|
|
Studium deformace tělesa metodami počítačové simulace
NOVOTNÝ, Pavel
Bakalářská práce se zabývá počítačovou podporou konstruování, zejména CAD systémem SolidWorks a prováděním simulací s jeho pomocí. Nejprve jsou konstrukční systémy rozděleny a popsány jejich základní vlastnosti a funkce. Dále se práce zabývá prací v programu SolidWorks, zejména postupem provádění simulací vlastností dílů.
|
|
|
The Interaction of Graphene Oxide with Humic Acids, a Computational Study
FERLIN, Stefan
This study was focused on the interactions of Graphene oxide with humic acids in aqueous solutions. Additionally, to this work, Graphene oxide and water interactions with and without the addition of ions were studied. The behavior of a fulvic acid in the presence of Graphene oxide has been investigated as well. The study was performed using computer simulations that were achieved by Molecular Dynamics simulations. These simulations provided useful data on a nanometer scale.
|
|
|
Syntéza sulfanylaminoderivátů cyklodextrinů a počítačová simulace tvorby jejich komplexů
Provazníková, Adéla ; Jindřich, Jindřich (vedoucí práce) ; Míšek, Jiří (oponent)
Tato diplomová práce pojednává o syntéze série 6I -N-monosubstituovaných β-CD, jejichž substituentem je různě dlouhý lineární řetězec obsahující disulfidickou vazbu a zakončený aminoskupinou. Celá série byla úspěšně připravena prostřednictvím nukleofilní substituce toluensulfonylové skupiny tosyl-β-CD diaminovou spojkou. V případě vazby nejkratší spojky (cystaminu) byl derivát připraven ve výtěžku 35 %. Při syntéze derivátů substituovaných spojkami odvozenými od di-, tri- a tetraethylenglyku byla výtěžnost dvojnásobná a pohybovala se mezi 66 a 85 %. Všechny tři spojky byly připraveny pomocí standardních chemických přeměn. Pro izolaci výslených derivátů byly vyvinuty optimální soustavy založené na n-butanolu. Abychom lépe pochopili chování cílových derivátů v roztoku, byly provedeny jejich molekulárně dynamické (MD) simulace. Látky byly připravovány pro použití při vývoji fluorescenčních chemosezorů. Za stejným účelem byla studována inkluze vybraných organických molekul do kavity β-CD pomocí molekulové dynamiky a optimalizována metoda pro MD výpočet jejich relativních vazebných energií. Přestože se ani po optimalizaci metoda nezdá dostatečně přesná, výsledky odpovídají řádem i znaménkem experimentálním hodnotám.
|
|
|
Počítačové studium skládání proteinů na zjednodušených modelech
Nierostek, Jakub ; Uhlík, Filip (vedoucí práce) ; Jirsák, Jan (oponent)
Cílem práce je navrhnout a popsat vhodný zhrubený model proteinu, na jehož základě bude studován protein-folding. Model bude implementován jako počítačový program, jeho vývoj v čase bude zajišťovat Hamiltonian Monte Carlo. Pomocí simulace na počítači bude zkoumán jak protein-folding samotný, tak veličiny, které jej charakterizují a podobnost nativní konfigurace skutečného a námi simulovaného proteinu. Klíčová slova: skládání proteinů, počítačová simulace, Hamiltonian Monte Carlo, zhrubené modely 1
|
|
|
Effect of acid-base equilibria on the association behaviour of polyelectrolytes
Staňo, Roman ; Košovan, Peter (vedoucí práce) ; Heyda, Jan (oponent)
Název práce: Vliv acidobazických rovnováh na asociační chování polyelektroly- tovů Autor: Roman Staňo Katedra: Katedra fyzikální a makromolekulární chemie Školitel: RNDr. Peter Košovan, Ph.D., Katedra fyzikální a makromolekulární chemie Abstrakt: Makromolekuly jejichž monomérní jednotky nesou náboj, jsou v přírodě rozšířenými stavebními bloky. Struktura a aktivita těchto makromolekul je ovlivněna množstvím náboje na polymerním řetězci, které může být regulováno například prostředníctvím pH. Makromolekulární materiály schopné reagovat na změny pH okolí jsou velice perspektivní pro aplikace jako nosiče pro cílené uvol- ňování léčiv, nebo jako reverzibilní hydrogely. Fundamentální principy regulace náboje prostřednictvím pH však stále nejsou dostatečně objasněny, a to jak v přírodních, tak syntetických systémech. Důvodem může být nedostatek vhodných teoretických modelů a výpočetních metod. V této práci jsme použili zrhubené modely a molekulové simulace, abychom porozuměli fyzikálním principům aci- dobazických rovnováh v makromolekulárních systémech ve vztahu k multiva- lenci a struktuře makromolekul. Představili jsme nový model komplexních koac- ervátů a použili jej k popisu fázové a rozdělovací...
|
|
|
Effect of acid-base equilibria on the association behaviour of polyelectrolytes
Staňo, Roman ; Košovan, Peter (vedoucí práce) ; Heyda, Jan (oponent)
Název práce: Vliv acidobazických rovnováh na asociační chování polyelektroly- tovů Autor: Roman Staňo Katedra: Katedra fyzikální a makromolekulární chemie Školitel: RNDr. Peter Košovan, Ph.D., Katedra fyzikální a makromolekulární chemie Abstrakt: Makromolekuly jejichž monomérní jednotky nesou náboj, jsou v přírodě rozšířenými stavebními bloky. Struktura a aktivita těchto makromolekul je ovlivněna množstvím náboje na polymerním řetězci, které může být regulováno například prostředníctvím pH. Makromolekulární materiály schopné reagovat na změny pH okolí jsou velice perspektivní pro aplikace jako nosiče pro cílené uvol- ňování léčiv, nebo jako reverzibilní hydrogely. Fundamentální principy regulace náboje prostřednictvím pH však stále nejsou dostatečně objasněny, a to jak v přírodních, tak syntetických systémech. Důvodem může být nedostatek vhodných teoretických modelů a výpočetních metod. V této práci jsme použili zrhubené modely a molekulové simulace, abychom porozuměli fyzikálním principům aci- dobazických rovnováh v makromolekulárních systémech ve vztahu k multiva- lenci a struktuře makromolekul. Představili jsme nový model komplexních koac- ervátů a použili jej k popisu fázové a rozdělovací...
|
|
|
Analýza a optimalizace tepelného chování budov
Nováková, Iva ; Gebauer, Günter (oponent) ; Šikula, Ondřej (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá výzkumem účinnosti obnovitelných a nízkopotenciálních zdrojů energie budov. Je založena na numerických simulacích sdílení tepla kancelářské budovy a jejích otopných a chladicích systémů v programu DesignBuilder. Jsou porovnány různé zdroje energie a způsoby ovládání vytápění a chlazení. Výsledky jsou hodnoceny z hlediska doby, po kterou nebylo dosaženo požadovaného komfortu v budově, a také z hlediska spotřeby energie a její ceny.
|
|
|
Analýza vnitřního klimatu lázeňského komplexu
Chadima, Tomáš ; Rubinová, Olga (oponent) ; Horká, Lucie (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá environmentálním hodnocením budov, konkrétně objektem Letních lázní v Karlově Studánce. První část práce popisuje tuto problematiku a legislativu. Také je zde popsán způsob experimentálního měření a způsoby měření vlhkosti. Druhá část se zabývá analýzou zadaného objektu, popisu vybraných obnovitelných zdrojů a popisu možných úprav objektu. Třetí část je věnována modelování a simulaci zadaného objektu v programu DesignBuilder. Pomocí modelu byly vytvořeny různé simulace s různými úpravami za účelem snížení energetické náročnosti objektu. Následně byly výsledky zhodnoceny a porovnány.
|
|
|
Systémy TZB v nemovitých památkách
Maurerová, Lenka ; Vlček, Milan (oponent) ; Kabele,, Karel (oponent) ; Doc.Ing. Martina Peřinková, Ph.D (oponent) ; Hirš, Jiří (vedoucí práce)
Předkládaná disertační práce se zabývá problematikou systémů TZB (konkrétně vytápěním, větráním a klimatizací, stíněním), které zajišťují požadované interní mikroklima v nemovitých památkách. V práci se tak vzájemně prolíná ryze technický obor TZB s obecnou filozofií památkové péče. Cílem mé disertační práce je analýza procesu péče o nemovité památky, se zaměřením na současný stav průzkumů a dokumentace systémů TZB. Dále se v práci zaměřuji na možnosti dočasného měření parametrů interního mikroklimatu v nemovitých památkách a na sestavení počítačového modelu (v nástroji BSim), určeného k simulaci různých provozních stavů ve vybraných budovách. K realizaci zvolených cílů byli vybráni tři reprezentanti nemovitých památek: historická aula Fakulty stavební Vysokého učení technického v Brně, Zámecký palmový skleník v Lednici na Moravě a vila Tugendhat. Na jmenovaných památkách probíhal několikaletý výzkum, jehož analýzu, vyhodnocení a závěry předkládám prostřednictvím této disertační práce. Záměry disertační práce rámcově korespondují i s nadnárodními zájmy. Předkládaný výzkum je např. v souladu s mezinárodním dokumentem - Chartou ICOMOS (Zimbabwe, 2003) - který se zaměřuje na analyzování, ochranu a stavební obnovu architektonických památek. Výzkum v oblasti nemovitých památek je taktéž podporován Evropskou unií např. prostřednictvím 7. Rámcového programu.
|
|
|
Interakce slabých polyelektrolytů s multivalentními ionty
Staňo, Roman ; Košovan, Peter (vedoucí práce) ; Heyda, Jan (oponent)
Prostřednictvím molekulárních simulací studujeme disociační chování slabých polykyselin s přídavkem soli. Slabé polykyseliny jsou makromolekuly, které ne- sou slabě kyselé skupiny a proto sa jejich ionizace mění s pH. Titrační křivka takové kyseliny se odchyluje od ideální - její ionizace je potlačena kvůli silnému odpuzování mezi nabitými skupinami na kontuře polykyseliny. Přítomnost soli v roztoku polykyse- liny zvyšuje ionizaci vlivem účinků elektrostatického stínění a kondenzace protiiontů. Vliv valence na ionizaci slabých polykyselin soli nebyl doposud zkoumán, i když hraje důležitou roli v biologických procesech. V této práci studujeme roztoky slabých poly- kyselin s přídavkem solí různé valence kationtů (+1,+2,+3) při konstantním poměru náboje kationtů k počtu polymérnych segmentů. Pozorujeme, že zvyšování valence ka- tiontů soli podporuje ionizaci polyelektrolytů způsobem, který se liší od efektu zvýšení iontové síly. Vyšší valence protiiontů vede k nižší hodnotě kritického Manningova pa- rametru a způsobuje silnou kondenzaci protiiontů, která vede k další ionizaci poly- elektrolytů v důsledku korelací mezi kondenzovanými protiionty a nabitými skupinami polyelektrolytů.
|
host ::
RSS.