|
|
Vyšetření gonozomálních mozaiek metodou FISH
ŠUTKOVÁ, Jana
Ve své bakalářské práci jsem se zabývala vyšetřením gonozomálních mozaiek. Mozaicismus můžeme popsat jako stav, při kterém se v jednom organismu nachází dvě a více odlišných buněčných linií pocházející z jedné zygoty. U žen se nejčastěji vyskytuje mozaiková forma zvaná Turnerův syndrom a Syndrom XXX neboli superžena. V mužské populaci je nejčastěji detekován Klineferterův sydnrom a syndrom XYY (supermuž). Mozaicismus lze vyšetřit fluorescenční in situ hybridizací. V teoretické části své bakalářské práce jsem se zaměřila na vrozený chromozomální mozaicismus, zejména na jeho varianty jako je Klineferterů syndrom, Turnerův syndrom, Sydrom XXX a Syndrom XYY. Dále jsem se v této části zabývala fluorescenční in situ hybridizací. Popsala jsem fluorescenci jako takovou a následně její aplikaci v klinické praxi, kde je využíváno několik typů fluorescenšní in situ hybridizace. V praktické části jsem se věnovala vyšetření počtu gonozomálních chromozomů metodou fluorescenční in situ hybridizace. Tuto část jsem vypracovala v laboratoři Zdravotně sociální fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích. Vyšetřovala jsem 40 zanonymizovaných vzorků od 20 probandů. U každého proběhl odběr kapilární krve a bukálního stěru. Po hybridizaci vzorků s centromerickou sondou pro chromozomy X a Y byla provedena mikroskopie. V poslední části této bakalářské práce jsem se věnovala zpracování výsledků získaných fluorescenčním mikroskopováním. U žen tedy bylo detekováno celkem 6 případů mozaicismu (procento mozaických buněk bylo nad přípustnou hranici). U mužů byly celkem 2 případy zvýšeného počtu mozaických buněk.
|
|
| |
|
|
Vliv běžných pesticidů na lidské buňky
SLIVONĚ, Miroslav
V rámci této bakalářské práce byl zkoumán vliv terbuthylazinu-2-hydroxy (HTBA) na lidské buněčné kultury HepG2 a MG63 formou akutních testů toxicity in vitro, a to v koncentracích 0; 0,58; 0,8 a 8 mg/l. Experiment byl rozdělen do dvou částí. V první části byla zkoumána celková biologická aktivita (mortalita, specifická rychlost růstu, dilatace - aktivita cytoskeletu) pomocí mikroskopického zařízení Nikon Biostation IM-Q. Vyhodnocení získaných snímků proběhlo vizuálně, kdy nebyl jednoznačně potvrzen zásadní vliv HTBA. V druhé části experimentu, prováděném na vysokorozlišném světelném mikroskopu NanoTruth, byla vyhodnocena data odpovídající koncentraci 8 mg/l HTBA a data z kontrolního experimentu bez přidaného HTBA testované na buněčné kultuře HepG2. Vyhodnocení získaných obrazových dat proběhlo matematicky, metodou optického toku. Z výsledných hodnot optického toku byla zjištěna nižší vnitrobuněčná dynamika u exponovaného vzorku než u vzorku bez přítomnosti HTBA. To naznačuje možný negativní vliv HTBA na testovanou buněčnou kulturu.
|
|
|
Borrelia - host interactions: zoom in on the big picture.
STRNAD, Martin
The thesis was written with the intention to bring together cutting-edge imaging methods and applications in order to illustrate how imaging can answer pathogenesis-related questions in Lyme disease at various resolution scale. Correlative light and electron microscopy, atomic force microscopy-based single-molecule force spectroscopy and solution nuclear magnetic resonance have been used to shed light on the underlying mechanisms associated with Lyme disease Borrelia infection. Specifically, the key molecular players and interactions responsible for the variance in the pathogenicity and disease outcome of Borrelia species have been studied. The rationale behind such studies was highlighted by review articles, which are part of the thesis.
|
|
| |
|
|
Rovnovážné podmínky minerálů v Al-Mg- bohatém eklogitu z oblasti Světlíku (Moldanubická zóna)
Tecl, Martin ; Faryad, Shah Wali (vedoucí práce) ; Racek, Martin (oponent)
Český abstrakt Tato práce se zabývá strukturními vztahy v Al-Mg bohatém eklogitu s kyanitem z lokality Světlík-Suš v oblasti monotónní jednotky moldanubika. Analýzy minerálů a kompoziční mapování byly využity k detailnímu studiu a analýze vztahů a reakcí odpovědných za vznik a/nebo rozpad minerálů. Analyzované minerály byly porovnány s chemickým složením minerálů z ostatních eklogitů a granátických pyroxenitů ze studované lokality. Na základě celkového chemického složení horniny a analýz minerálů je studovaný eklogit s kyanitem srovnatelný spíše s granátickým pyroxenitem. Stabilními minerály v eklogitové facii byly granát, jadeitem bohatý klinopyroxen, Cr-kyanit a Cr-bohatý klinozoisit/zoisit, který je přeměněn na tabulární pseudomorfózu. Hornina vykazuje jasný důkaz o přetisku v podmínkách granulitové facie. Bylo rozpoznáno celkem 9 typů symplektitů. Většina vznikla v podmínkách granulitové facie. Kompoziční mapy Cr-kyanitů ukazují difúzi Cr z kyanitu do granátu během podmínek granulitové facie. Po překročení vrcholové teploty v podmínkách granulitové facie a na přechodu do amfibolitové facie byly symplektity s klinopyroxenem a ortopyroxenem přeměněny v amfiboly, které nyní tvoří podstatnou část horniny. Klíčová slova: eklogit, mikroskopie, chemické složení minerálů
|
|
|
Identification and characterization of ciliary tip proteins
Gorilák, Peter ; Varga, Vladimír (vedoucí práce) ; Lánský, Zdeněk (oponent) ; Dean, Samuel (oponent)
Distální konec řasinky/bičíku, také známý jako doména ciliární špičky (CTD), je nepostradatelná pro strukturu a funkci eukaryotických řasinek. Lepšímu porozumění této domény brání nedostatečné znalosti jejích proteinových komponentů. Cílem dizertační práce bylo ověřit lokalizaci vybraných známých proteinů CTD savčích řasinek, a testovat lokalizaci kandidátních CTD proteinů, jejichž ortology se nacházejí na špičce bičíku evolučne vzdáleného prvoka Trypanosoma brucei. Pomocí našeho lokalizačního postupu jsme identifikovali dva proteiny, které výrazně lokalizují do CTD primární řasinky. Jeden z těchto proteinů, ZC2HC1C, navíc také lokalizuje do stacionárních bodů podél axonemy, jejichž pozice se shodují s místy zastavení a otáčení intraflagelárních vlaků. Předpokládáme, že se může jednat o konce sub-distálně končících axonemalních mikrotubulů. Dále prokazujeme, že protein ULK4 lokalizuje do CTD pohyblivých ependymálních řasinek, ale ne do CTD primárnich řasinek, což je v souladu s dříve publikovanými fenotypy u ULK4 knock- outových myší a dokládá rozdíly ve složení CTD těchto dvou typů řasinek. Nakonec jsme ukázali, že Expanzní mikroskopie je rychlá a robustní super-rezoluční metoda, vhodná pro ultrastrukturální a lokalizační studie CTD savčích řasinek a bičíků T. brucei.
|
|
|
Dynamika mikrodomén plasmatické membrány kvasinek
Oláhová, Dominika ; Zahumenský, Jakub (vedoucí práce) ; Vopálenská, Irena (oponent)
Plazmatická membrána buněk se skládá ze specializovaných domén, které se liší svým tvarem, funkcí a velikostí. Toto rozdělení umožňuje buňkám koordinovat a oddělit velké množství různorodých procesů. Poruchy organizace buňky na úrovni membránových domén je stále více spojováno se vznikem patologických poruch. Svou roli mají mikrodomény též ve virulenci patogenních organismů, např. některých druhů kvasinek. Jednou z nejlépe popsaných mikrodomén plazmatické membrány kvasinek je MCC (membránový kompartment argininové permeázy Can1), jenž je stabilizován proteinovým komplexem zvaným eisosome. Složení této mikrodomény je detailně popsáno, dynamika jednotlivých komponent v bazálním stavu (tj. bez stresu) dosud popsána nebyla. Cílem této práce je podrobným přehledem dostupné literatury shrnout současné poznatky o dynamice proteinů této mikrodomény a jejím vztahu s ostatními doménami buněčných membrán. Práce zároveň prostřednictvím pokročilé fluorescenční metody FRAP (česky obnova fluorescence po fotovybělení) na vlastním experimentu ukazuje, že v bazálním stavu dochází k výměně jednotlivých molekul Nce102 v mikrodoméně MCC/eisosom. Klíčová slova: kvasinky, plazmatická membrána, membránové domény, mikroskopie, FRAP, MCC, eisosom, Sur7, Nce102
|
|
|
Endoskopie s multimódovým optickým vláknem
Jákl, Petr ; Tučková, Tereza ; Pikálek, Tomáš ; Stibůrek, Miroslav ; Ondráčková, Petra ; Cifuentes, Angel S. ; Šiler, Martin ; Uhlířová, Hana ; Traegaardh, Johanna ; Čižmár, Tomáš
Optická mikroskopie je technikou pro zkoumání mikrosvěta pomocí světelných vln rozptýlených na částicích v prostoru vzorku. V oblasti lékařství, mikrobiologie a neurologie je jejím hlavním nedostatkem malá penetrační hloubka, kdy je velmi obtížné zobrazit struktury zanořené více než přibližně 1 mm do tkáně. Tradiční endoskopy s čočkou či tyčinkou s gradientním profilem indexu lomu (GRIN lens) zasáhnou tkáň v oblasti o průměru jednotek milimetrů, což je problematické u studia nervových tkání in vivo. Alternativou je využít k přenosu obrazu multimódových optických vláken (MMF), jejichž průměr je v nízkých stovkách mikrometrů. Tento přístup ovšem vyžaduje pokročilé tvarování vlnoplochy světla.
|
|
|
Characterization of closed mitosis in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe with perturbed lipid metabolism
Hohoš, Patrik ; Převorovský, Martin (vedoucí práce) ; Cebecauer, Marek (oponent)
[SK] Delenie eukaryotických buniek spočíva v procese mitózy. Ide o komplexný bunkový proces, ktorý je potrebné správne regulovať. Na rozdiel od cicavčieho otvoreného typu mitózy, kedy sa jadrový obal rozpadá, mitóza kvasinky Schizosaccharomyces pombe prebieha vo vnútri neporušeného jadrového obalu. Takýto typ mitózy sa nazýva uzavretá mitóza. Bunkové jadro však prechádza morfologickými zmenami. Vplyvom aktivity mitotického vretienka sa bunkové jadro počas delenia sa naťahuje a vytvára typickú činkovitú štruktúru. Zvyšovanie pnutia vplyvom mitotického vretienka má za následok rozdelenie dvoch dcérskych jadier. Takéto rozsiahle zmeny povrchu jadrového obalu vyžadujú dostatočný prísun membránových fosfolipidov. Bunky s narušeným metabolizmom lipidov nie sú schopné vytvoriť dostatočnú zásobu lipidov a mitotické delenie v týchto bunkách zvyčajne vedie ku katastrofickej mitotickej udalosti inak nazývanej CUT (Cell Untimely Torn) fenotyp. Nedávne štúdie zároveň popisujú genetické interakcie medzi deléciami cbf11 a faktormi zodpovednými za údržbu štruktúry chromatínu prítomného v oblastiach centromér. Bolo dokonca ukázané vymiznutie fenotypu CUT po delécii niektorých faktorov prispievajúcich k centromerickým epigenetickým modifikáciám H3K9 v bunkách s deléciou transkripčného faktoru Cbf11. Táto diplomová...
|
host ::
RSS.