|
|
Genová exprese v kuřecím embryu: mikromanipulační a vizualizační metody
Bendová, Michaela ; Dvořák, Michal (vedoucí práce) ; Hirsch, Ivan (oponent) ; Krylov, Vladimír (oponent)
Cílem této dizertační práce bylo získat lepší vhled do principů vývoje buněčných struktur a orgánů v kuřecím embryu. K tomuto účelu byly zavedeny a k daným procedurám upraveny různé pokročilé metody manipulace a vizualizace in vitro, ex vivo, ex ovo a in ovo. Tyto specializované metody byly využity zejména ke studiu genové exprese ve vývoji neurální lišty a vývoji oka. Během dlouhodobého výzkumu v naší laboratoři byl pozorován vliv onkoproteinu v-Myb na vývoj neurální lišty a jeho schopnost měnit přirozený buněčný osud. Studovali jsme vliv proteinu v-Myb na změny v diferenciaci buněk neurální lišty, zejména jejich vývoj do melanocytární linie, a jeho vliv na expresi genů v neurální liště. Středem našeho zájmu se stal protein Gremlin 2, označovaný také jako PRDC (protein related to Dan and Cerberus), jehož expresi v-Myb v neurální liště zvyšuje. Zavedené postupy elektroporace neurální lišty in ovo byly upraveny pro transfekci buněk vyvíjejícího se oka a využity ke studiu genové regulace při indukci čočky. Výsledky získané na kuřecím modelu podpořily studii provedenou na myších embryích. Technika elektroporace do embryonálního oka byla také upravena pro mikromanipulace s retinou in ovo, která byla dále zpracována metodami ex vivo a in vitro pro studii zabývající se lokalizací snRNP ve...
|
|
|
Protidronová ochrana perimetru
Janík, Roman ; Dvořák, Michal (oponent) ; Drahanský, Martin (vedoucí práce)
Rozvoj technologie dronů s sebou přináší příležitosti pro mnoho oblastí lidské činnosti, ale zároveň i bezpečnostní hrozby. Vzniká potřeba těmto hrozbám efektivně čelit. V této práci je popsána problematika a současné metody pro detekci objektů ve videu zachyceném pohybující se kamerou. Dále jsem navrhl systém pro detekci a lokalizaci dronu či hejna dronů. Algoritmus pro detekci je založen na konvoluční neuronové síti, konkrétně na algoritmu SSD. Systém jsem implementoval pomocí knihovny OpenCV s možnou akcelerací algoritmu na GPU pomocí OpenCL. Vytvořené řešení jsem otestoval jak na videu, tak na video výstupu kamery.
|
|
|
Detekce palných zbraní v obrazu
Debnár, Pavol ; Drahanský, Martin (oponent) ; Dvořák, Michal (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá detekciou palných zbraní v obraze. V teoretickej časti je najprv definovaný pojem palná zbraň a potom sú uvedené typy palných zbraní. Nasleduje vysvetlenie obrazového šumu, ktorý môže do značnej miery ovplyvniť výsledok detekcie, a sú uvedené spôsoby, ako ho redukovať. Ďalej sú definované algoritmy obrazovej detekcie, ktoré pracujú na báze neurónových sietí - konvolučné neurónové siete (CNN) a Single Shot Multibox Detector (SSD). Vysvetlené sú aj klasické algoritmy pre detekciu v obraze ako HOG+SVM a SURF. V ďalšej časti sú uvedené použité knižnice a softvér. Nasleduje experimentálna časť, kde uvedieme navrhnutý postup riešenia a databázu. Pre detekciu boli použité algoritmy HOG+SVM, SURF a SSD. Následne sú uvedené výsledky testov na databáze a videu, čomu nasleduje zhrnutie a možnosti rozšírenia do budúcnosti.
|
|
|
Psychologická linka jako vyprávěcí prostředek
Dvořák, Michal ; MALIMÁNEK, Karel (vedoucí práce) ; BROTHÁNEK, Adam (oponent)
Film je medium, které vnímáme jako svět kolem nás. Zároveň má jedinečnou schopnost se podívat i do naší duše. Jelikož film a sen mají blíže, než si můžeme myslet a odkrývá nám tajemství archetypů a jejich význam pro naši společnost. Díky analytické psychologii C. G. Junga a práce Josepha Campbella se tato práce pokouší najít klíč k tomu, jakým způsobem mohou filmy komunikovat psychologickou linkou namísto linky narativní.
|
|
| |
|
|
Snímání a rozpoznávání 3D podpisu
Molitoris, Miloš ; Dvořák, Michal (oponent) ; Drahanský, Martin (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá metódami snímania podpisov v 3D priestore, výberom vhodného modelu snímania, získaním dostatočného počtu vzoriek na vytvorenie databázy a nakoniec overovaním podpisov. V prvej časti je spracovaná problematika existujúcich riešení a spôsobov overovania podpisov, ďalej spracovanie obrazu potrebné pre účely snímania markeru v 3D priestore. Nasledujúce časti sú venované návrhu unikátneho riešenia podpisovania sa v priestore perom absenciou akéhokoľvek kontaktu. Boli navrhnuté dva modely snímania a to pomocou kamier alebo senzoru Leap Motion. Aplikácia bola implementovaná nad týmto senzorom a systém overovania dynamických podpisov pomocou algoritmu DTW. Ďalej práca obsahuje popis vytvorenia databázy a experimentálne overenie podpisov. Na konci nájdeme zhodnotenie bezpečnosti a chybovosti systému, ktoré je porovnané s inými metódami. Výsledkom práce je funkčná aplikácia na snímanie a rozpoznávanie 3D podpisov s potenciálom novej bezpečnej techniky podpisovania.
|
|
|
Detekce, lokalizace a určení plochy chronických ran
Gulán, Filip ; Dvořák, Michal (oponent) ; Drahanský, Martin (vedoucí práce)
Cieľom tejto diplomovej práce je návrh a realizácia multiplatformnej aplikácie pre detekciu, lokalizáciu a určenie plochy chronických rán. Aplikácia má za úlohu pomáhať zdravotným sestrám, doktorom a ošetrovateľom sledovať a vyhodnocovať chronické rany v priebehu trvania liečby. Aplikácia je postavená na programovacom jazyku Typescript, hybridnom aplikačnom rámci Ionic a desktopovom aplikačnom rámci Electron. Vyhodnocovanie chronickej rany prebieha na strane servera, kde sa využíva programovací jazyk Python, pre RESTful aplikačné rozhranie aplikačný rámec Flask a pre spracovanie obrazu knižnica OpenCV.
|
|
| |
|
|
Studium variabilního úseku onkoproteinu v-Myb
Starostová, Michaela ; Dvořák, Michal (vedoucí práce) ; Zadražil, Stanislav (oponent)
- 4 - Study of the v-Myb oncoprotein variable region The aim of this thesis was to analyze the significance of the variable region of oncoprotein v-Myb. The v-myb oncogene originated in the chick through a natural recombination of the MAV1 retroviral genome with the c-myb gene, which is an important transcriptional regulator involved in hematopoiesis and other important processes in different types of vertebrate cells. In comparison with the c-myb coding sequence, the retroviral v-myb is truncated on N- and C-terminals and includes 11 point mutations. Due to both these changes and the retroviral promoter which drives its expresion, the v-Myb oncoprotein became the inducer of acute myeloid leukemia in chicks. The variable region of v-Myb lies in between the N-terminal DNA binding and the central transactivating domains. This region is the least evolutionarily conserved part of the protein. No published data are available about its potential function. In this work the biological significance of the variable region was studied by means of specific deletions and sequence swaps. Two deletions (∆PstI and ∆NaeI) and two swaps (chicken v-myb to mouse and Xenopus c-myb) were prepared. Recombinant DNAs were cloned into MAV1-based retroviral vector and transfected into chick embryo fibroblasts (CEFs) in tissue...
|
|
|
CSL proteins of Schizosaccharomyces pombe
Převorovský, Martin ; Půta, František (vedoucí práce) ; Dvořák, Michal (oponent) ; Kořínek, Vladimír (oponent)
Souhrn Transkripčnífaktory rodiny cSL jsou esenciální pro ontogenetickývyvoj mnohobuněěnýchživočichů,zejména díkysvéúlozev signálnídrázeNotch' Nalezli jsme dvě nové třídy genůCSL u několika druhůhub (Fungi), což jsou organizny, kterédráúruNotch nemají.Abychom objasnili funkci rodiny CSL u houbovýchorganizmů,experimenúí|ně jsme charakterizovalicbfll* a cbfl2*, geny CSL zkvasinky Schizosaccharomycespombe. Naše rnýsledkyukazuji, že se jedná o skutečnéčleny rodiny CsL. oba geny jsou neesenciální;nají odlišnéexpresníprofily a kódujíjademé proteinyseschopnostíaktivovattranskripci.Prokazalijsme,že cbfl l specifickyrozeznáváin vitro kanonickýcíloý element zněmý pro metazoá|níhomology (GTGryGGAA)' Delece cbfll- rnáza následekrůstovédefektya změnyv morfologii kvasinkoých kolonií.Dále jsme zjistili, žeCbfl | a Cbf12 hrajíopaěnérole v buněčnéadhezia v jadernéma buněčném dělení a jejich vzájemnékoordinaci. Narušenírovnováhy těchto dvou proteinůvede k defektůmv separacibuněk po dělení,k fenoýpu ,,c|It,,a abnormálnídiploidizaci.Našedata dokládají,Že proteiny CSL fungujív organimru, kteý je evolučněstaršínež dráha Notch, coŽ by mělo přispět k pochopenífunkcerodinyCSL v metazoích. 4
|
host ::
RSS.