|
| |
|
|
Tau protein, a biomarker of Alzheimer's disease: in vitro phosphorylation and tau-reactive antibodies characterization
Hromádková, Lenka ; Bílková, Zuzana (vedoucí práce) ; Fialová, Lenka (oponent) ; Krejsek, Jan (oponent)
Tau protein je s mikrotubuly asociovaný protein, který se nachází v axonech neuronů. Je klíčovou molekulou podílející se významně na patogenezi Alzheimerovy nemoci (AN), která je nejčastější příčinou stařecké demence. Tau patří do skupiny tzv. přirozeně nesbalených proteinů postrádajících globulární strukturu a vysoce náchylných k post-translačním modifikacím. Za patologických podmínek je tau protein abnormálně modifikován a chybně sbalován, což v důsledku vede k jeho oligomerizaci a agregaci do párově helikálních filament, které jsou základní jednotkou neurofibrilárních klubek, histopatologických útvarů typických pro AN. Současné léky používané v léčbě AN neurodegenerativní procesy pouze zpomalují a lék zcela zastavující vlastní rozvoj nemoci stále chybí. V současnosti je velmi slibným a rozvíjejícím se terapeutickým přístupem imunoterapie. Testována je také imunomodulace pomocí intravenózních imunoglobulinových preparátů (IVIG), které obsahují velké množství přirozených protilátek běžně se vyskytujících u zdravé populace. Objevení přirozeně se vyskytujících protilátek reaktivních s tau proteinem (nTau-Ab) v tělních tekutinách u pacientů s AD, zdravých kontrol, i jejich přítomnost v IVIG preparátech odstartovaly snahy lépe pochopit jejich úlohu u AN a jejich potenciální terapeutické využití....
|
|
|
Segmentace mikroskopických snímků pomocí level-set metod
Bílková, Zuzana ; Kučera, Václav (vedoucí práce)
Název práce: Segmentace mikroskopických snímků pomocí level-set metod Autor: Zuzana Bílková Katedra: Katedra numerické matematiky Vedoucí diplomové práce: RNDr. Václav Kučera, Ph.D., KNM, MFF UK Konzultant: RNDr. Jindřich Soukup, ÚTIA, AV ČR Abstrakt: Tato diplomová práce představuje novou metodu pro segmentaci snímků pořízených mikroskopem s fázovým konrastem. Cílem je oddělit buňky od pozadí. Algoritmus je založen na variační formulaci level set metod, tedy na minimalizaci funkcionálu popisujícího level set funkci. Funkcionál je minimalizován gradientním tokem popsaným evoluční parciální diferenciální rovnicí. Nejdůležitější nové myšlenky jsou inicializace pomocí prahování a nové členy ve funkcionálu, které zrychlují konvergenci a zpřesňují výsledky. Také jsme použili nové funkce napsané v jazyce C k počítání gradientu a Laplaceova operátoru. Tato implementace je třikrát rychlejší než standardní funkce v MATLABu. Dosáhli jsme lepších výsledků než algoritmy, se kterými jsme metodu porovnávali. Klíčová slova: Segmentace, level set metody, aktivní kontury Title: Segmentation of microscopic images using level set methods Author: Zuzana Bílková Department: Department of Numerical Mathematics Supervisor: RNDr....
|
|
|
Tvorba pracovních listů pro rozvíjení čtenářských dovedností pro žáky 6. ročníků vybrané ZŠ
Bílková, Zuzana ; Králíková, Andrea (vedoucí práce) ; Brož, František (oponent)
Práce se zabývá procesem vytváření didaktického materiálu pro žáky šestých tříd základní školy. Sleduje faktory ovlivňující výběr titulů pro četbu žáků a výběr konkrétního úryvku a následně se zaměřuje na tvorbu úloh k textům. Vychází z analýzy vybraných čítanek a z platných pedagogických dokumentů. Cílem práce je vytvoření souboru pracovních listů, určených žákům k výuce literatury a rozvíjení čtenářských dovedností. Pracovní listy mají zároveň žáky motivovat k mimoškolnímu čtení současné české literatury pro děti a mládež. V závěru práce jsou předloženy komentáře k jednotlivým pracovním listům, které reflektují proces výběru konkrétních úryvků a úloh a zároveň komentují možnosti využití tohoto didaktického materiálu ve výuce. Klíčová slova český jazyk a literatura, pracovní listy, čítanky, didaktické pomůcky, současná česká literatura pro děti a mládež, výuka literatury, druhý stupeň základní školy, motivace ke čtení
|
|
|
Klíčové psychické charakteristiky příslušníků ozbrojených složek pro zvládání dlouhodobého pobytu se zvýšeným rizikem ohrožení života: Význam sociální opory u vojáků ISAF
Bílková, Zuzana ; Štětovská, Iva (vedoucí práce) ; Kebza, Vladimír (oponent) ; Stehlík, Miloslav (oponent)
Mgr. Zuzana Bílková Klíčové psychické charakteristiky příslušníků ozbrojených složek pro zvládání podmínek se zvýšeným rizikem ohrožení života: Význam sociální opory u vojáků mise ISAF Abstrakt Tato práce se zaměřuje na téma sociální opory u vojáků, kteří se zúčastnili zahraniční vojenské mise ISAF. Předpokládáme, že vojenské prostředí je velmi specifické právě v oblasti mezilidských vztahů, a tím tedy i v oblasti sociální opory. Zahraniční vojenská mise klade na vojáky vysoké požadavky, ocitají se v prostředí, ve kterém je bezprostředně ohrožen jejich život, jsou omezeni v kontaktu se svými rodinami, jsou omezeni ve způsobu trávení svého volného času. Někteří vojáci proto po návratu z mise zažívají různé psychické problémy. Tato práce mapuje přínos sociální opory v průběhu mise a zabývá se otázkou, zda sociální opora může pomoci vojákům zahraniční vojenskou misi zvládnout. V teoretické části jsou mapována zejména tři hlavní témata - specifické nároky armádního prostředí, stres se zaměřením na vliv stresu na zdraví a výkon jedince a sociální opora. Uvádíme jednotlivé přístupy ke zkoumání sociální opory, metodologická úskalí, pozitivní i negativní dopady sociální opory. V našem výzkumu přitom využijeme dělení sociální opory dle autora Erica Sonderena (Sonderen, 1991, 2012a). V empirické části je představen...
|
|
|
Segmentace mikroskopických snímků pomocí level-set metod
Bílková, Zuzana ; Kučera, Václav (vedoucí práce) ; Zitová, Barbara (oponent)
Název práce: Segmentace mikroskopických snímků pomocí level-set metod Autor: Zuzana Bílková Katedra: Katedra numerické matematiky Vedoucí diplomové práce: RNDr. Václav Kučera, Ph.D., KNM, MFF UK Konzultant: RNDr. Jindřich Soukup, ÚTIA, AV ČR Abstrakt: Tato diplomová práce představuje novou metodu pro segmentaci snímků pořízených mikroskopem s fázovým konrastem. Cílem je oddělit buňky od pozadí. Algoritmus je založen na variační formulaci level set metod, tedy na minimalizaci funkcionálu popisujícího level set funkci. Funkcionál je minimalizován gradientním tokem popsaným evoluční parciální diferenciální rovnicí. Nejdůležitější nové myšlenky jsou inicializace pomocí prahování a nové členy ve funkcionálu, které zrychlují konvergenci a zpřesňují výsledky. Také jsme použili nové funkce napsané v jazyce C k počítání gradientu a Laplaceova operátoru. Tato implementace je třikrát rychlejší než standardní funkce v MATLABu. Dosáhli jsme lepších výsledků než algoritmy, se kterými jsme metodu porovnávali. Klíčová slova: Segmentace, level set metody, aktivní kontury Title: Segmentation of microscopic images using level set methods Author: Zuzana Bílková Department: Department of Numerical Mathematics Supervisor: RNDr....
|
|
|
Proteomová analýza secernovaných proteinů Francisella tularensis
Konečná, Klára ; Hernychová, Lenka (vedoucí práce) ; Krejsek, Jan (oponent) ; Bílková, Zuzana (oponent)
Název disertační práce: Proteomová analýza secernovaných proteinů Francisella tularensis Fakultativní intracelulární bakterie F. tularensis je původcem onemocnění zvaného tularemie. Přestože je k dněšní době dostupná široká škála nových poznatků týkající se tohoto patogena, doposud mechanismy patogeneze onemocnění tularemie nebyly zcela objasněny. Náplň naší práce se zakládala na analýze a identifikaci proteinů kultivačních filtrátů bakterie F. tularensis tří kmenů (LVS, FSC200, SchuS4). Mezi identifikovanými proteiny byly vyhledávány kandidátní sekretované proteiny a proteiny, které by mohly pomoci s objasněním molekulárních mechanismů patogeneze onemocnění vyvolaného F. tularensis. Nejlepším identifikovaným proteinovým kandidátem na sekreci je enzym kyselá fosfatáza, u kterého bylo prokázáno, že sehrává důležitou roli při úniku bakterie F. tularensis z fagosomu. Pozornost byla také věnována nově popisovanému mechanismu bakteriální sekrece, zprostředkovaného membránovými vesikly. Pomocí transmisní elektronové mikroskopie bylo prokázáno, že F. tularensis kmene LVS a FSC200 sekretuje membránové vesikly do extracelulárního prostředí. Klíčová slova: Francisella tularensis, sekreční systémy, proteiny kultivačního filtrátu, sekretované proteiny, vesikly vnější membrány
|
|
|
Možnosti průtokové cytometrie v analýze reakce buněk na genotoxický stres
Havelek, Radim ; Řezáčová, Martina (vedoucí práce) ; Bílková, Zuzana (oponent) ; Štětina, Rudolf (oponent)
Možnosti průtokové cytometrie v analýze reakce buněk na genotoxický stres Průtoková cytometrie je moderní metoda analýzy imunofenotypu a funkčních charakteristik buněk. Je to technika kvantitativní analýzy jedné buňky, která k detekci využívá optických vlastností buněk unášených v proudu nosné kapaliny stanovených paprskem laseru. Analýza a rozlišení buněk je založena na jejich velikosti, granularitě, a zdali buňka nese fluorescenční molekulu ve formě konjugované protilátky, nebo fluorescenčního barviva. Buňky mohou být značeny fluorescenčními barvivy, inkubovány s fluorogeními substráty, označeny fluorochromy konjugovanými protilátkami specifickými k molekulám na povrchu nebo uvnitř buňky. Průtokové cytometry jsou multiparametrické, zaznamenávající několik měření z jedné buňky. Z tohoto důvodu jsme schopni identifikovat homogenní subpopulaci v heterogenní populaci buněk. Buňky vystaveny působení genotoxických agens reagují kvantitativně a kvalitativně v závislosti na absorbované dávce a buněčném typu. S cílem vypořádat se s poškozením buněčné DNA dojde k aktivaci dočasné zástavy buněčné cyklu a mechanismů odpovědi na poškození DNA, jež poskytnou nezbytný čas k její účinné opravě. Za situace kdy tyto mechanismy selžou, nebo poškození DNA je neopravitelné, dojde k buněčné smrti apoptózou, nebo je...
|
|
|
Biological activities of Lavandula angustifolia essential oil
Bílková, Zuzana ; Martin, Jan (vedoucí práce) ; Tůmová, Lenka (oponent)
Zuzana Bílková, Biologické účinky silice Levandule úzkolisté, diplomová práce, Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, vedoucí diplomové práce: PharmDr. Jan Martin, PhD., Hradec Králové, 2013, 72 stran. Diplomová práce s názvem "Biologické účinky silice Levandule úzkolisté" se zabývá biologickými aktivitami a složením silice levandule úzkolisté, konkrétně antifungální, antioxidační, protizánětlivé, nematicidní, repelentní a cytotoxicitu. Cílem bylo zjistit, zda daná silice může být použita v těchto indikacích a stát se tak přírodní náhradou chemických látek nešetrných k životnímu prostředí. Antifungální aktivita byla testována proti nejběžnějším lidským patogenům, nízká cytotoxicita potvrzuje, že silice může být použita u lidských buněk, aniž by způsobila poškození, antioxidační aktivita byla testována na NO reakci, nematicidní aktivita silice byla zkoušena jako ochrana zemědělských plodin, kde nematoda způsobují velké ekonomické ztráty. Repelenční aktivita se zkoumá pro ochranu okrasných i užitných rostlin. Klíčová slova: Lavandula angustifolia, biologické aktivity, protizánětlivý, antifungální, cytotoxicita, repelentní, antioxidační, nematicidní, silice
|
|
|
Molecular detection of invasive fungal disease in immunocompromised patients
Bašková, Lenka ; Živný, Pavel (vedoucí práce) ; Bílková, Zuzana (oponent) ; Trka, Jan (oponent)
4 2. Souhrn Molekulární detekce invazivních mykotických onemocnění u imunokompromitovaných pacientů V dizertační práci se mi podařilo vyvinout tři PCR metody pro kvantitativní detekci a identifikaci kvasinkové a plísňové DNA. Dvě metody založené na kvantifikaci v reálném čase s názvem PanAC PCR a "panfungal" PCR byly navrhnuty tak, aby detekovaly a kvantifikovaly široké spektrum plísní a kvasinek způsobujících invazivní mykotická onemocnění. Význam metod pro klinické využití byl v rámci standardizace testován retrospektivně na souborech pacientů s již dokumentovanými invazivními mykózami a dále pak prospektivně na souborech pacientů s vysokým rizikem invazivní mykózy. Vzhledem k významu přesné identifikace původce onemocnění byla vyvinuta "semi-nested" PCR s fluorescenční detekcí pomocí kapilární elektroforézy umožňující rychlou identifikaci plísně či kvasinky v klinickém materiálu, který byl pozitivní v jedné ze širokospektrých screeningových PCR. Možnost klinického využití této metody byla taktéž testována na populaci pacientů s dokumentovanou invazivní mykózou.
|
host ::
RSS.