|
|
Příprava kationických sloučenin jako potenciálních surfaktantů zlatých nanočástic
Částková, Jana ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Miletín, Miroslav (oponent)
Zlaté nanočástice jsou široce zkoumány pro různé aplikace. Jejich povrch umožňuje velké množství chemických obměn. Ty jsou důležité pro modifikaci jejich vlastností v závislosti na účelu jejich využití. K modifikaci povrchu, ale i k syntéze zlatých nanočástic jsou využívány povrchově aktivní látky. Cílem této práce byla syntéza nových typů surfaktantů v podobě kvarterních amoniových solí. Skládají se z dvanáctiuhlíkatého řetězce, thiolové funkční skupiny a kvartérního dusíku zabudovaného v různých funkčních skupinách. Struktura a čistota připravených látek byla potvrzena nukleární magnetickou rezonancí a hmotností spektrometrií. Tyto látky by měly sloužit právě jako potenciální surfaktanty zlatých nanočástic. Thiolová funkční skupina v molekule by měla zajistit kovalentní vazbu surfaktantu na zlatou nanočástici, a tak nižší toxicitu, kdy by se surfaktanty z povrchu zlatých nanočástic neměly uvolňovat do jejich roztoku. Kvartérní amoniová skupina by měla zajistit dostatečnou rozpustnost ve vodě.
|
|
|
Modulation of mitochondrial dynamics in Parkinson's disease
Baďurová, Marie ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly lé iv Studentka: Marie Ba urová Školitel: Prof. Jorge Miguel de Ascenção Oliveira, Ph.D. Prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Konzultant: Brígida Ribeiro Pinho, Ph.D. Název diplomové práce: Ovliv ování dynamiky mitochondrií p i Parkinsonov chorob Parkinsonova choroba je jedno z nej ast jších neurodegenerativních onemocn ní na sv t . Stále není známo, jak tuto chorobu vylé it. Existují pouze prost edky, které pomáhají redukovat symptomy Parkinsonovy choroby. Mezi patologické mechanismy, které souvisejí s Parkinsonovou chorobou, pat í mutace n kterých gen (jako -synuclein, Parkin, PINK1) a existuje také spojitost mezi mitochondriální dysfunkcí a Parkinsonovou chorobou. Bylo prokázáno, že nadm rná mitochondriemi vyvolaná apoptóza m že vést k neurodegeneraci. Cílem naší práce bylo otestovat lé ivo mdivi-1 (mdivi), které p sobí jako inhibitor mitochondriálního d lení a p edchází mitochondriemi vyvolané apoptóze. Mdivi-1 se selektivn váže a inhibuje s dynaminem asociovaný protein 1 (DRP1), který mitochondrie pot ebují p i d lení a inhibicí vn jší membrány znemož uje uvoln ní pro-apoptotického mediátoru cytochromu c. Cht li jsme otestovat jeho na koncentraci závislé ú inky na modelovém organismu,...
|
|
|
In silico screening of SIRT6 inhibitors
Kučera, Tomáš ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Holas, Ondřej (oponent)
Název práce: In silico screening inhibitorů SIRT6 Autor: Tomáš Kučera Katedra: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Vedoucí diplomové práce: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Školitel-specialista: Maija Lahtela-Kakkonen, Ph.D. Abstrakt: SIRT6 je nazýván NAD-dependentní protein deacetylasa sirtuin-6 a je členem proteinové rodiny sirtuinů. Moduluje acetylaci histonu H3 (klinicky důležitých Lys9 a Lys56). SIRT6 je zajímavým cílem léčiv vzhledem k jeho roli při replikaci DNA, glykolýze a zánětu - proto je vývoj inhibitorů SIRT6 významný v souvislosti s diabetes mellitus, artritidou a rakovinou. Cílem práce bylo najít nové molekuly inhibující deacetylační aktivitu SIRT6 za využití metod výpočetní chemie a molekulového modelování. Snažili jsme se najít zejména nové struktury, které by bylo možné optimalizovat v dalších fázích cesty za léčivem. Jako vstupní data bylo použito 9 inhibitorů a krystalová struktura SIRT6 (PDB kód 3K35). Ze skupiny metod založených na ligandech byly vybrány farmakofor a chemická podobnost, z metod založených na struktuře to pak byl molekulový dock- ing. Farmakofor byl definován po strukturálním srovnání čtyř známých ligandů a testován na souboru ligandů a neligandů. Jako vzor...
|
|
|
Syntéza a in vitro testování takrin-troloxových derivátů jako potenciálních inhibitorů acetylcholinesterasy
Ondřejíček, Aleš ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Student: Aleš Ondřejíček Školitel: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Školitel specialista: PharmDr. Jan Korábečný, Ph.D. Název práce: Syntéza a in vitro testování takrin - troloxových derivátů jako potenciálních inhibitorů acetylcholinesterasy Alzheimerova choroba (AD) je komplexní neurodegenerativní onemocnění, které se projevuje postupnou ztrátou krátkodobé epizodické paměti a poruchami kognitivních funkcí. Charakteristickými histopatologickými znaky AD jsou přítomnost neuritických plaků a neurofibrilárních klubek v mozkové tkáni a porucha cholinergní neurotransmise. V současné době se v terapii AD používají pouze dvě skupiny léčiv. První skupinu tvoří inhibitory acetylcholinesterasy (AChEI) a do druhé se řadí memantin, antagonista NMDA receptorů. Cílem diplomové práce bylo připravit tři série takrin - troloxových derivátů. Konkrétně se jednalo o deriváty troloxu s takrinem, 7-methoxytakrinem a 6-chlortakrinem, které byly spojeny různě dlouhými spojovacími řetězci. K porovnání účinnosti nově připravených sloučenin byla použita Ellmanova metoda s takrinem, 7-methoxytakrinem a 6-chlortakrinem jako standardních látek. Antioxidační aktivita nových derivátů byla stanovena za použití DPPH...
|
|
|
Characterisation of Gyrase inhibitors using ITC and enzymatic assay
Barančoková, Michaela ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Miletín, Miroslav (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv University of Ljubljana, Faculty of Pharmacy Department of Medicinal Chemistry Školitelé: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. assoc. prof. Dr. Janez Ilaš, Ph.D. Student: Michaela Barančoková Název diplomové práce: Charakterizace inhibitorů gyrázy s použitím ITC a enzymatického testování Tato práce se zabývá in vitro hodnocením inhibitorů gyrasy a topoisomerasy IV - enzymů spadajících do rodiny topoisomeras typu II. Tyto enzymy jsou nezbytné pro správnou funkci bakteriální buňky a jejich inhibicí dochází k jejímu zániku. Experimentální část práce byla vypracována na Katedře Medicinální Chemie při Univerzitě v Lublani v rámci programu Erasmus+. Testované nové inhibitory na bázi substituovaného pyrrolamidu s GyrB (ParE) mechanismem účinku byly vyvinuty na tomtéž oddělení. Byly popsány základní parametry DNA topologie, typy a rozdělení topoisomeras, mechanismus účinku a struktura gyrasy a topoisomerasy IV a stručné shrnutí inhibitorů používaných v klinické praxi. V experimentální části byla pro hodnocení použita metoda enzymatického testování, pomocí níž byla vypočítána hodnota inhibiční koncentrace IC50. Byla zjišťována aktivita proti E. coli gyrase, E. coli topoisomerase IV, S. aureus...
|
|
|
Deriváty karbazolu a jejich vliv na teplotu tání duplexů DNA I.
Maršík, Lukáš ; Švec, Jan (vedoucí práce) ; Doležal, Martin (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Student: Lukáš Maršík Školitel: Mgr. Jan Švec, Ph.D. Odborný poradce: PharmDr. Kamil Kopecký, Ph.D., doc. PharmDr. Miroslav Miletín, Ph.D. Název diplomové práce: Deriváty karbazolu a jejich vliv na teplotu tání duplexů DNA I. Tato diplomová práce pojednává o přípravě takového derivátu karbazolu, který by nesl v polohách 3 a 6 objemné bazické skupiny a v poloze 9 alifatický řetězec zakončený azidovou skupinou. V teoretické části jsou popsány možné postupy, jak vytvořit na karbazolu či jiných aromatických strukturách základní funkční skupiny, dále pak možnosti navázaní alifatického řetězce na karbazolový dusík a v poslední části vytvoření bazických center na aromátech s funkční skupinou - vesměs se jednalo o bromderiváty. Experimentální část se již zabývá aplikací metod popsaných v teoretické části na struktuře karbazolu. Jako základní molekula byl použit 3,6-dibrom-9H-karbazol; byly zkoušeny metody záměny brómu za skupiny obsahující atom uhlíku či dusíku, následovalo vytvoření alifatického řetězce na dusíku karbazolu zakončeného azidovou skupinou a nakonec navázaní objemných bazických substituentů na funkčních skupinách karbazolu v polohách 3 a 6. Syntetizované molekuly byly popsány NMR...
|
|
|
Applications of descriptive set theory in mathematical analysis
Doležal, Martin ; Zelený, Miroslav (vedoucí práce) ; Holický, Petr (oponent) ; Zapletal, Jindřich (oponent)
Charakterizujeme různé typy σ-pórovitosti pomocí nekonečné hry a vítězných strategií. Použijeme modifikaci této hry k důkazu některých nových i známých vepisovacích vět pro σ-ideály σ-pórovitého typu v lokálně kompaktních metrických prostorech. Ukážeme exis- tenci uzavřené množiny, která je σ-(1 − ε)-symetricky pórovitá pro každé 0 < ε < 1, ale není σ-1-symetricky pórovitá. Dále ukážeme, že množina unitárních reprezentací konečné abelovské grupy Γ na nekonečně- dimensionálním separabilním komplexním Hilbertově prostoru H, které jsou realizovatelné akcí, je residuální v Rep(Γ, H). 1
|
|
|
Kationické tenzidy jako hydrolytické micelární katalyzátory
Janošcová, Petra ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Souhrn Kationické tenzidy jako hydrolytické micelární katalyzátory Petra Janošcová Byla testována hydrolytická účinnost řady kationických tenzidů při rozkladu organofosforového pesticidu fenitrothionu. Všechny testované tenzidy zvyšovaly rychlost rozkladu fenitrothionu, což bylo důkazem probíhající micelární katalýzy. U některých látek byl patrný pokles rychlosti hydrolýzy při nejvyšších koncentracích, což bylo důsledkem jevu nazývaného efekt prázdných micel. Nejvyšší hydrolytické výkonnosti bylo dosaženo u tenzidů, které v molekule obsahovaly ionizovatelné hydroxylové skupiny. Zcela kromobyčejnou výkonnost vykazoval farmaceuticky významný tenzid benzoxonium.
|
|
|
Deriváty pyrazinu jako potencionální antituberkulotika
Slavětinská, Lenka ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Hartl, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Řešitel: Mgr. Lenka Slavětinská Školitel: Prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Název rigorózní práce: Deriváty pyrazinu jako potencionální antituberkulotika Cílem této práce byla příprava derivátů pyrazin-2-karboxylové kyseliny, konkrétně substituovaných anilidů 5-chlorpyrazin-2-karboxylové kyseliny s potencionálním antimykobakteriálním účinkem. V teoretické části práce je uveden stručný souhrn základních údajů týkajících se tuberkulózy (TBC) jako infekčního onemocnění. Zejména problematika zabývající se etiologií a patogenezí TBC, epidemiologií, jak běžné tak rezistentní formy TBC a rozsáhlou problematikou týkající se koinfekce TBC a HIV. Dále je zde popsána základní terapie TBC - antituberkulotika první a druhé linie a nadále i léčiva nacházející se v různých fázích klinických studií. Zvláštní pozornost je věnována pyrazinamidu (PZA), jehož analoga jsou hlavním tématem této práce. V této části jsou uvedeny zejména jednoduché možnosti chemických obměn pyrazinového jádra (prováděných již od 50. let minulého století a pokračujících dodnes) a informace ohledně možných specifických mechanismech účinku pyrazinamidu. V praktické části této práce je prezentována příprava 12 nových, v...
|
|
|
Applications of descriptive set theory in mathematical analysis
Doležal, Martin
Charakterizujeme různé typy σ-pórovitosti pomocí nekonečné hry a vítězných strategií. Použijeme modifikaci této hry k důkazu některých nových i známých vepisovacích vět pro σ-ideály σ-pórovitého typu v lokálně kompaktních metrických prostorech. Ukážeme exis- tenci uzavřené množiny, která je σ-(1 − ε)-symetricky pórovitá pro každé 0 < ε < 1, ale není σ-1-symetricky pórovitá. Dále ukážeme, že množina unitárních reprezentací konečné abelovské grupy Γ na nekonečně- dimensionálním separabilním komplexním Hilbertově prostoru H, které jsou realizovatelné akcí, je residuální v Rep(Γ, H). 1
|
host ::
RSS.