|
| |
|
|
Role iontů železa v metabolismu améby Naegleria gruberi
Ženíšková, Kateřina ; Konvalinka, Jan (vedoucí práce) ; Hlouchová, Klára (oponent)
Železo je biogenní stopový prvek, jehož dostupnost je pro organismy životně důležitá. V biologických systémech se vyskytuje železo ve formě iontů Fe2+ a Fe3+ , které jsou většinou inkorporovány do struktury hemu nebo železo-sirných center. Proteiny obsahující železo mají v organismu širokou škálu působnosti, od přenosu elektronů v dýchacím řetězci (Rieskeho proteiny, cytochromy), přes podílení se na syntéze DNA (ribonukleotidreduktasy), až po účast v Krebsově cyklu (akonitasa a sukcinátdehydrogenasa). Naegleria gruberi je volně žijící améba, známá pro svou příbuznost s patogenní amébou Naegleria fowleri, způsobující primární améboidní meningoencefalitidu. Zajímavé je, že v jejím genomu jsou obsaženy geny pro aerobní i anaerobní metabolismus. V rámci této bakalářské práce byl zkoumán vliv dostupnosti iontů železa na metabolismus buněk Naegleria gruberi. Byly studovány změny aktivit enzymů vyskytujících se v různých metabolických drahách, a to u alkoholdehydrogenasy, glukokinasy, laktátdehydrogenasy, izocitrátdehydrogenasy, Fe-hydrogenasy, akonitasy a fumarasy. V závislosti na dostupnosti iontů železa byly zaznamenány největší změny u aktivit alkoholdehydrogenasy a hydrogenasy. Klíčová slova: železo, hem, železo-sirná centra, dostupnost iontů železa, Naegleria gruberi, metabolismus
|
|
|
Metabolismus železa a mědi u jednobuněčných mořských řas rodu Ostreococcus
Pilátová, Jana ; Šuťák, Róbert (vedoucí práce) ; Falteisek, Lukáš (oponent)
Nejmenší volně žijící eukaryot Ostreococcus tauri a jeho příbuzné druhy a ekotypy jsou vynikajícími modelovými organismy pro studium příjmu železa. Tato otázka má velký ekologický přesah s odkazem na život mořského fytoplanktonu v oceánských pouštích a dalších oblastech moří, s limitací železem, popř. také zdroji mědi, jejíž metabolismus je s železem zřejmě úzce spjat. Našimi pokusy jsme simulovali podmínky oceánů s limitujícími koncentracemi iontů železa a mědi a jako kontrolu jsme zvolili podmínky dostačující. Růst buněk se lišil zejména v závislosti na zdrojích železa, kdy bez jeho limitace rostly dvakrát i třikrát rychleji. Výjimkou byl O. lucimarinus, u nějž se limitace železem vůbec neprojevila. Zřejmě je velmi dobře adaptován na své přirozené prostředí otevřeného oceánu s vysokým osvitem a vyšší mírou limitace živinami v porovnání s ostatními ekotypy. Po druhém týdnu kultivace s přesazením do media se shodnými podmínkami jsme také prokázali vliv dostupnosti iontů mědi na růst řas, opět s výjimkou O. lucimarinus. Na koncentraci iontů železa také pozitivně závisí obsah hemu b a chlorofylu a a b, bez signifikantního vlivu dostupnosti iontů mědi. Na tyto látky úzce spjaté s fotosyntézou má vliv také cirkadiánní rytmus, kdy přes den jejich koncentrace narůstají a v noci opět klesají, tento efekt...
|
|
|
Efekt sulfidu sodného na vlastnosti modelových hemových senzorových proteinů s globinovou strukturou senzorové domény
Bartošová, Martina ; Martínková, Markéta (vedoucí práce) ; Man, Petr (oponent)
Sulfan se účastní různých fyziologických procesů a je přiřazován k signálním molekulám podobně jako oxid uhelnatý nebo oxid dusnatý. Cílem působení H2S mohou být například proteiny, enzymy, transkripční faktory nebo iontové kanály. V mnoha případech je efekt H2S způsoben modifikací klíčových zbytků cysteinu ve struktuře regulačních proteinů. V případě hemoproteinů může H2S regulovat tyto proteiny navíc také prostřednictvím interakce s iontem železa hemu za vzniku Fe(III)-SH komplexu nebo redukcí iontu železa s následnou formací Fe(II)-O2 komplexu. Tato diplomová práce se zabývá vlivem Na2S na modelové senzorové hemové proteiny s globinovou strukturou senzorové domény. Prvním studovaným proteinem je protein izolovaný z bakterie Anaeromyxobacter sp. kmen FW109-5 s histidinkinasovou aktivitou a globinovou strukturou senzorové domény (AfGcHK), druhým studovaným proteinem je protein izolovaný z bakterie Escherichie coli s diguanylátcyklasovou aktivitou a globinovou strukturou senzorové domény (YddV). UV-Vis spektrální analýzou byl prokázán vliv Na2S na oba modelové proteiny a jejich mutanty. Zvláště spektra YddV-HD Y43A v přítomnosti Na2S jsou unikátní, protože potvrzují vznik homogenního a příměsí prostého komplexu Fe(III)-SH v daném proteinu, zatímco u ostatních proteinů jsou zaznamenány pouze směsi...
|
|
|
Průzkum a hodnocení ekologického stavu vodních toků při zohlednění evropských standardů. Aplikace v modelovém povodí Rolavy.
Beranová, Zuzana ; Matoušková, Milada (vedoucí práce) ; Kliment, Zdeněk (oponent)
Tato práce se zabývá implementací požadavků Rámcové směrnice o vodní politice (2000/60/EC) v České republice. V modelovém povodí Rolavy v Krušných horách byl hodnocen ekologický stav hlavního toku a důležitých přítoků. Pro hodnocení byla využita dostupná hydrobiologická a hydrochemická data, doplněná o vlastní hydromorfologický průzkum metodou Hydroekologický monitoring (HEM, Langhammer, 2007). Výsledky terénního mapování byly porovnány s dvěma ekomorfologickými metodami: LAWA-FS (LAWA, 2000) a EcoRivHab (Matoušková, 2003, 2007). Ve výsledném hodnocení bylo zjištěno, že vodní útvar na horním toku Rolavy vyhovuje dobrému ekologickému stavu. Vodní útvar na dolním toku Rolavy a přítok Nejdecký potok byly klasifikovány jako nevyhovující dobrému ekologickému stavu. Povodí Rolavy je velice specifickým územím s vysokým potenciálem dosáhnout dobrého stavu v příštích letech.
|
|
|
Důležité role hemu: signál pro hem-detekující proteiny a detekční místo v plyn-detekujících proteinech
Fojtíková, Veronika ; Martínková, Markéta (vedoucí práce) ; Hudeček, Jiří (oponent)
Hem-obsahující senzorové proteiny jsou hemoproteiny, které jsou rozděleny do dvou skupin: hem-detekující a plyn-detekující proteiny. Funkce hem-detekujících proteinů je ovlivněna koncentrací hemu v okolí proteinu. Prostřednictvím navázání hemu k hem-detekujícímu proteinu (nebo naopak disociace hemu z hem-detekujícího proteinu) jsou ovlivněny mnohé fyziologické procesy v organismu, jako například regulace enzymové aktivity nebo interakce proteinu s DNA a další funkce, které jsou nezbytné pro přežití buněk. Plyn-detekující proteiny obsahují pevně vázanou molekulu hemu, ke které jsou vázány molekuly plynu (např. kyslík, oxid uhelnatý nebo oxid dusnatý) v závislosti na koncentraci molekul plynu. Navázání molekuly plynu k plyn-detekujícímu proteinu, aktivuje mechanismus, jehož prostřednictvím dochází k ovlivnění fyziologických procesů v organismu, jako například regulace enzymové aktivity nebo interakce proteinu s DNA. V této bakalářské práci jsou shrnuty dosavadní zjištěné poznatky o těchto hemoproteinech, publikované v odborných časopisech. Experimentální část této bakalářské práce se zabývá konkrétním modelovým hem-obsahujícím senzorovým proteinem. Je jím histidin kinasa s globinovou strukturou senzorové domény, izolovaná z mikroorganismu Anaeromyxobacter sp., kmen Fw 109-5 (AfGcHK). Náplní experimentální...
|
|
|
Hydromorfologický průzkum řeky Bíliny
Kyselka, Jan ; Matoušková, Milada (vedoucí práce) ; Langhammer, Jakub (oponent)
Hlavním cílem této práce je vyhodnocení a prezentace výsledků hydromorfologického průzkumu řeky Bíliny, která patří mezi nejvíce antropogenně ovlivněné vodní toky v České republice. Pro hodnocení byla použita metoda Hydroekologický monitoring (HEM, Langhammer, 2007), která je v souladu s Rámcovou směrnicí o vodní politice 2000/60/EC. Hodnoceno bylo 53 úseků řeky s celkovou délkou 31,99 km. Dále je v práci zhodnocen odtokový režim a stav ochrany vodních ekosystémů a zdrojů v povodí Bíliny. Klíčová slova: hydromorfologie, HEM, řeka Bílina
|
|
|
Návrh revitalizačních opatření v povodí Slubice na podkladě ekohydromorfologického průzkumu
Šmerousová, Kateřina ; Matoušková, Milada (vedoucí práce) ; Just, Tomáš (oponent)
Tato diplomová práce se zabývá ekohydrologickým stavem vodních toků, jakožto reakce habitatu vodních toků na vysokou míru využívání, regulace a další formy modifikace (protipovodňová ochrana, přehrazování, revitalizace vodních toků, klimatické změny či rozšíření nepůvodních druhů), a vodohospodářskými revitalizacemi za účelem odstranění nebo zmírnění negativních důsledků úprav vodních toků a zlepšení jejich ekologické funkce v krajině. V zájmovém povodí Slubice na území CHKO Žďárské vrchy byl proveden terénní průzkum na základě aplikace ekomorfologických metod EcoRivHab a HEM. Na podkladě zjištěné antropogenní upravenosti říční sítě, kvality vody, hydrologických poměrů, definování referenčních podmínek, vyhodnocení změn délky a tvaru říční sítě pomocí historických map a výsledků ekomorfologického průzkumu v zájmovém území byly identifikovány oblasti vyžadující obnovu a navržena vhodná revitalizační opatření za účelem zlepšení ekologického stavu vodních toků a dosažení "dobrého ekologického stavu" ve smyslu požadavků a cílů WFD.
|
|
|
Influence of dietary components and redox enzymes on intestinal microbiota proliferation in the tick \kur{Ixodes ricinus}
KUČERA, Matěj
Tato diplomová práce je zaměřená na posouzení vlivu složek diety na mikrobiální proliferaci ve střevech klíštěte Ixodes ricinus. Byla posouzena dynamika patogenu Borrelie afzelii v závislosti na přítomnosti/nepřítomnosti hemoglobinu v potravě. Byl demonstrován vliv střevního enzymu, duální oxidázy, na regulaci střevní bakteriální mikroflóry. Na základě výsledků RNA interference byl rovněž naznačen vliv duální oxidázy na ovipozici I. ricinus. Dodatek této práce popisuje optimalizaci klíštěcího in vitro krmeni pro nymfy I. ricinus.
|
|
| |
host ::
RSS.