|
|
Uspořádání genů v genomech eukaryot: analýza s využitím sekvenačních genových expresních dat
Divina, Petr ; Forejt, Jiří (vedoucí práce) ; Pačes, Jan (oponent) ; Mokrejš, Martin (oponent)
ZÁVĚRY 61 6. ZÁVĚRY 6.1. Analýza genů exprimovaných v myším varleti a jejich uspořádání v genomu Pomocí expresního profilování metodou SAGE (sériová analýza genové exprese) byl vytvořen katalog genů exprimovaných ve varleti dospělých myší. Byly identifikovány poziční klastry genů na chromosomech obsahující geny s preferenční expresí ve varleti. Tyto klastry obsahovaly signifikantně vyšší počet genů než v náhodně vygenerovaných genomech. Geny specificky exprimované v somatických buňkách myšího varlete byly signifikantně obohacené na chromosomu X, což podporuje teorii o hromadění genů preferenčně exprimovaných v samčích tkáních na chromosomu X. Geny exprimované z chromosomu X byly ochuzené v transkriptomu celého myšího varlete, což je v souladu s představou o inaktivaci chromosomu X během prvního meiotického dělení. Byla vytvořena veřejně přístupná internetová databáze Mouse SAGE Site, která shromažďuje expresní data z myších tkání a buněčných liniích vytvořená pomocí metody SAGE. 6.2. Genový obsah chromosomu Z kura domácího Chromosom Z kura domácího byl signifikantně obohacený o geny preferenčně exprimované v samčím mozku. ZÁVĚRY 62 Geny s preferenční expresí v samičím mozku vykazovaly náznak ochuzení na chromosomu Z. Podobně, geny specificky exprimované ve vaječnících byly na chromosomu Z...
|
|
| |
|
|
Vliv PRDM9 histon H3K4 tri-metyl transferázy na chromozomální sterilitu
Svatoňová, Martina ; Forejt, Jiří (vedoucí práce) ; Kuthan, Martin (oponent)
Vliv PRDM9 histon H3K4 tri-metyl transferázy na chromozomální sterilitu Gen Prdm9 kóduje meiotickou metyl-transferázu umožňující metylaci lysinu 4 na histonu H3. Metylace H3K4 je spojována s aktivací genové exprese. Stejný gen byl naší laboratoří identifikován jako gen hybridní sterility myší, Hst1. Jeho další funkcí zjištěnou později je regulace "hot-spots" meiotické rekombinace u myší a u člověka. Cílem diplomové práce bylo využitím transgenních myší ověřit vliv nadpočetných kopií genu Prdm9 na chromozomální sterilitu indukovanou chromozomální translokací T43H. Bylo zjištěno, že samotný gen Prdm9 na pozorovanou změnu nemá vliv, ale byl potvrzen významný poziční efekt u translokace T43H. Translokace zděděná od otce způsobuje zhoršení parametrů fertility oproti té pocházející od matky
|
|
|
Genetics and Genomics of Hybrid Sterility
Bhattacharyya, Tanmoy ; Forejt, Jiří (vedoucí práce) ; Pravenec, Michal (oponent) ; Macholán, Miloš (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Doktorský studijní program: Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie Abstrakt Genetika a genomika hybridní sterility Mgr. Tanmoy Bhattacharyya Školitel: Prof. MUDr. Jiří Forejt, DrSc. Praha 2013 Abstrakt Samčí hybridní sterilita je překážkou v přenosu genů mezi příbuznými druhy, což je významným předpokladem pro vznik nových druhů. F1 hybridní samci vzniklí křížením samice PWD/Ph (poddruhu Mus m. musculus) a samce C57BL/6J nebo B6 (Mus m. domesticus) mají azoospermii a jsou sterilní (PB6F1), zatímco hybridi z recipročního (B6PF1) křížení jsou částečně fertilní. Nadměrně převládající vliv chromosomu (Chr) X na sterilitu samčích hybridů představuje jev, který je při vzniku nových druhů široce zastoupen. V této studii jsme mapovali dva fenotypově odlišné lokusy pro hybridní sterilitu Hstx1 a Hstx2 do společné oblasti o délce 4,7 Mb na Chr X. Analýza meiotické profáze I odhalila u sterilních samců PB6F1 meiotický blok ve střední fázi pozdního pachytenu a testem TUNEL byla prokázána apoptóza blokovaných spermatocytů. U sterilních samců byla v 95 % pachytenních spermatocytů vizualizací protilátkami anti SYCP1, HORMAD2 a SYCP3 zjistěna asynapse jednoho či více autosomů. Fosforylovaná forma histonu H2AFX, normálně pozorovaná pouze v pohlavním tělísku...
|
|
|
Geny pro hybridní sterilitu myší: mapování epistatických interakcí.
John, Václav ; Forejt, Jiří (vedoucí práce) ; Kuthan, Martin (oponent)
MOUSE HYBRID STERILITY GENES: A MAPPING OF EPISTATIC INTERACTIONS Hybrid sterility is an important postmeiotic reproductive isolation barrier. The phenotype of mouse hybrid sterility includes decreased testes weight and an absence of sperm. It occurs only in F1 males from PWD/Ph (PWD; Mus musculus domesticus) x C57BL/6J (B6, M. m. musculus) cross but not reciprocal B6 x PWD F1 males (FOREJT & IVÁNYI, 1974; FOREJT et al., 1991). Nowadays we know that the phenotype of hybrid sterility is controlled by the PWD/B6 allelic combination on chromosome 17 at Prdm9 locus is needed and by the PWD allele on chromosome X at Hstx2 locus. This combination of two loci is necessary but not sufficient obtain full sterility (MIHOLA et al., 2008; FOREJT, JIŘÍ, pers. comm.), so another genes must play role. In this experimental work I prepared the F2 cross from B6 and PWD mouse strains and I genotyped the males of F2 crosses and I carried out the QTL analysis. Extended QTL analysis was carried out with all animals carrying Prdm9PWD/B6 - Hstx2PWD allelic combination. The results showed unexpectedly low number of sterile males in F2 generation (1.90 %), and significant QTLs on chromosomes 17 (in Prdm9 loci) and X (different from Hstx2) in sperm, no other significant peak on any chromosome was found. These results indicate a more...
|
|
| |
|
|
Program otevřeného filmového vzdělávání Iniciační materiál pro zájemce o tvůrčí rozvoj filmově-výchovného programu
Forejt, Jiří ; Lipovská, Ivana (vedoucí práce) ; HENDRICH, Vladimír (oponent)
Text svým charakterem náleží do okruhu odborných prací, které se zabývají tematikou filmové výchovy a vzdělávání mladých lidí respektive širší populace. Nesnaží se o formulování čistě teoretické koncepce či strategie. Naopak. Prostřednictvím reflexe a analýzou sebraných dat pojmenovává ustanovení a vývojovou strategii unikátního vzdělávacího programu (?Program otevřeného filmového vzdělávání?), který vzniká ve spolupráci Filmové a televizní fakulty AMU (FAMU) a Národního filmového archivu (NFA). Diplomová práce zasadí projekt do rámce daného oboru, nastíní genezi vývoje vzdělávací programu, formuluje základy metodiky výuky, a nastíní další rozvoj projektu s celonárodní působností. Jedním z hlavních cílů textu je, aby posloužil jako informační zdroj dalším zájemcům z řad studentů či pedagogů FAMU, kteří by měli zájem participovat na rozvoji projektu.
|
|
|
Šťastné zítřky?
Tydlitátová, Anna ; Forejt, Jiří (vedoucí práce) ; Havas, David (oponent)
Práce se zabývá proměnou pražského Kina Ponrepo z původní promítací síně v moderní veřejnoprávní cinematéku. Popisovaný proces probíhá na pozadí strukturálních, legislativních, finančních a personálních změn, realizovaných - v posledních několika letech - v Národním filmovém archivu (NFA). Práce se proto nutně vztahuje k procesu transformace celého archivu. Zaměřuji se na období po začátku roku 2012, kdy byl do jeho čela jmenován nový ředitel, PhDr. Michal Bregant. Věnuji se především popisu provozních a personálních změn, které ovlivnily i podobu a obsah samotných aktivit kina. Zajímám se dále o rozvíjení vztahů a komunikace Kina Ponrepo s veřejností a naznačuji možnosti dalšího směřování této kulturní instituce.
|
|
|
Obnovení tvůrčího zápasu v českém hraném filmu
Forejt, Jiří ; Kallista, Jaromír (vedoucí práce) ; Lamperová, Marta (oponent)
Text je zamýšlen jako esejistická případová studie společenských a filmových souvislostí tvorby osobnosti Petra Václava. Filmografie Petra Václava bude v celku práce fungovat jako faktorgafická linka dokládající a verifikující soudy, které bude autor práce předkládat. Text se bude v několika kapitolách zabývat: "Nedostatky kritického myšlení" v českém filmovém prostředí a tedy esejistickým načrtnutím panoramatu marasmu české filmové kritiky s akcentem na osobnosti, které těmto tendencím vzdorovali, Jiřího Cieslara a kritického ducha Andreje Stankoviče; dále pak "Mechanismy banalizace autorské výpovědi" a tudíž společenskými principy, které vedou tvůrce k ústupkům v jejich autorském projevu a vyjádření. Autor se pokusí prokázat, že bulvarizace filmové kritiky přímo souvisí s konformitou tvůrců a že se vzájemně utvrují a podporují v tendencích, které nevyhovují skutečně morálně-etickým a hodnotovým nárokům na kinematografii. Výchozí premisa práce je subjektivní a jako taková praví, že tento stav není v pořádku.
|
|
|
Analýza samčí sterility způsobené T(16,17)43H chromosomální translokací
Čapková, Jana ; Homolka, David ; Ivánek, Robert ; Jansa, Petr ; Forejt, Jiří
Po některých chromosomálních přestavbách vzniká heterozygosita, která vede ke sterilitě samců. Náš model chromosomální přestavby vedoucí samčí sterilitě představuje myší T(16,17)43H chromosomální translokace. Na tomto modelu jsme studovali účinek translokace na spermatogenezu. Analyzovali jsme meiosu u heterozygotních T43/+ samců a prokázali jsme transkripčním umlčení nesynaptického autosomálního chromatinu v translokačním kvadrivalentu a následnou neschopnost transkripční inaktivace X chromosomu v pachytenním stadiu spermatogeneze.
|
host ::
RSS.