|
|
Simulace interakce steroidních allosterických modulátorů NMDA receptorů s membránou
Riedlová, Kamila ; Konopásek, Ivo (vedoucí práce) ; Novák, Josef (oponent)
Metoda molekulové dynamiky (MD) umožňuje v reálném čase sledovat vývoj systému složeného z atomů a molekul. Takovým systémem může být např. lipidová dvojvrstva a biomolekula. MD simulace se nejčastěji uplatňuje v návrhu léčiv, kdy laboratorní experimenty s reálným objektem mohou být finančně a časově náročné nebo neproveditelné. Cílem této práce bylo objasnit využití a užitečnost metody MD aplikované na studium lipidových dvojvrstev a ukázat praktické využití této techniky, kterým je studium chování neurosteroidů v lipidových dvojvrstvách. Vhodně navržené a uměle syntetizované neurosteroidy by se mohly uplatnit v léčbě vážných neurologických onemocnění. Součástí této práce jsou i experimentální data získaná MD simulacemi pro vybrané neurosteroidy - pregnanolon glutamát a pregnanolon sulfát. Pomocí MD simulace bylo sledováno chování těchto molekul v modelových membránách a analyzováno. Klíčová slova: molekulově dynamická simulace, modelová membrána, lipidová dvojvrstva, NMDA receptor, neurosteroidy, pregnanolon glutamát, pregnanolon sulfát
|
|
|
Isolation and Characterization of Protoplasts and their Utilization for Model Membrane
Nováková, Kateřina ; Navrátil, Tomáš ; Šestáková, Ivana ; Langmaier, Jan ; Heyrovský, Michael ; Zámečníková, B. ; Vodičková, H.
Protoplasts are prepared form plant cells by removing their cell walls, which are usually destroyed mechanically or by enzymes. Protoplasts exhibit the spherical shape after removing of their cell walls. They can be isolated from a range of plant tissues: leaves, stems, roots, anthers, and even pollen. Plasmatic membranes surrounding protoplasts can be used as a source of model membranes. Therefore, some parts of plasmatic membranes or subcellular organelle membranes, which contain specific transport systems, can be isolated and integrated to model phospholipid membranes. State of such model membranes can be characterized by electrochemical impedance spectrometry (EIS) and the transported species can be determined with the use of voltammetric methods.
|
host ::
RSS.