2024-12-22
00:03 |
Mapping of terrain and vegetation structure with spaceborne lidar
Moudrý, Vítězslav ; Wild, Jan (vedoucí práce) ; Homolová, Lucie (oponent) ; Kašpar, Vít (oponent)
Struktura ekosystému, zejména vertikální struktura vegetace, je jednou ze šesti základních EBV (Essential biodiversity variables) tříd a je důležitým aspektem heterogenity stanovišť, která ovlivňuje rozšíření druhů a jejich rozmanitost. Nicméně ještě relativně nedávno bylo měření struktury vegetace nesmírně pracné a sběr takových dat pro rozsáhlé oblasti byl prakticky nemožný. To se nicméně zásadně změnilo s příchodem laserové altimetrie v polovině devadesátých let minulého století. Zejména letecká laserová altimetrie zaznamenala v posledních dvaceti letech nebývalý rozmach a díky tomu máme nyní v mnoha státech světa, zejména v Evropě a Severní Americe, jedinečná data detailně reprezentující strukturu vegetace. Nicméně v méně rozvinutých státech světa, kde se nachází většina světové druhové diverzity, taková data chybí. Poslední léta naštěstí přála satelitním laserovým altimetrům, které mohou chybějící data doplnit. Konkrétně byla na oběžnou dráhu Země v roce 2018 vypuštěna dvě zařízení: ATLAS (Advanced Topographic Laser Altimeter System) na palubě satelitu ICESat-2 a GEDI (Global Ecosystem Dynamics Investigation) umístěný na mezinárodní vesmírnou stanici. Obě tato zařízení poskytují, mimo jiné, data o struktuře vegetace v globálním rozsahu, s jejichž pomocí je možné lépe pochopit rozložení...
Úplný záznam
|
2024-12-22
00:03 |
Molecular Profiling to Reveal Novel Signatures in Cancer
Matyašovská, Natália ; Palička, Vladimír (vedoucí práce) ; Fričová, Dominika (oponent) ; Matoušková, Petra (oponent)
10 Summary CZE Zatímco spolehlivé biomarkery pro personalizovanou léčbu neuroendokrinních nádorů slinivky břišní (PanNET) jsou stále omezené, transkriptomické profilování mikroRNA (miRNA) a mRNA se ukázalo jako slibné pro segregaci podtypů PanNET a předpovídání odpovědi na léčbu. Vzhledem k tomu, že miRNA jsou klíčovými posttranskripčními regulátory exprese mRNA, mohla by integrace údajů o dysregulovaných miRNA a mRNA poskytnout zásadní poznatky o molekulární patogenezi PanNEN. Cílem této studie bylo prozkoumat úlohu exprese mRNA a miRNA v molekulární patogenezi, klinické prezentaci a prognóze PanNETů ve srovnání s kontrolními skupinami bez onemocnění. Bylo provedeno sekvenování RNA za účelem identifikace rozdílně exprimovaných mRNA se zaměřením na klinicko-patologické biomarkery. Vzorky PanNET byly také rozděleny do odlišných molekulárních podtypů na základě transkriptomických profilů. Sekvenování miRNA bylo provedeno za účelem detekce rozdílně exprimovaných miRNA, které byly validovány pomocí kvantitativní PCR v reálném čase a veřejných souborů dat. Poté byla provedena integrativní analýza interakcí miRNA-mRNA s cílem odhalit regulační sítě a funkční dráhy. Výsledky odhalily významnou dysregulaci 715 upregulovaných a 702 downregulovaných genů v PanNET. Analýza drah umožnila nahlédnout do molekulárních...
Úplný záznam
|
2024-12-22
00:02 |
Forest bryophytes and microclimate
Man, Matěj ; Wild, Jan (vedoucí práce) ; Greiser, Caroline (oponent) ; Hájek, Tomáš (oponent)
Lesní mechorosty a mikroklima MGR. MATĚJ MAN Disertační práce Školitel: doc. Ing. Jan Wild PhD. Praha, 2024 Abstrakt Mechorosty, často přehlížené a zranitelné, přesto velmi důležité, hrají zásadní úlohu v terestrických ekosystémech, a to zejména v lesích. Zajišťují to�ž nepostradatelné ekosystémové služby jako například zadržování vody či koloběh živin. Jejich vysoká citlivost na vnější podmínky prostředí z nich činí ideální modelové organismy pro studium ekologických procesů v lesním podrostu. Lesy pokrývají významnou část souší naší planety, a hos� unikátní mikroklima�cké podmínky s mírnějšími výkyvy v porovnání s klimatem mimo les. Avšak naprostá většina našich poznatků o klimatu je postavena na datech z meteorologických stanic, které jsou cíleně umisťovány mimo les. To může vést ke zkreslenému porozumění působení globální změny klimatu v lesních ekosystémech. Přestože výzkumy mechorostů v kombinaci s měřeným mikroklimatem mají potenciál přinést v lesní ekologii nové poznatky, výskytová data mechorostů a měřeného mikroklimatu nejsou zpravidla dostupná. Současný rozmach levných senzorů pro měření mikroklimatu výrazně zvýšil množství terénních dat, což přineslo ve výzkumech i nové výzvy. Chybí například společný standard pro měření a výpočty mikroklima�ckých proměnných. Nedostupnost dat a chybějící metody...
Úplný záznam
|
2024-12-22
00:02 |
Charakterizace hereditární komponenty u vysoce rizikových pacientek s gynekologickými tumory
Horáčková, Klára ; Soukupová, Jana (vedoucí práce) ; Stružinská, Ivana (oponent) ; Václavíková, Radka (oponent)
Mgr. Klára Horáčková Disertační práce: Charakterizace hereditární komponenty u vysoce rizikových pacientek s gynekologickými tumory ABSTRAKT Nádory ovaria (OC) jsou celosvětově u žen zodpovědné za téměř 5 % všech úmrtí způsobených nádorovými onemocněními. Více než polovina OC je diagnostikována v pokročilých stádiích spojených s nepříznivou prognózou (s pětiletým přežitím kolem 50 %). Průměrný věk v době diagnózy se pohybuje okolo 65 let. OC je charakteristické velkým podílem hereditárních tumorů; germinální patogenní/pravděpodobně patogenní varianta (GPV) v nádorových predispozičních genech je identifikována u více než 20 % pacientek. Z těchto pacientek však můžeme vyčlenit specifickou podskupinu s diagnózou OC s časným nástupem (<30 let), u kterých nacházíme atypicky nízký podíl hereditárních forem se záchytem GPV pod 10 %, a tedy nejasnou příčinou vzniku tohoto onemocnění. Předložená disertační práce se zabývá komplexní genetickou analýzou u pacientek s OC s časným nástupem s využitím celoexomového sekvenování na úrovni jak DNA, tak i RNA doplněného o analýzu polygenního skóre rizika (PRS) a typizace lidských leukocytárních antigenů (HLA). Ve skupině 123 pacientek s diagnózou OC do 30 let věku jsme identifikovali pouze 6 (4,9 %) nosiček GPV ve známých OC predispozičních genech. Výsledky dalších...
Úplný záznam
|
2024-12-22
00:02 |
Enhancing Anti-tumor Efficacy and Improving Manufacturing of Chimeric Antigenic Receptor T Cells
Štach, Martin ; Otáhal, Pavel (vedoucí práce) ; Havránek, Ondřej (oponent) ; Kanderová, Veronika (oponent)
T-lymfocyty exprimující chimérické antigenní receptory (CAR) představují nový léčebný postup, který je obzvláště účinný proti B-lymfocytárním malignitám, a mění dosavadní paradigma léčby rakoviny. V současné době existuje několik schválených a komerčně dostupných CAR T-lymfocytárních produktů. Nicméně tato léčba je stále neúnosně finančně nákladná. Proto existuje poptávka po nahrazení obzvláště nákladných retrovirových/lenvirových vektorů levnějšími, nevirovými alternativami. Navíc se současný výzkum nadále zaměřuje na další vylepšení CAR T-lymfocytů posílením jejich protinádorových funkcí, expanze a perzistence in vivo. Kromě toho je usilováno o rozšíření spektra antigenů a nemocí proti kterým by byly CAR T lymfocyty použitelné. Tato disertační práce se zabývá výrobou CD19 specifických CAR T-lymfocytů z hlediska použitých cytokinů při kultivaci, vektoru pro genetickou modifikaci, testováním nového konstruktu CARu sekretujícího interleukin (IL)-21 a analýzou CAR T-lymfocytů od pacientů léčených produktem tisagenlecleucel. V rámci této práce byl vyvinut alternativní protokol kultivace CAR T-lymfocytů, nahrazující tradičně používaný IL-2, který způsobuje efektorovou diferenciaci T-lymfocytů. Je založen na cytokinech IL-4 a IL-7, které výrazně podporují přežívání T-lymfocytů, přidání IL-21 pak...
Úplný záznam
|
2024-12-22
00:02 |
Identity and state action - The case of the Czech Republic, Hungary and Slovakia during the European Schengen crisis
Földes, Kristián ; Karlas, Jan (vedoucí práce) ; Van Dijk, Teun Adrianus (oponent) ; Kazharski, Aliaksei (oponent)
Tato práce zkoumá politické reakce Maďarska, Slovenska a České republiky na schengenskou krizi v roce 2015. Konkrétně zkoumá, jak představitelé těchto zemí konstruovali kolektivní identitu uprchlíků a využili krizi jako příležitost k prosazení své národní suverenity. S využitím konstruktivistické perspektivy teorie mezinárodních vztahů (IR) a Kritických diskurzivních studií tato disertační práce analyzuje, jak byla krize zobrazována jako bezprostřední hrozba pro kulturní identitu a národní bezpečnost. Výzkum kombinuje kvalitativní obsahovou analýzu a kritickou diskurzní analýzu při zkoumání parlamentních debat a prohlášení premiéra s cílem odhalit narativy, které uprchlíky vykreslují jako potenciální riziko pro stabilitu národa. Tyto narativy hrály klíčovou roli při poskytování důvodů k odporu proti mechanismu přerozdělování uprchlíků v EU, systému kvót a odporu proti vlivu nadnárodních subjektů. Z výsledků výzkumu vyplývá, že političtí představitelé v Maďarsku, na Slovensku a v České republice pravidelně vykreslovali uprchlíky jako potenciální hrozbu pro národní bezpečnost, ekonomickou zátěž a kulturní výzvy. Tato diskuse nejen posilovala autoritu národa, ale také spojovala domácí publikum v opozici vůči vnějším požadavkům Evropské unie. Konkrétně vedení Maďarska využívalo silně nacionalistický...
Úplný záznam
|
2024-12-22
00:02 |
Taxonomie, morfologie a biologie velkých kubánských anolisů se zaměřením na malakofágní formy
Zahradníčková, Veronika ; Rehák, Ivan (vedoucí práce) ; Moravec, Jiří (oponent) ; Buchtová, Marcela (oponent)
Unikátní endemická skupina anolisů z Kuby- chameleolisové- se odlišuje od ostatních zástupců rodu Anolis mnoha morfologickými i behaviorálními znaky. Ač jsou to jedni z největších zástupců rodu, jedná se o málo prostudované druhy. Cílem práce bylo (v kontextu současných znalostí o taxonomii, morfologii a biologii ještěrů čeledi Dactyloidae) přispět k poznání těchto velkých druhů kubánských anolisů dříve řazených do vlastního rodu Chamaeleolis. S využitím metod komparativní morfologie, spektrofotometrie, vizuálního modelování a analýzy mtDNA jsem taxonomicky zhodnotila nashromážděný materiál těchto anolisů. Díky tomu se podařilo popsat nový druh anolise Anolis sierramaestrae sp. nov. a upozornit na další nový druh Anolis sp. (čeká na popis). Jelikož jsou chameleolisové malakofágními potravními specialisty zaměřenými na plže s ulitou, je tato anolisí skupina výborným modelem pro zkoumání souvislostí mezi preferovanou potravou a morfologií dentice, včetně postnatálních změn v její morfologii. Ukázalo se, že juvenilní dentice vykazuje znaky pravděpodobně související s malakofágií a že tyto znaky jsou mezidruhově odlišně vyjádřeny a že adultní dentice také vykazuje mezidruhové rozdíly v malakofágním přizpůsobení. To by mohlo vypovídat o rozdílných potravních nárocích. Zajímala mě i morfologie lebky a...
Úplný záznam
|
2024-12-22
00:02 |
Development of dual-(+1)-Fluorescence Correlation Spectroscopy for MonitoringProtein Oligomerization Leading to Membrane Pore Formation
Vandana, ; Šachl, Radek (vedoucí práce) ; Fišer, Radovan (oponent) ; Lunov, Oleg (oponent)
Title: Vývoj duální-(+1)-fluorescenční korelační spektroskopie pro sledování oligomerizace proteinů vedoucí k tvorbě membránových pórů Author: Vandana Department: Biofyzika, chemická a makromolekulární fyzika Supervisor: doc. RNDr. Radek Šachl, Ph.D., Tato disertační práce představuje na příkladu fibroblastového růstového faktoru 2 (FGF2) nový statistický přístup, který dokáže odlišit "funkční" oligomery vložené do membrán od "nefunkčních" proteinových agregátů spojených s membránami. Jeho použití se rozšiřuje nejen na FGF2, ale i na mnoho dalších proteinů asociovaných s membránami, které vyvolávají tvorbu membránových pórů. Princip tohoto přístupu je založen na dvoubarevné fluorescenční korelační spektroskopii (FCS) aplikované na jednotlivé obří unilamelární vezikuly (GUV). Analýzou jasu a difúzních vlastností fluorescenčně značených proteinů poskytuje zásadní poznatky o velikosti oligomerů proteinů, difúzních koeficientech, povrchových koncentracích a propustnosti membrán na volně stojících částech membrán GUVs. Pracuje v širokém rozsahu povrchových koncentrací proteinů, což umožňuje hlubší zkoumání oligomerizace proteinů. Metoda dual-(+1)-FCS, speciálně přizpůsobená pro studium membránových proteinů, vyniká schopností komplexně analyzovat více parametrů v jediném experimentu. Celkově naše...
Úplný záznam
|
2024-12-22
00:02 |
Farmakokinetický profil a výskyt nežádoucích účinků levobupivacainu během kontinuálníkaudální epidurální analgezie u novorozených.
Šípek, Jan ; Mixa, Vladimír (vedoucí práce) ; Rygl, Michal (oponent) ; Cvachovec, Karel (oponent)
Farmakokinetický profil a výskyt nežádoucích účinků levobupivacainu během kontinuální kaudální epidurální analgezie u novorozených. Abstrakt Hlavním cílem předložené práce je ověření bezpečnosti levobupivacainu (lokální anestetikum, LVB) během dlouhodobého podávání formou kaudální epidurální analgezie (c-CELA) u novorozených. V tomto věku je management bolesti komplikovaný a výše zmiňovaná technika je účinná a umožňuje snížit dávku opioidů a tím i jejich nežádoucí účinky. Nezralost metabolických drah a snížené orgánové funkce s sebou přináší obavy z možné kumulace a systémové toxicity lokálních anestetik (LAST). Z technických a etických důvodů je na toto téma velmi málo literatury. Ve studii LEVON, která je součástí této práce, byla laboratorní technika upravena tak, aby odběr krevních vzorků byl pro novorozence bezpečný. Z odebraných mikrovzorků (14 pacientů) byla určena koncentrace celkového a volného LVB a výsledky byly porovnány. Vyšší volný LVB je zodpovědný za LAST. Během c-CELA nebyly zjištěny žádné známky LAST, komplikace byly nezávažného charakteru spojené s používáním c-CELA. Laboratorně nebyla prokázána kumulace. Volný LVB byl vždy v bezpečných hladinách a brzy dosahoval rovnováhy (od. 6. hodiny podávání). Celkový LVB dosáhl rovnovážného stavu mezi 12. a 72. hodinou s velmi variabilními...
Úplný záznam
|
2024-12-21
00:00 |
Bezpečnostní rizika celozrnných bezlepkových potravin se zaměřením na výskyt tropanových alkaloidů
VRZALOVÁ, Radka
V posledních 10 letech se dostaly do hledáčku evropského úřadu pro bezpečnost potravin (EFSA) tropanové alkaloidy, nebezpečné přírodní toxiny, pocházející z plevelů doprovázejících nečištěné nebo špatně dočištěné frakce zemědělských plodin. Tropanové alkaloidy jsou toxické sekundární metabolity přirozeně se vyskytující v přibližně jedné pětině vyšších rostlin. Nejvýznamnějšími zdroji rostlinných alkaloidů potencionálně přenositelnými do potravin jsou plevelné rostliny rostoucí na polích, které mohou při sklizni kontaminovat cílové zemědělské komodity. Z uvedených případových studií a provedených rešerších zdrojů vyplývá, že nadlimitní výskyty alkaloidů je velkým problémem zejména v bezlepkových plodi-nách, surovinách a potravinách. Z těchto speciálních potravin, využívaných zejména celiaky, se pak stávají vysoce rizikové komodity. V rámci výzkumné práce byla věnována pozornost legislativě, týkající se bez-pečnosti potravin, zejména obsahu kontaminujících látek tropanových alkaloidů a bezpečnost bezlepkových výrobků jako takových. Výzkumné šetření - analýza hladin atropinu a skopolaminu metodou HPLC u 41 bezlepkových potravin na českém trhu obsahujících zájmové plodiny (čirok, jáh-ly, kukuřici, pohanku) vedlo k posouzení bezpečnosti - zdravotní nezávadnost bezlepkových potravin vhodných pro všechny, kteří vyhledávají tento stravovací trend včetně celiaků, kteří jsou na tyto výrobky ve své stravě odkázáni. Ve zkoumaných sortimentních skupinách bezlepkových potravin nebyly zjištěny vysoce nadlimitní hodnoty tropanových alkaloidů, pouze u dvou vzorků došlo k mírnému překročení limitu pro skupinu výrobků z čiroku, kukuřice a jáhel. Během šetření a sběru dat však vyvstaly další výzkumné otázky, směřující k problematice zvýšené konzumace těchto výrobků právě u skupiny celiaků, zejména malých dětí, kterým v dobré víře rodiče poskytují právě celozrnné bezlepkové potraviny v rámci denního jídelníčku.
Úplný záznam
|
|
|
|
host ::
