|
|
Vliv sekvenátorů druhé a třetí generace na cgMLST analýzu blízce příbuzných bakteriálních kmenů.
Slavíček, David ; Sedlář, Karel (oponent) ; Nykrýnová, Markéta (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá vlivem sekvenátorů druhé a třetí generace na cgMLST analýzu bakteriálního genomu. V teoretické části byly popsány některé sekvenátory druhéa třetí generace a principy sestavování genomu. V praktické části pak byly použity nasekvenované genomy bakterií z FN Brno. Jedná se o genomy šesti bakterií Klebsiella pneumoniae, které byly nasekvenovány na dvou různých sekvenátorech, Illumina Miseqa Oxford Nanopore Technologies Minion. Tyto genomy byly sestaveny. Pro cgMLST analýzu byly vybrány vhodné geny a vyřazeny genomy, které se nepodařilo sestavit vdostatečné kvalitě. Následně byla cgMLST analýza provedena a výsledky graficky zobrazeny.
|
|
|
Registrace obrazů s využitím optimalizace pomocí automatické diferenciace
Slavíček, David ; Kolář, Radim (oponent) ; Vičar, Tomáš (vedoucí práce)
Práce se zabývá využitím automatické diferenciace v registraci obrazů. V teoretické části byly popsány kroky registrace obrazů a možné způsoby jejich realizace. V praktické části byl navržen algoritmus pro registraci afinně transformovaných obrazů s využitím automatické diferenciace. Algoritmus byl implementován. Byly navrhnuty dvě modifikace algoritmu. Dále byla sestavena testovací databáze sestávající z RTG snímků hrudníku. Na ní byl algoritmus otestován.
|
|
|
Registrace obrazů s využitím optimalizace pomocí automatické diferenciace
Slavíček, David ; Kolář, Radim (oponent) ; Vičar, Tomáš (vedoucí práce)
Práce se zabývá využitím automatické diferenciace v registraci obrazů. V teoretické části byly popsány kroky registrace obrazů a možné způsoby jejich realizace. V praktické části byl navržen algoritmus pro registraci afinně transformovaných obrazů s využitím automatické diferenciace. Algoritmus byl implementován. Byly navrhnuty dvě modifikace algoritmu. Dále byla sestavena testovací databáze sestávající z RTG snímků hrudníku. Na ní byl algoritmus otestován.
|
|
|
Vliv sekvenátorů druhé a třetí generace na cgMLST analýzu blízce příbuzných bakteriálních kmenů.
Slavíček, David ; Sedlář, Karel (oponent) ; Nykrýnová, Markéta (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá vlivem sekvenátorů druhé a třetí generace na cgMLST analýzu bakteriálního genomu. V teoretické části byly popsány některé sekvenátory druhéa třetí generace a principy sestavování genomu. V praktické části pak byly použity nasekvenované genomy bakterií z FN Brno. Jedná se o genomy šesti bakterií Klebsiella pneumoniae, které byly nasekvenovány na dvou různých sekvenátorech, Illumina Miseqa Oxford Nanopore Technologies Minion. Tyto genomy byly sestaveny. Pro cgMLST analýzu byly vybrány vhodné geny a vyřazeny genomy, které se nepodařilo sestavit vdostatečné kvalitě. Následně byla cgMLST analýza provedena a výsledky graficky zobrazeny.
|
|
| |
host ::
RSS.