|
|
Analysis of farnesylated peptides and proteins using LC-MS
Hessler, Filip ; Kovaříková, Petra (oponent) ; Waisser, Karel (vedoucí práce)
Krátké shrnutí práce Farnesylované proteiny mají velký význam ve vedení signálu buňkou a jako takové mohou hrát roli ve vzniku řady chorob, zejména rakoviny. Hmotnostní spektrometrie s ionizací elektrosprejem je metoda široce využívaná v analýze peptidů a proteinů, proto byla zvolena k vyvinutí snadného způsobu nalezení farnesylovaných proteinů v buňce. Na synteticky farnesylovaných jednoduchých peptidech a hovězím albuminu byl objasněn způsob, jakým se farnesylované peptidy štěpí v hmotnostním spektrometru. Charakteristickým rysem MS/MS spekter těchto peptidů jsou dva píky, které vznikly odštěpením farnesylu od samotného peptidu. Tyto fragmenty se liší v počtu nábojů na fragmentu, to je způsobeno rozdílným druhem štěpení. Rozštěpením vazby mezi sírou cysteinu a farnesylem rovnoměrně, vzniká nový náboj na peptidu a odstupující nabitá skupina o atomové hmotnosti 205. Pokud štěpení probíhá za ztráty neutrálního fragmentu farnesylu, na peptidu zůstává pouze původní náboj a odstupuje fragment o atomové hmotnosti 204, který ztratil jeden atom vodíku ve prospěch peptidu. Tato zjištění lze aplikovat z jednoduchých peptidů i na hledání farnesylace ve vzorcích, obsahující složitou směs proteinů z buněk. Při hledání farnesylovaných proteinů ve vzorku získaném z proteinů buněčné membrány buněk rakoviny prsu, jsem však...
|
|
|
Vývoj nové skupiny potenciálních antituberkulotik
Divišová, Hana ; Waisser, Karel (vedoucí práce) ; Kolář, Karel (oponent)
In this rigorous paper three problems were solved: a) synthesis and antimycobacterial activity of new halogenated salicylanilides substituted in position 4' with branch chain. b) synthesis and antimycobacterial activity of new halogenated 3-(4-alkylphenyl)-1,3-benzoxazine-2,4-(3H)-diones. c) influence of replacement of oxo group by thioxo group in the previously group of compounds. a) It was synthesized 8 halogenated derivatives of 4'-alkylsalicylanilides with branched alkyl chain. These compounds were evaluated in vitro on antimycobacterial activity against Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium kansasii and Mycobacterium avium. b) It was synthesized 7 halogenated derivatives of benzoxazinediones with branch chain by reaction of salicylanilides with methylchloroformiate. Antimycobacterial activity of synthesized compounds was evaluated against three different mycobacterial strains. The most active compound was 7- chloro-3-(4-sec-butylphenyl)-1,3-benzoxazine-2,4-(3H)-dione. c) There were synthesized the following compounds: 7-chloro-3-(4-isopropylphenyl)-4-thioxo-2H-1,3- benzoxazine-2(3H)-one, 6-bromo-3-(4-isopropylphenyl)-4-thioxo-2H-1,3-benzoxazine-2(3H)-one, 6- bromo-3-(4-sec-butylphenyl)-4-thioxo-2H-1,3-benzoxazine-2(3H)-one, 6-chloro-3-(4-sec-...
|
|
|
Nové skupiny potenciálních antituberkulotik
Adamec, Jan ; Waisser, Karel (vedoucí práce) ; Lešetický, Ladislav (oponent) ; Čižmárik, Jozef (oponent)
8. Souhrn Tato práce se zabývá syntézou a biologickým testováním derivátů 1-aryl-5-(benzylsulfanyl)tetrazolu a hybridních molekul estronu. Na našem pracovišti byly dříve nalezeny některé nové farmakofory antimykobakteriální aktivity, jakým je například alkylsulfanyl skupina vázaná na elektronově deficitním atomu uhlíku v heterocyklech. U řady antimykobakteriálně účinných látek byla zjištěna také aktivita antimykotická. Tato práce je rozčleněna do tří tématických celků. První z nich se zabývá srovnáním antimykobakteriální aktivity skupiny derivátů 1-aryl-5-(alkylsulfanyl)tetrazolu (kde alkylem je ethyl, propyl, iso-propyl nebo allyl) a 1-aryl-5-(benzylsulfanyl)tetrazolu. Benzylové deriváty vykazovaly významně lepší aktivitu, což bylo potvrzeno QSAR analýzou. V samotné skupině benzylových derivátů se ukázalo, že substituce na benzylovém jádře vede ke snížení aktivity. Druhým studovaným tématem byla antimykotická aktivita připravených 1-aryl-5-(benzylsulfanyl)tetrazolů hodnocená na osmi klinicky významných fungálních kmenech. Významná aktivita zde byla pozorována pouze u kmene Trichophyton mentagrophytes, pro který byla také provedena QSAR analýza. Ve studované skupině dochází s rostoucí lipofilitou k poklesu antimykotické aktivity. Ve třetí části byly syntetizovány hybridní sloučeniny obsahující na steroidním...
|
|
|
Antimykobakteriální isostery salicylanilidů
Matyk, Josef ; Waisser, Karel (vedoucí práce) ; Čižmárik, Jozef (oponent) ; Lešetický, Ladislav (oponent)
V PhD disertaci byla popsána skupina 79 látek (4-alkylfenyl)salicylamidů, N-heteroarylsalicylamidů, 3-(4-alkylfenyl)-2H-1,3-benzoxazin-2,4(3H)-dionů, 3- (4-alkylfenyl)-2H-1,3-bemzoxazin-4(3H)thioxo-2-onů, 3-(4-alkylfenyl)-2H-1,3- benzoxazin-2,4(3H)-dithionů a 3-heteroaryl-2H-1,3-benzoxazin-2,4(3H)-dionů. Látky byly hodnoceny na antimykobakteriální, antifungální a antibakteriální aktivitu. Vybrané látky byly hodnoceny na cytotoxicitu. Deriváty (4-alkylfenyl)salicylamidů byly analyzovány přístupem QSAR (Kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou) a to metodou podle Freeho a Wilsona. Struktura připravených látek byla ověřena 1 H-NMR a IČ-spektroskopií a jejich čistota elementární analýzou. Deriváty (4-alkylfenyl)salicylamidů, N-heteroarylsalicylamidů, 3-(4- alkylfenyl)-2H-1,3-benzoxazin-2,4(3H)-dionů, 3-(4-alkylfenyl)-2H-1,3- bemzoxazin-4(3H)thioxo-2-onů, 3-(4-alkylfenyl)-2H-1,3-benzoxazin-2,4(3H)- dithionů a 3-heteroaryl-2H-1,3-benzoxazin-2,4(3H)-dionů vykazovaly vysokou aktivitu vůči Mycobacsterium tuberculosis a atypickým kmenům mykobaktérií (M. avium a M. kansdasii).
|
|
|
4'-alkylsalicylanilidy s rozvětveným alkylovým řetězcem a jim odpovídající deriváty benzoxazindionů
Divišová, Hana ; Waisser, Karel (vedoucí práce) ; Kuneš, Jiří (oponent)
V práci byla řešena otázka antimyklobakteriálních látek. a) Bylo syntéováno osm nových halogenovaných 4-alkylsalicylanilidů s rozvětvenými alkyly v pozici 4'. b) Syntéza nových halogenovaných 3-(4-alkylfenyl)-1,3-benzoxazin -2,4-(3H)-dionů s rozvětvenými alkyly na fenylu. Bylo syntetizováno sedm 3-(4-alkylfenyl)-1,3-benzoxazin-2,4-(3H)-dionů reakcí salicylanilidů s methyl- chloroformiátem. Všechny látky byly hodnoceny in vitro vůči rozličných kmenů m mykobaktérií. Výsledky nebyly ukončeny během diplomové práce. Podle hypotézy proresora Waissera předpokiládáme, že látky budou velmi perspektivní.
|
|
| |
|
|
Nové skupiny potenciálních antituberkulotik s thioxo skupinou
Husáková, Petra ; Waisser, Karel (vedoucí práce) ; Kolář, Karel (oponent)
9.2. ČESKÝ ABSTRAKT V rigorózní práci byl popsán vliv záměny oxo skupiny za thioxoskupinu v řadě halogenovaných 3-(4-ethylfenyl)benzoxazin-2,4(3H)-dionů a 6-chlor-3-(4-butyfenyl)benzoxazin-2,4(3H)-dionů Výchozí ethyl (nebo butyl) salicylanilidy byly syntetizovány z ethyl (nebo butyl) anilinu a substituované salicylové kyseliny v toluenu za přítomnosti chloridu fosforitého. (Skupina halogenovaných salicylových kyselin: 4-chlor-, 5-chlor-, 5-brom- and 3,5-dibrom salicylová kyselina.) Halogenované 4'-ethylsalicylanilidy reagovaly v suchém pyridinu s methyl- chloroformiatem za vzniku 3-(4-ethylfenyl)benzoxazin-2,4(3H)-dionů. Podobně byly připraveny 6-chlor-3-(4-butylfenyl)benzoxazin-2,3,(4-H)-diony. Směs 3-(4-ethyfenyl)-4-thioxo-2H-1,3- benzoxazin-2(3H)-onu a 3-(4-ethylfenyl)-2H-1,3-benzoxazin-2,4(3H)-dithionu byla připravena reakcí halogenovaných 3-(4-ethylfenyl)- 2H-1,3-benzoxazin-2,4(3H)-dionů se sulfidem fosforečným. Látky byly odděleny chromatograficky. Podobně byl získán 6-chlor-3-(4- butylfenyl)-thioxo-2H-1,3-benzoxazin-2(3H)-on a 6-chlor-3-(4-butylfenyl)-2H-1,3-benzoxazin- 2,4(3H)-dithion. Látky byly hodnoceny in vitro na antimykobakteriální aktivitu vůči Mycobacterium tuberculosis, M. kansasii (dva kmeny) a M. avium. Thioxo (nebo dithioxo) deriváty jsou vysoce aktivními antimykobakteriálními látkami,...
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.