ní odvozené zajímají matematiky a analytiky od doby, kdy byly prvně formulovány, a urychlují vývoj nových metod a přístupů, které později nacházejí uplatnění v celé řadě dalších reálných problémů. Tato práce si klade za cíl demonstrovat užitečnost a flexibilitu ukázaných metaheuristických metod. Výstupy jsou v případě, že je to možné, porovnávány s výstupy alternativních algoritmů nebo známými optimálními řešeními. K dosažení tohoto cíle byla vytvořena VBA aplikace. Výsledky experimentů a fungování aplikace je popsáno v druhé polovině této práce. Čtenáři by tak měl být poskytnut dostatečný návod, jakou cestu se při řešeních podobných úloh lze vydat.
|
|
New Electrochemical Methods for Determination of Nitro and Oxo Derivatives of Fluorene
Vyskočil, Vlastimil ; Barek, Jiří (vedoucí práce) ; Ludvík, Jiří (oponent) ; Heyrovský, Michal (oponent)
4. Závěr Tato disertační práce představuje příspěvek k vývoji nových analytických metod aplikovatelných na environmentální a biologické vzorky. Současný stav poznání týkající se vzniku, výskytu a biologické aktivity fluorenu a jeho nitro- a oxoderivátů byl shrnut v kapitole 1. Následná experimentální práce byla zaměřena na použití nových přístupů v detekci studovaných látek. Důraz byl kladen především na nitrofluoreny, fluorenon a nitrofluorenony, jmenovitě na 2-nitrofluoren, 2,7-dinitrofluoren, 9-fluorenon, 2-nitro-9-fluorenon a 2,7-dinitro-9-fluorenon a možnosti jejich stanovení pomocí polarografických a voltametrických metod. Byla zkoumána interakce dsDNA s 2-nitrofluorenem a s 2,7- dinitrofluorenem na DNA/SPCPE a bylo pozorováno poškození DNA za podmínek přímé interakce DNA s analytem, za laboratorní teploty, a poškození bází DNA za podmínek elektrogenerování nestabilních nitroradikálů s krátkou dobou života při teplotě lidského těla. Získané výsledky lze shrnout následovně: ● Moderní polarografické a voltametrické metody na rtuťových elektrodách, vyvinuté pro stanovení stopových množství 9-fluorenonu a 2,7-dinitro-9- fluorenonu (a obecně dalších NPAH) v koncentračních rozmezích 2×10-8 až 1×10-5 mol L-1 (pro 9-fluorenon) a 2×10-9 až 1×10-5 mol L-1 (pro 2,7- dinitro-9-fluorenon), poskytují citlivou,...
|
|
Macrocyclic chelators for metal-radionuclides
Málková, Michaela ; Hermann, Petr (vedoucí práce) ; Příhoda, Jiří (oponent) ; Komárek, Pavel (oponent)
4 Souhrn v češtině Byly studovány komplexotvorné vlastnosti strukturně příbuzných makrocyklických polyazachelatantů s různými kovovými ionty vhodnými pro medicínské použití. Předkládaná práce se zabývá studiem ligandů formálně odvozených od H4dota (1,4,7,10- tetraazacyklododekan-1,4,7,10-tetraoctová kyselina) nahrazením jedné nebo čtyř karboxylových skupin funkční skupinou odvozenou od kyselin fosforu. Byly studovány především tři nové ligandy: H4do3apABn (10-{[(4-aminobenzyl)hydroxyfosforyl]methyl}- 1,4,7,10-tetraazacyklododekan-1,4,7-trioctová kyselina), H5do3apPrA (10-{[(2-karboxyethyl)hydroxyfosforyl]methyl}- 1,4,7,10-tetraazacyckododekan-1,4,7-trioctová kyselina), H4dotpOEt [1,4,7,10-tetraazacyklododekan-1,4,7,10- tetrakis(monoethylester kyseliny methylfosfonové)] Dále jsou prezentována nová data o konstantách stability komplexů H5do3ap, tj. [10-(dihydroxyfosforyl)methyl]-1,4,7,10- tetraazacyklododekan-1,4,7-trioctové kyseliny, s přechodnými kovy. Získané výsledky ukazují, že všechny studované ligandy tvoří s dvoj/trojmocnými ionty kovů komplexy o dostatečné termodynamické stabilitě a kinetické inertnosti pro případné použití v medicíně. Rychlost komplexace monofosfonátových a monofosfinátových ligandů je srovnatelná s rychlostí komplexace H4dota. Rychlost komplexace výrazně závisí na struktuře...
|
| |
|
Plně diferenční kmitočtové filtry v proudovém módu
Kubík, Milan ; Koton, Jaroslav (oponent) ; Jeřábek, Jan (vedoucí práce)
Bakalářská práce je zaměřena na návrh plně diferenčních kmitočtových filtrů v proudovém módu. V první části práce je seznámení s problematikou kmitočtových filtrů a vytvářením diferenčních struktur v proudovém módu. Poté následuje seznámení s použitými aktivními prvky - digitálně řiditelný proudový zesilovač DCCA (Digitally Controlled Current Amplifier) a vícevýstupový proudový sledovač MO-CF (Multiple Output Current Follower). Klíčovým bodem je vlastní návrh difrenčních filtrů, který je rozdělen na tři části. V první části návrhu jsou vytvářeny filtry za pomoci předloh z programu FilterPro. Vznikla obvodová řešení umožňující realizaci kmitočtových filtrů typu dolní propust, horní propust a pásmová propust. V další části jsou dva návrhy filtrů odvozených z autonomních obvodů pracující jako dolní a horní propust. V poslední části jsou navrženy dva typy integračních článků – ztrátový a bezeztrátový. Spojením těchto obvodů vzniklo kaskádní zapojení realizující tři filtrační funkce a to pásmovou propust 1, pásmovou propust 2 a dolní propust. Na závěr je zhodnocení celé práce a vytvořených struktur filtrů.
|
|
Syntéza konjugátů oligonukleotidů s molekulami zvyšujícími pevnost vazby na řetězce nukleových kyselin
Bernardová, Simona ; Miletín, Miroslav (vedoucí práce) ; Opletalová, Veronika (oponent)
Distamycin A, netropsin, Hoechst 33258 a další jsou látky, které se váží do malého žlábku dvoušroubovice DNA na sekvence bohaté na A·T páry bází. Tato diplomová práce se zabývá syntézou látek strukturně odvozených od modelové molekuly distamycinu A a jejich konjugací s oligonukleotidy. Syntéza látek odvozených od distamycinu A byla prováděna metodami peptidové syntézy v roztoku a na pevné fázi. K připravení požadovaných látek bylo provedeno množství dílčích reakcí, které byly úspěšné pouze částečně. Nejperspektivnější se zdá být námi připravená molekula tert-butyl-5-(5-(2-(2-(2-(2- azidoethoxy)ethoxy)ethoxy)ethylkarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrol-3-ylkarbamoyl)-1-methyl- 1H-pyrol-3-yl-karbamátu.
|
host ::
