|
|
Investigation of HSP70 oligomerization by structural mass spectrometry
Melikov, Aleksandr ; Novák, Petr (vedoucí práce) ; Jeřábek, Petr (oponent)
Příbuzný protein teplotního šoku (HSC70) je 71 kDa chaperon patřící ke všudypřítomné rodině proteinů teplotního šoku 70 (Hsp70). Zástupci této proteinové rodiny jsou považováni za molekulární stroje s ATPázovou aktivitou, které usnadňují správné sbalování prostorové struktury proteinů jak za normálních, tak i za stresových podmínek (hypoxie, tepelný šok, či kolísání pH). HSC70 navíc funguje jako enzym rozbalující vrstvu triskelionu na povrchu klatrinových váčků. Další rolí HSC70 je např. zamezení agregace proteinů, asistence při maturaci polypeptidového řetězce a usnadnění transportu proteinů do organel, jako jsou endoplazmatické retikulum a mitochondrie. HSC70 se účastní směrování proteinů určených k degradaci do lysosomů a v mnoha dalších kriticky důležitých buněčných procesech spojených s homeostází proteinů. Tudíž, regulace HSC70 a jiných proteinů HSP70 je považována za velmi důležitou, obzvlášť v kontextu buněčného stresu. Na základě experimentálních pozorování byl navržen mechanismus inaktivace za pomoci oligomerizace. Dimery a trimery proteinů Hsp70 byly identifikovány jak u prokaryotických, tak u eukaryotických homologů. Byla také diskutována role proteinového kofaktoru Hsp40 ve stimulaci oligomerizaci Hsp70 do vyšších oligomerů. Tento a jiné možné modely oligomerizace "divoké" varianty...
|
|
|
Utilization of pulse labelling techniques for studying the dynamics of proteins and protein complexes
Polák, Marek ; Novák, Petr (vedoucí práce) ; Obšil, Tomáš (oponent) ; Vrbacký, Marek (oponent)
(In Czech) Hmotnostní spektrometrie (MS) se stala častou technikou pro sledování struktury a dynamiky proteinů a proteinových komplexů. I když techniky založené na MS detekci nemohou poskytovat informace s vysokým rozlišením, jako je např. rentgenová difrakce, nukleární magnetická rezonance (NMR), nebo kryo-elektronová mikroskopie (cryo-EM), jsou dobrým nástrojem z hlediska poskytování informaci ohledně dynamiky, struktury a interakcí analytů s dalšími molekulami, např. ligandy. Tato doktorská práce představuje přínos do oblasti strukturní biologie při využití kovalentního značení, tzv. rychlé fotochemické oxidace proteinů (FPOP) a oxidace singletním kyslíkem (1 O2) pro studium struktury, dynamiky a interakcí proteinů a proteinových komplexů s dvoušroubovici DNA.V první části práce byla metoda FPOP využita k studiu struktury komplexu FOXO4-DAF16, která poukázala na možnosti analýzy takového komplexu pomocí přístupů "bottom-up" a "top-down". Dále je zde představena strategie izotopové deplece pro strategii "top- down", kde je demonstrována její výhoda ve spojení s multiCASI-ECD za účelem získaní nejvyšší možné strukturní informace ohledně interakce FOXO4 s IRE. Studie ukazuje, jak mohou informace získané ze strukturní proteomiky vést k vytvoření in-silico modelů protein-DNA komplexů, jejichž...
|
|
|
Návrh edukačních materiálů pro předmět základy radiofarmacie pro vyšší odborné školy zdravotnické s oborem diplomovaný farmaceutický asistent
Novák, Pavel ; Hanušová, Jaroslava (vedoucí práce) ; Váchová, Alena (oponent)
Diplomová práce se zabývá tématem nukleární medicíny a radiofarmacie se zaměřením na vytvořením vhodných edukačních materiálů z této oblasti pro obor "diplomovaný farmaceutický asistent". Teoretická část obsahuje popis oboru farmaceutického asistenta a základní informace o nukleární medicíně. Tyto poznatky vyúsťují ve stěžejní kapitolu této práce, tedy radiofarmacii a přípravu radiofarmak. Praktická část se skládá ze dvou dotazníkových šetření. První úsek praktické části je tvořen dotazníkem zaměřením na učitele, kteří vyučují předměty se zaměřením na radiofarmacii pro obor "diplomovaný farmaceutický asistent". Druhý úsek praktické části je tvořen dotazníkem u studentů posledního ročníku zmíněného oboru. Oba tyto dotazníky mají za úkol zjistit informace o pedagogické realitě předmětů zaměřených na radiofarmacii a současně získat návrhy na zlepšení úrovně výuky pro budoucí studenty. Zde bylo zjištěno, že pouze 28,6 % dotazovaných učitelů využívá i jiné formy výuky než pouze frontální výuku. Dále byl zjištěn fakt, že žádný z 56 dotazovaných studentů nemá v plánu pracovat v laboratoři přípravy radiofarmak. Na základě těchto zjištění bylo navrženo 13 edukačních materiálů, které budou poskytnuty, jak učitelům, tak zájemcům z řad studentů, což by mělo zkvalitnit budoucí výuku, zvýšit povědomí o daném...
|
|
|
Komerční centrum Miris Garden v Chorvatsku
Uherková, Jana ; Vintr, Jan (oponent) ; Novák, Petr (vedoucí práce)
Předmětem bakalářské práce je zpracování projektové dokumentace pro stavební povolení a dokumentace pro provádění stavby, které vychází ze zadání, které bylo poskytnuto ve 3. ročníku v zimním semestru v předmětu BGA 032 – Ateliér architektonické tvorby IV. Tématem studie je návrh novostavby komerčního centra v areálu nově plánovaného dovolenkového resortu v Chorvatsku. Řešený pozemek se nachází v oblasti chorvatské Dalmácie, poblíž vesnice Stari Grad-Paklenica. V současnosti je nevyužívaný, nezastavěný a zarostlý zelení. Konceptem architektonického řešení bylo vytvořit budovu, která bude svým tvarem reagovat na svažitý terén, jenž se na řešeném pozemku nachází, a která svým vzhledem poskytne svým budoucím návštěvníkům alespoň trochu ducha a atmosféry chorvatské architektury. Toho je docíleno použitím kamenného obkladu a dřevěných stínících prvků, tedy typických materiálů této architektury. Budova nepravidelného tvaru je tvořena dvěma nadzemními podlažími. První nadzemní podlaží slouží pro stravování, komerci a sport, druhé nadzemní podlaží pro stravování, služby, administrativu a zábavu. Toto podlaží je oproti prvnímu, co se týče hloubky menší, a je zde tak vytvořena pochozí terasa, z které jsou jednotlivé jednotky přístupny. Na terase se také nachází venkovní sezení pro gastro podniky, doplněné o dřevěné pergoly s posuvným látkovým stíněním. Jedním z dominantních prvků komplexu je venkovní pobytové schodiště propojující obě podlaží. Je to prvek, který nás nejenom někam směruje, ale také prvek, který nám odkrývá pohled na moře a zapadající slunce. Při návrhu byl kladen důraz i na veřejné prostory. V předprostoru komerčního centra na severovýchodní straně je prostor členěn zelenými ostrůvky s posezením. Tyto zelené ostrůvky spolu s vodním prvkem dotváří prostor náměstíčka, nacházejícího se před budovou komerčního centra směrem k moři. V tomto prostoru nalezneme i dřevěné pergoly s posuvným látkovým stíněním, připomínající svým tvarem vlny moře, které poskytují návštěvníkům gastro podniků stín.
|
|
|
Komerční centrum Miris Garden v Chorvatsku
Hlavinková, Kateřina ; Bažant, Lukáš (oponent) ; Novák, Petr (vedoucí práce)
Předmětem bakalářské práce je zhotovení projektové dokumentace pro stavební povolení a části dokumentace pro provádění stavby na základě zadání, které bylo poskytnuto v předmětu AG032 – Ateliér architektonické tvorby IV. v zimním semestru třetího ročníku na téma veřejné stavby. Studie se zabývá návrhem novostavby komerčního centra do plánovaného resortu v Chorvatsku. Jedná se o třípodlažní budovu, která je částečně zapuštěná do terénu. Svým tvarem i umístěním co nejvíce respektuje stavební parcelu a její okolí. Objekt je složen ze tří funkčních celků. Hlavním z nich je komerční centrum, ve kterém se nachází několik prodejen, restaurací, bar, bistro a mnoho dalších provozů. Budova elipsy, která bude primárně využívána pro odpočinek a relaxaci. Posledním celkem je budova administrativy, ta slouží pouze pro zaměstnance resortu. Všechny tyto části jsou propojeny hlavní komunikací komerčního centra, kterou je výrazný dřevěný ochoz, ten je umístěn na jižní část budovy a nabízí ze všech provozů i samotného ochozu krásný výhled na moře.
|
|
|
Malá Amerika v Brně
Kalmykova, Valeriia ; Bažant, Lukáš (oponent) ; Novák, Petr (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá návrhem novostavby polyfunkčního objektu Malá Amerika v Brně a vychází z architektonické studie vypracované v rámci předmětu BGA021 - Ateliér architektonické tvorby 2 - Veřejné stavby. Předmětem této práce bylo zhotovení projektové dokumentace, skládající se z dokumentace pro stavební povolení, dokumentace pro provádění stavby a návrhu architektonického detailu. Navržená stavba se nachází v Brně poblíž historické stavby průmyslového charakteru “Malá Amerika” a budov Titania, v území vymezeném ulicemi Úzká a Nové sady. Polyfunkční objekt Malá Amerika je multifunkční stavba s kancelářemi, galerii uměni, knihovnou, restauraci, kavárnami, střešní terasami a s místy pro pořádání akci. Novostavba respektuje stávající urbanistickou i architektonickou strukturu okolní zástavby. Jedná se o pět samostatně stojících objektů vzájemně propojených podzemním parkovištěm. Hmota je složená z několika kvádrů různých výškových úrovní spojených pochozí terasou. Mezí jednotlivými objekty vznikají ulice a náměstí s mnoha zajímavými průhledy. Objekt je spojen s Malou Amerikou pochozí terasou a navržen tak, aby nezakrýval historickou budovu. Směrem k budovám Titania se jednotlivé objemy objektu zvětšují. Záměrem projektu bylo vytvořit polyfunkční objekt, který by nebyl pouze introvertní stavbou, která by měla užitek pouze ze svého dokonalého umístění a stávající městské infrastruktury, ale také přízemí plné obchodu a služeb, které by byly k dispozici všem kolemjdoucím i po skončení pracovní doby.
|
|
|
Komerční centrum Miris Garden v Chorvatsku
Olšáková, Linda ; Vintr, Jan (oponent) ; Novák, Petr (vedoucí práce)
Předmětem této bakalářské práce je zhotovení projektové dokumentace pro stavební povolení a části dokumentace pro provádění stavby na základě dříve zpracované studie v rámci předmětu BGA032 Ateliér architektonické tvorby 4 v zimním semestru 3. ročníku, zaměřeném na veřejné stavby. Tématem návrhu je objekt novostavby komerčního centra sestávající z pěti samostatných dvoupodlažních budov. Řešený pozemek se nachází ve státě Chorvatsko, na území vesnice Starigrad v Zadarské župě. Blízké okolí je nezastavěné, stavba komerčního centra je součástí plánovaného dovolenkového resortu. Konceptem architektonického řešení je co nejefektivnější využití stávajícího svažitého terénu, centrum je proto tvořeno pěti samostatně stojícími stavbami, které jsou částečně zapuštěny do terénu a kopírují tak jeho trychtýřovitý tvar. Čtyři budovy mají jednoduchý tvar kvádru, pátá stavba má obloukovitý půdorys. Záměrem je vytvoření nákupních ulic, do kterých jsou orientovány výlohy obchodního parteru a restaurací. Na fasádách ve vzhledu pohledového betonu je použito stínění z otočných dřevěných prvků a jednotlivých fixních dřevěných panelů, venkovní prostory jsou chráněny posuvným látkovým stíněním. V objektu komerčního centra se nachází pronajímatelné prostory pro maloobchod a služby, restaurační prostory, vstupní hala s recepcí a soukromé administrativní prostory včetně potřebného zázemí.
|
|
|
Komerční centrum Miris Garden v Chorvatsku
Žilková, Monika ; Doležal, Ondřej (oponent) ; Novák, Petr (vedoucí práce)
Předmětem bakalářské práce je zhotovení projektové dokumentace pro stavební povolení a části dokumentace pro provádění stavby na základě zadání, které bylo poskytnuto v předmětu BGA032 – Ateliér architektonické tvorby 4. Tématem studie je návrh novostavby komerčního centra Miris Garden v Chorvatsku u obce Starigrad. Objekt má tvořit stěžejní bod nově budovaného resortu na svažitém pobřeží Jaderského moře. Komerční centrum má zastat funkci obchodní (s vícero menšími obchůdky a gastro podniky) a v části objektu také administrativní, kde jsou k dispozici kanceláře pro vedení centra i pro nájemníky. Tři budovy tvořící jednotný celek jsou koncipovány do tvaru dvou centrických šestiúhelníků, čímž je vytvořen prostor imitující obchodní ulici. Ta pak vrcholí v náměstí s výhledem na moře. Centrum má celkem tři podlaží, která jsou ovšem zapasována do terénu tak, že v pohledu směrem k moři působí jako jednopodlažní budova, tudíž neruší výhledy okolním vilám. Novostavba bude umístěna do volné krajiny, její výstavba ani provoz tedy nebudou nikterak rušit žádné okolní obyvatele.
|
|
|
Galerie moderního umění v Brně
Knipiglová, Nina ; Doležal, Ondřej (oponent) ; Novák, Petr (vedoucí práce)
Bakalárska práca sa zameriava na návrh galerie moderného umenia, lokalizovaného v mestskej časti Brno-Stred. Pozemok, s nadmorskou výškou od 205, 200 do 207, 100 m.n.m., charakterizuje nepravidelný pôdorys. Centrálna lokalita je výhodná, avšak okolité cestné komunikácie pridávajú hlučnosť k miestnemu prostrediu. Objekt, pozostávajúci z päť podlaží s dvoma podzemnými a tromi nadzemnými úrovňami, je navrhnutý v súlade s mestským plánom pre zmiešané oblasti a s ohľadom na plánovaný okružný park. Hlavný vstup je situovaný na prvom podlaží zo západnej strany, s veľkou vstupnou halou, kaviarňou, knižnicou a kancelárskymi priestormi. Druhé a tretie podlažie sú vyhradené pre výstavné priestory, doplnené o prenajímateľné ateliérové priestory. Podzemné časti zahŕňajú dvojpodlažné garáže a zásobovacie priestory. Konceptom reaguje na okolie, zalomenie objektu kopíruje uličnú čiaru v časti Kolište a severnou fasádou je rovnobežne zarovnaný s magistrátom mesta Brno. Fasáda budovy je materialovo rozdelená.Prvé nadzemné podlažie je presklenné s bielou omietkou, zatiaľ čo ostatné nadzemné úrovne sú pokryté hliníkovými panelmi. Cieľom objektu je zapadnúť do mestského prostredia a poskytnúť priestor, ktorý podporí kultúrne a spoločenské aktivity v Brne-Stred.
|
|
|
Estimation ff the Global Root Mean Square Error of Geoid Height Calculated by Integral Transforms
Belinger, Jiří ; Pitoňák, Martin ; Trnka, Petr ; Novák, Pavel ; Šprlák, Michal
Integrální transformace funkcionálů gravitačního pole jsou definovány přes celý prostorový úhel na povrchu koule. Navzdory obrovskému a nespornému pokroku v satelitní gravimetrii a gradiometrii umožňují družicové mise zaměřené na gravitační pole přesné určení tohoto pole s prostorovým rozlišením 100 km, tj. pouze v jeho dlouhovlnné části. Na druhé straně existuje potřeba modelů gravitačního pole s vysokým rozlišením v regionálním, národním nebo kontinentálním měřítku, zejména v určování kvazigeoidu nebo geoidu. Potenciální slabinou pozemních dat je přesnost gravitačního pole v dlouhovlnné délce a omezená dostupnost kvůli několika omezením (např. pouště, jezera a velké řeky, lesy nebo nedostatek dobré vůle mezi sousedními zeměmi ke sdílení citlivých dat). Ideální scénář kombinuje pozemní a satelitní data, která se vzájemně doplňují. V příspěvku budou odvozeny a prezentovány vztahy na odhad globálních středních kvadratických chyb výšky geoidu získaných pomocí integrálních transformací. Pro praktický výpočet bude využita znalost přesnosti měřených terestrických dat a formálních chyb globálních družicových modelů tíhového pole Země.
|
host ::
RSS.