|
|
Synthesis of block copolymers by ring-opening polymerization and post polymerization modification with phenylboronic acid
Dudičová, Dorota ; Uchman, Mariusz Marcin (vedoucí práce) ; Strachota, Adam (oponent)
Tato práce se zabývá syntézou amfifilních diblokových kopolymerů na bázi poly(ethylenoxidu)-b-polykaprolaktonu modifikovaných propargylem (PEO-PgCL). V syntéze byla použita tzv. Polymerizace prostřednictvím otevírání kruhů (ROP) propargylovaného kaprolaktonu iniciovaná α-hydroxy-ω-methoxy poly(ethylenoxidem) o dvou různých délkách (2000, 5000 g/mol). Následně byla do modifikovaného bloku zavedena fenylboronová funkční skupina pomocí mědí katalyzované cykloadice (CuAAC) s pinakolátem 2-azidometyl fenylboronové kyseliny. K Charakterizaci kopolymerů bylo použito několik různých technik např. protonová nukleárni magnetická rezonance 1 H NMR, gelová permeační chromatografie (GPC) a hmotnostní spektrometrie (MALDI-ToF). Výsledky práce přispěly k optimalizaci reakčních podmínek polymerizace v rámci grantového projektu laboratoře. Klíčová slova: Amfifilní blokové kopolymery, CuAAC click, fenylboronová kyselina, poly-ε- kaprolakton, polymerizace prostřednictvím otevírání kruhů
|
|
|
Syntéza a charakterizace glukózou modifikovaných ABA blokových kopolymerů s využitím thiol - enové click reakce
Hašpl, Adam ; Uchman, Mariusz Marcin (vedoucí práce) ; Štěpánek, Miroslav (oponent)
Bakalářská práce se věnuje způsobu postpolymerizační modifikace dvou vzorků amfifilního blokového kopolymeru poly(ethylen oxid-b-1,2-butadien-b-ethylen oxid) s vysokým zastoupením jednotek 1,2-izomeru vnitřního bloku polybutadienu metodou thiol-ene click. Jako modifikační činidlo byla použita 1-Thio-β-D-glukóza tetraacetát. Práce se dále zaměřuje na metody charakterizace vzorků kopolymeru před i po provedení modifikační reakce. Struktura a stupeň funkcionalizace vinylických jednotek bloku polybutadienu po provedení modifikace byly stanoveny metodou spektroskopie nukleární magnetické rezonance. Rozměry připravených polymerních částic v roztoku byly studovány metodami statického a dynamického rozptylu světla. Klíčová slova: ABA blokové kopolymery, samoskladba polymerů, click reakce, NMR spektroskopie, rozptyl světla
|
|
|
Vývoj nové metody pro in vitro selekci DNA aptamerů
Bláhová, Kamila ; Míšek, Jiří (vedoucí práce) ; Moserová, Michaela (oponent)
DNA či RNA, které vázat různé molekuly (léčiva, lipidy, cukry, proteiny atd.) oligonukleotidů pomocí metody SELEX Přes úspěšnost této metody, kce často vyžaduje více než deset kol afinitní selekce a taktéž optimalizaci podmínek selekce. Pro zvýšení účinnosti selekce aptamerů bylo vyvinuto několik metod, které využívají zvýšení počtu sekundárních struktur náhodných knihovnách oligonukleotidů. Tyto metody, založené na zvýšení možnosti jednovláknových oligonukleotidech, zvýšily efektivitu metody o testováno, jestli zvýšení pravděpodobnosti výskytu kvadruplexů, jako strukturních motivů náhodných sekvencích, povede ke zvýšení efektivity selekce aptamerů. Byly použity čtyři knihovny počtem guaninu (25 %, 35 %, 45 %, 55 %) v selekci byl zvolen streptavidin, vůči kterému již bylo dříve vyselektováno několik aptamerů, (G). Předběžné výsledky naznačují, že G nezvyšují efektivitu selekce přinejmenším u molekul, které nepreferují G Klíčová slova:
|
|
|
Syntéza a studium vlastností kotev s větším počtem pozitivních permanentních nábojů a allylovou skupinou
Kozel, Ondřej ; Jindřich, Jindřich (vedoucí práce) ; Kamlar, Martin (oponent)
Modifikace pevného povrchu je široce zkoumané odvětví, ve kterém se převážně uplatňuje kovalentní modifikace. Tyto modifikace jsou výhodné z hlediska stability nově vzniklé vazby, ale nevýhodné kvůli své finanční a materiální náročnosti. Byly zkoumány i možnosti iontových modifikací, využívajících elektrostatické interakce, které však nejsou příliš používané. Důvodem je slabá pevnost iontové vazby projevující se vymýváním modifikátoru polárními rozpouštědly. Nově byly navrženy nové látky, které by díky své struktuře měly být silněji vázány k pevnému povrchu. Tyto látky obsahující propargylovou skupinu již byly i ozkoušeny při modifikaci různých pevných fází. Tato práce demonstruje použitelnost postupu pro přípravu těchto látek s allylovou skupinou. Klíčová slova: permanentní pozitivní náboje; click reakce; elektrostatická vazba; iontová modifikace; kvartérní amoniové soli; modifikace pevného povrchu
|
|
|
Enzymatic synthesis of DNA modified in the minor groove
Matyašovský, Ján ; Hocek, Michal (vedoucí práce) ; Hlaváč, Jan (oponent) ; Urban, Milan (oponent)
Souhrn V první části práce byla navržena a syntetizována řada šesti modifikovaných 2'- deoxyadenosintrifosfátů, nesoucí malé funkční skupiny (chlor, amino, methyl, vinyl, ethynyl a fenyl) na adeninu v poloze 2. Připravené nukleotidy byly testovány jako substráty pro DNA polymerázy v enzymatické syntéze DNA modifikované v malém žlábku. 2-Fenyl modifikovaný dATP byl jediným trifosfátem, který nebyl inkorporovaný, což znamená, že fenylová skupina je již příliš velká pro inkorporaci do malého žlábku. Všechny ostatní testované nukleotidy byly dobrými substráty pro testované DNA polymerázy [KOD XL, Vent(exo-) a Bst LF], což poskytlo modifikovanou DNA s malým žlábkem nesoucím jednu nebo čtyři modifikace. Modifikované DNA s vinylovou nebo ethynylovou skupinou byly poté použity pro modifikaci malého žlábku DNA fluorescenčními značkami za použití click reakcí. Ethynylová skupina reagovala v mědí katalyzované cykloadici alkynu s azidem (CuAAC), zatímco vinylová skupina se účastnila thiol- en-ové reakce. Tento postup umožnil připojení velkých funkčních skupin, které by jinak nemohly být instalovány do malého žlábku DNA pomocí přímé enzymatické inkorporace. Druhá část práce byla věnována studiu 2-alkylamino-2'-deoxyadenosin trifosfátů a jejich použití v enzymatické syntéze modifikovaných oligonukleotidů a DNA. N2 -alkyl...
|
|
|
Synthesis of block copolymers by ring-opening polymerization and post polymerization modification with phenylboronic acid
Dudičová, Dorota ; Uchman, Mariusz Marcin (vedoucí práce) ; Strachota, Adam (oponent)
Tato práce se zabývá syntézou amfifilních diblokových kopolymerů na bázi poly(ethylenoxidu)-b-polykaprolaktonu modifikovaných propargylem (PEO-PgCL). V syntéze byla použita tzv. Polymerizace prostřednictvím otevírání kruhů (ROP) propargylovaného kaprolaktonu iniciovaná α-hydroxy-ω-methoxy poly(ethylenoxidem) o dvou různých délkách (2000, 5000 g/mol). Následně byla do modifikovaného bloku zavedena fenylboronová funkční skupina pomocí mědí katalyzované cykloadice (CuAAC) s pinakolátem 2-azidometyl fenylboronové kyseliny. K Charakterizaci kopolymerů bylo použito několik různých technik např. protonová nukleárni magnetická rezonance 1 H NMR, gelová permeační chromatografie (GPC) a hmotnostní spektrometrie (MALDI-ToF). Výsledky práce přispěly k optimalizaci reakčních podmínek polymerizace v rámci grantového projektu laboratoře. Klíčová slova: Amfifilní blokové kopolymery, CuAAC click, fenylboronová kyselina, poly-ε- kaprolakton, polymerizace prostřednictvím otevírání kruhů
|
host ::
RSS.