|
| |
|
|
Bezbuněčná exprese proteinových knihoven z různých repertoárů aminokyselin
Neuwirthová, Tereza ; Hlouchová, Klára (vedoucí práce) ; Míšek, Jiří (oponent)
Tato bakalá ská práce je úvodem do projektu zabývajícího se vlivem evoluce genetického kódu, tedy i v ase se m nícího repertoáru aminokyselin v proteinech, na vývoj struktury a funkce bílkovin. Prvotní aminokyselinová abeceda byla z ejm pouze polovi ní velikosti abecedy sou asné a zahrnovala podle dostupných analýz okolo 10 prebioticky p ítomných aminokyselin, pocházejících z exogenních i endogenních zdroj . Obsahem této práce je mRNA transkripce a bezbun ná exprese p ti randomizovaných proteinových knihoven (obsahujících zhruba 1011 variant). Uvedené knihovny se liší svým aminokyselinovým složením a odráží tak jednotlivé p edpokládané fáze evoluce genetického kódu. Hlavním cílem tedy je p evést knihovny z DNA formy do formy protein a poskytnout tak zdroj pro purifikaci knihoven a jejich následnou biofyzikální charakterizaci (výskyt sekundární a terciární struktury) a analýzy výskytu funkce v takto navržených knihovnách. Celý výzkum by tak teoreticky mohl p isp t k zodpov zení základních otázek nejen z oboru proteinové evoluce, ale i syntetické biologie i proteinového inženýrství. Klí ová slova: Bezbun ná exprese, proteiny, evoluce genetického kódu
|
|
|
Dynamery založené na reverzibilní tvorbě hemiacetalové vazby
Nosek, Vladimír ; Drahoňovský, Dušan (vedoucí práce) ; Míšek, Jiří (oponent)
Tato diplomová práce se zabývá designem a syntézou stavebních bloků využitelných k tvorbě dynamických polymerů založených na reverzibilní tvorbě hemiacetalové vazby. Další část je zaměřena na studium tvorby hemiacetalů mezi vícefunkčními alkoholy a trifluormethylketony pomocí NMR spektroskopie. Klíčová slova: konstituční dynamická chemie, hemiacetaly, trifluormethylketony, dioly a polyoly
|
|
|
Příprava a využití α-alkyliden-β-laktamů ve zkrížených metatezích
Kretschmer, Jan ; Veselý, Jan (vedoucí práce) ; Míšek, Jiří (oponent)
Tato diplomová práce se zabývá přípravou α-alkyliden-β-laktamů a jejich využitím ve zkřížených metatezích za použití katalyzátorů přechodných kovů. Pro přípravu α-alkyliden-β- laktamů byla využita jednak Kinugasova reakce a též cesta vycházející z produktů Morita- Baylis-Hillmanovy reakce. Připravené α-alkyliden-β-laktamy byly využity při reakcích s alifatickými alkeny a pro studium elektronického vlivu substituentů na laktamech při zkřížených metatezích. V této práci byla též provedena formální totální syntéza léku Ezetimib za využití metatetického kroku.
|
|
| |
|
|
Syntéza sulfanylaminoderivátů cyklodextrinů a počítačová simulace tvorby jejich komplexů
Provazníková, Adéla ; Jindřich, Jindřich (vedoucí práce) ; Míšek, Jiří (oponent)
Tato diplomová práce pojednává o syntéze série 6I -N-monosubstituovaných β-CD, jejichž substituentem je různě dlouhý lineární řetězec obsahující disulfidickou vazbu a zakončený aminoskupinou. Celá série byla úspěšně připravena prostřednictvím nukleofilní substituce toluensulfonylové skupiny tosyl-β-CD diaminovou spojkou. V případě vazby nejkratší spojky (cystaminu) byl derivát připraven ve výtěžku 35 %. Při syntéze derivátů substituovaných spojkami odvozenými od di-, tri- a tetraethylenglyku byla výtěžnost dvojnásobná a pohybovala se mezi 66 a 85 %. Všechny tři spojky byly připraveny pomocí standardních chemických přeměn. Pro izolaci výslených derivátů byly vyvinuty optimální soustavy založené na n-butanolu. Abychom lépe pochopili chování cílových derivátů v roztoku, byly provedeny jejich molekulárně dynamické (MD) simulace. Látky byly připravovány pro použití při vývoji fluorescenčních chemosezorů. Za stejným účelem byla studována inkluze vybraných organických molekul do kavity β-CD pomocí molekulové dynamiky a optimalizována metoda pro MD výpočet jejich relativních vazebných energií. Přestože se ani po optimalizaci metoda nezdá dostatečně přesná, výsledky odpovídají řádem i znaménkem experimentálním hodnotám.
|
|
|
On Azahelicenes: Synthesis, Resolution, Properties and Applications
Míšek, Jiří
Mgr. Jiří Míšek Abstrakt disertační práce Byla vyvinuta nová, modulární cesta k syntéze azahelicenů. Za použití [2+2+2] cykrotrimerizace vhodných triynů byly připraveny azaheliceny 83, 84 a 85 (Schéma 1). Schéma 1. Azaheliceny 84 a 85 byly dostatečně konfiguračně stabilní, což umožnilo rozdělelní jednotlivých enantiomerů pomocí krystalizace diastereoizomerní soli a chirálního HPLC. Racemizační bariéry obou aza[6]helicenů 84 a 85 byly určeny. Tato měření potvrdila, že oba hexacyklické deriváty 84 a 85 jsou dostatečně stabilní, aby mohly být použity v asymetrických transformacích a jako chirální senzory. Schopnost aza[6]helicenů 84 a 85 tvořit chirální komplexy s přechodnými kovy byla prokázána přípravou a rentgenostrukturní analýzou příslušných stříbrných komplexů. Dále byla pomocí hmotnostní spektrometrie ukázána schopnost chirálního seberozpoznávání u aza[6]helicenu 84. Bazicita azahelicenů byla určena jako protonové afinity v plynné fázi u derivátů 84 a 85 a jako disociační konstanty v roztoku u derivátů 83, 84 a 85. V závěru práce bylo ukázáno první použití azahelicenu v asymetrické katalýze. Opticky čistý aza[6]helicen (M)-(-)-85 byl úspěšně použit při asymetrické kinetické rezoluci racemického 1-fenylethanolu. N N N N 83 84 85
|
|
|
Charakterizace organozlatných sloučenin
Shcherbachenko, Elena ; Roithová, Jana (vedoucí práce) ; Míšek, Jiří (oponent)
Geminálně diaurované komplexy jsou důležitými reakčními intermediáty při některých reakcích katalýzovaných zlatem, a proto jsou v současné době předmětem výzkumu. Cílem předkládané bakalářské práce bylo studium vlivu elektronové struktury aryl ligandu na stabilitu komplexu s dvouelektronovou třícentrickou vazbou Au2C. Série geminálně diaurovaných komplexů byla získaná reakcí zlatného komplexu [IPrAu(NCMe)]BF4 (IPr = 1,3-Bis(2,6-di-iso-propylfenyl)imidazol-2-yliden) s arylboronovými kyselinami ArB(OH)2 nesoucími různé substituenty na benzenovém jádře (Ar = para-O2NC6H4, para-NCC6H4, para-ClC6H4, C6H5, para-H3CC6H4, para-H3COC6H4, meta-O2NC6H4, meta-NCC6H4, meta- H3CC6H4, ortho-O2NC6H4, ortho-NCC6H4, ortho-H3CC6H4). Hmotnostní spektrometrie (MS) byla hlavní experimentální metodou této práce. Prahové energie (AE) fragmentace geminálně diaurovaných komplexů byly odhadnuté pomocí metod MS/MS. Získané energie byly vyneseny do grafu oproti odpovídajícím Hammettovým σ-konstantám pro posouzení korelace elektronové struktury ligandu a stability vazby Au2C. Bylo zjištěno, že struktura zlatného komplexu odvozeného od kyanofenylboronové kyseliny neodpovídá geminálně diaurovanému komplexu, ale C,N-dizlatnému komplexu a neobsahuje vazbu Au2C. Klíčová slova: zlatná katalýza, aurofilicita, arylboronové kyseliny,...
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.