Název: Hodnocení mikrobiální diverzity antropogenních substrátů metodou využívající polymorfismu terminálních restrikčních fragmentů DNA
Překlad názvu: The evaluation of the microbial diversity in anthropogenic subtrates using a method analyzing the polymorphism of the terminal restriction fragments of DNA
Autoři: Gryndler, Milan ; Bukovská, Petra ; Sýkorová, Zuzana ; Havránková, Marie
Typ dokumentu: Metodiky
Rok: 2010
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
V této metodice popisujeme rychlou, snadnou a nepříliš nákladnou metodu vyhodnocení mikrobiální diverzity v různých typech substrátů: T-RFLP. Popisujeme principy a detailně vysvětlujeme postup práce při extrakci DNA, amplifikaci určitého úseku DNA pomocí PCR, při výběru restrikčního enzymu a restrikčním štěpení, dělení fragmentů v kapilárním sekvenátoru a rovněž diskutujeme vyhodnocení a interpretaci výsledků. In this methodology we describe a fast, easy and non-expensive method for evaluation of microbial diversity in various types of substrates: T-RFLP. We explain principles and describe in detail the workflow of DNA extraction, amplification of a particular piece of DNA in PCR, choice of restriction enzymes and the restriction digest, separation of fragments using the capillary sequencer as well as discuss the evaluation and interpretation of the results.
Klíčová slova: diversity; microorganism; t-RFLP
Číslo projektu: CEZ:AV0Z60050516 (CEP), 1M0571 (CEP)
Poskytovatel projektu: GA MŠk

Instituce: Botanický ústav AV ČR (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dokument je dostupný v příslušném ústavu Akademie věd ČR.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11104/0196116

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-156622


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Věda a výzkum > AV ČR > Botanický ústav
Analytické a metodické materiály > Metodiky