|
| |
|
|
Proteomická identifikace skořápkových plodů ve vybraných druzích cukroví
Kadeřábková, Lucie ; Kučková, Štěpánka (vedoucí práce) ; Kolář, Karel (oponent)
Předkládaná diplomová práce se věnuje proteomické identifikaci vybraných skořápkových plodů na příkladu svátečního cukroví. Za účelem identifikace přítomných plodů ve vzorcích byly využity dva typy hmotnostní spektrometrie, jejichž výsledky mohou nabídnout vzájemné doplnění i srovnání. Teoretická část se v počátku zaměřuje na nutriční specifika skořápkových plodů. Její významný díl se poté zabývá širokou otázkou falšování a autentizace potravin, kdy je důraz kladen na skořápkové plody. Teoretickou část zakončuje pohled na odbornost tématu didaktickou optikou a jeho případné možnosti zařazení do výuky chemie či dalších oborů. Předmětem analýzy bylo jedenáct druhů skořápkových plodů po vystavení teplot, simulující pečení cukroví, a sedm druhů vánočního cukroví (šest komerčních výrobků a jeden druh "neznámého" cukroví, kde nebylo dopředu známo, z jakého skořápkového plodu bylo připraveno). Využita byla hmotnostní spektrometrie typu MALDI-TOF s následným vyhodnocením pomocí objektově-relačního databázového systému PostgreSQL, a to s cílem získat charakteristické hodnoty m/z pro každý plod po teplotním ošetření a následně porovnat s hodnotami m/z nalezenými ve vzorcích vánočního cukroví. Pomocí nalezených hodnot bylo cílem identifikovat přítomnost deklarovaných plodů a určit, jaký plod byl použit v...
|
|
| |
|
|
Proteomické rozlišení obilnin
Nyškovská, Kristýna ; Kučková, Štěpánka (vedoucí práce) ; Kolář, Karel (oponent)
Tato bakalářská práce se zabývá proteomickým rozlišením obilovin (amarantu, ječmene setého, kukuřice seté, merlíku čilského (quinoi), čiroku zrnového, ovsa setého, pšenice seté, pohanky seté, prosa setého, rýže seté, špaldy, žita setého). Obiloviny jsou velkým množství zastoupeny v lidské potravě a jsou jedním z hlavních zdrojů bílkovin a sacharidů. Cílem bylo zjistit, zda je možné mezi sebou rozlišit jednotlivé typy obilovin a porovnat rozdíl mezi obilovinami a pseudoobilovinami na základě bílkovinového složení jejich zrn pomocí hmotnostně- spektrometrické metody MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization - Time of Flight). Teoretická část se zabývá seznámením s obilninami, pseudoobilninami a jejich nutričními hodnotami, využitím a analytickou metodou MALDI-TOF MS. Experimentální část se zabývá sběrem jednotlivých druhů obilovin a jejich následnou analýzou. Vzorky byly mechanicky zpracovány a štěpeny za pomoci enzymu trypsinu. Naštěpené peptidy byly změřeny metodou MALDI-TOF MS a získaná spektra byla následně zpracována pomocí programu mMass a PostgreSQL (verze 14.2). Tímto způsobem byly zjištěny specifické hodnoty m/z, které jsou charakteristické pro každou analyzovanou obilovinu. Z těchto hodnot byla sestavena tabulka, která přehledně uvádí tyto charakteristické hodnoty. Díky těmto...
|
|
| |
|
|
Reakce bílkovin s kyselinou dusičnou jako námět pro badatelsky orientovanou výuku
Hanušová, Barbora ; Kolář, Karel (vedoucí práce) ; Bílek, Martin (oponent)
Ve výuce má svoji nezastupitelnou roli experiment. Objektem zkoumání této práce je interakce kyseliny dusičné s bílkovinami. Vlastní reakce je pro žáky a studenty motivující a inspirující díky pozorovatelným změnám, ke kterým dochází. Průběh reakce je spojený s kladením si několika otázek. Aby na ně student dokázal odpovědět, musí objasnit podstatu reakcí. K tomu postačí bioorganický model založený na jednoduchých reakcích prováděných na tečkovací destičce. Hlavní motivací pro tuto činnost byla snaha obohatit stávající spektrum jednoduchých výukových experimentů z organické chemie a biochemie o experiment využívající badatelské metody v souvislosti s bioorganickými modely. KLÍČOVÁ SLOVA kyselina dusičná, bílkoviny, xantoproteinová reakce, školní pokus
|
|
|
Analýza výsledků měření propustnosti betonu pro vzduch a vodu jako podklad pro odhad jeho aktuální trvanlivosti
Kadlecová, Zlata ; Kolář, Karel (oponent) ; Pavlík,, Vladimír (oponent) ; Adámek, Jiří (oponent) ; Anton, Ondřej (vedoucí práce)
Propustností povrchové vrstvy betonu se zabývá mnoho vědeckých pracovišť po celém světě, neboť povrchová vrstva je nejslabším článkem celé betonové konstrukce. Tato disertační práce navázala na problematiku celosvětově řešenou a rozšíří obzor problematiky propustnosti povrchové vrstvy. Cílem této práce bylo vytvořit přepočtové vztahy mezi metodami pro hodnocení propustnosti povrchových vrstev betonu a umožnit tak orientační hodnocení povrchové vrstvy betonu v závislosti na aktuální vlhkosti. V praxi se nejčastěji vyskytují betony, jejichž povrchová hmotnostní vlhkost je rovna 3 %, proto byla tato výše vlhkosti zvolena jako referenční. Pro srovnávání byly použity: přístroj TPT (Torrent Permeability Tester), přístroj GWT (Germanns Water Permeability Tester) a metody ISAT (Initial Surface Absorption Test). Dílčím cílem bylo vytvořit jednotné metodiky pro měření s přístroji.
|
|
|
Návrh a syntéza potenciálního modulátoru orexinového receptoru OX2R s využitím in silico metod
Kárová, Barbora ; Doležal, Rafael (vedoucí práce) ; Kolář, Karel (oponent)
Orexinergní nervový systém je komplex neuronů zaujímající v centrální nervové soustavě podstatnou roli v řízení spánkového cyklu a příjmu potravy. Orexinové neurony situované v laterálním hypotalamu produkují orexinové neuropeptidy A a B, které poté interagují s dvěma orexinovými receptory. Snížená produkce těchto neuropeptidů v důsledku ztráty orexinových neuronů je příčinou specifického a vzácného onemocnění narkolepsie, které je v současné chvíli nevyléčitelné. Podstatným milníkem z hlediska výzkumu a vývoje léčiv proti narkolepsii je studie vědecké skupiny Takashiho Nagahary (2015), která syntetizovala prvního nepeptidického agonistu orexinového 2 receptoru (OX2R), a stala se tak vzorem pro racionální design nových agonistů s vyšší šancí dostat se do klinické praxe. Tato bakalářská práce je věnována návrhu a přípravě nového agonisty OX2R s 2-deoxystreptaminovou substrukturou a navazuje na Nagaharův klíčový výzkum prostřednictvím racionálního designu a počítačového screeningu. Teoretická část je věnována literární rešerši této problematiky, Praktická část práce se zabývá návrhem struktur 11 ligandů s využitím in silico a medicinálně chemických metod. Pro finálního kandidáta s optimálními fyzikálně-chemickými vlastnostmi byla poté navržena organická syntéza postavena na retrosyntetické analýze....
|
|
|
Modely interakce enzym-substrát ve výuce chemie
Mužík, Jakub ; Kolář, Karel (vedoucí práce) ; Bílek, Martin (oponent)
Diplomová práce se zabývá aplikací úloh z biochemie rozšířených o materiální a multimediální model ve výuce chemie na střední a vysoké škole. Hlavním cílem bylo zjistit, zda navržené úlohy splňují kritéria pro zařazení do výuky biochemie v rámci laboratorních cvičení ve středoškolských seminářích a vysokoškolských laboratorních cvičeních. Pro analýzu byl použit kvalitativní výzkum metodou polostrukturovaného rozhovoru, inventáře vnitřní motivace a dotazníku vnímání činnosti. Práce je rozdělena na teoretickou a praktickou část. Teoretická část obsahuje informace o enzymech, jejich aktivním centru a dnešních pohledech na jejich funkci. Dále je zde popsán vznik "guest-host" interakce mezi acidobazickými indikátory a makrocyklickými sloučeninami-cyklodextriny, které slouží jako modely pro demonstraci interakce mezi substrátem a aktivním místem enzymu. Poslední kapitola teoretické části je věnována metodice výzkumu úloh na střední a vysoké škole. V praktické části jsou popsány úlohy včetně experimentálně zjištěných dat pro jejich realizaci a veškeré pomůcky nutné k jejich provedení. Dále je v ní popsána tvorba a použití materiálního a multimediálního modelu. V neposlední řadě jsou v textu výsledky a postupy pedagogického výzkumu zaměřujícího se na kvalitu navrhovaných úloh a jejich možného zařazení do...
|
|
|
Komplexní chemická analýza krevních nátěrů
Matěcha, Tadeáš ; Kučková, Štěpánka (vedoucí práce) ; Kolář, Karel (oponent)
Tato diplomová práce se zabývá komplexní chemickou analýzou krevních nátěrů pomocí hmotnostní spektrometrie a infračervené spektroskopie. Teoretická část je zaměřena nejprve na historii používání, vlastnosti a receptury krevních nátěrů, posléze na jejich samotné složení, které je rozděleno na proteinovou a neproteinovou složku, dále na vybrané analytické metody užívané k jejich identifikaci. V experimentální části je vyhodnoceno a diskutováno 41 modelových vzorků a 2 vzorky reálné. K identifikaci proteinové složky byla u všech vzorků použita metoda kapalinové chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií typu nano-LC-ESI-Q-TOF MS. Určení množstevního zastoupení jednotlivých typů proteinových přísad v krevních nátěrech bylo provedeno na základě počtu nalezených peptidů pocházejících z proteinů typických pro konkrétní proteinové přísady. Dále se podařilo identifikovat aminokyselinové sekvence, díky kterým je možné určit živočišný původ použité krve. Metodou infračervené spektroskopie, konkrétně technikou zeslabeného úplného odrazu a difúzní reflektance, byla zjištěna neproteinová složka všech vzorků a experimentálně byla diskutována kvantitativní analýza na základě změny intenzit naměřených spekter. Zvláštní kapitola se věnuje identifikaci klihu a navrženému postupu při identifikaci žluči. Na...
|
host ::
RSS.