|
|
Molecular Characterisation of Parvalbumin Gene: Evolutionary Insights and Forensic Applications for Fish Species Identification and Authentication
Mukherjee, Subham ; Horká, Petra (vedoucí práce) ; Kalous, Lukáš (oponent) ; Flajšhans, Martin (oponent)
Abstract Parvalbumin (pvalb), a low molecular weight calcium-binding protein, plays a crucial role in regulating Ca2+ switching in fast-twitch muscle fibres and has been identified as a major cause of fish-induced food allergies. The molecular evolution of pvalb genes in teleost fish and its cause, duplication of the whole genome, was investigated, revealing high diversity and complex gene repertoires, making detection and identification challenging. This study provides robust genomic evidence of the complex evolution of parvalbumin genes in teleost fish. In addition to its role as a potent allergen, the pvalb gene, a nuclear gene, can serve as a valuable molecular marker. Keeping this in mind, a real-time PCR assay is developed to detect and quantify two European anglerfish species simultaneously, Lophius piscatorius and Lophius budegassa, which are susceptible to illegal species substitutions in the global seafood trade. The assay targets the intronic region of the pvalb gene, demonstrating high specificity, efficiency, and robustness, making it a potential forensic tool to prevent food fraud and ensure the accurate identification of fish species. Furthermore, a standardised quantitative PCR-based method is presented for the β-pvalb gene in Lophius piscatorius, utilising a plasmid DNA calibrator...
|
|
|
Studium struktury a metabolismu spermií savců a ryb ve vztahu k procesu reprodukce
Koubek, Pavel ; Pěknicová, Jana (vedoucí práce) ; Komrsková, Kateřina (oponent) ; Flajšhans, Martin (oponent)
4. áVĚR V rámcistudiaspermiíkostnatýcha chrupavčitýchrybby|vytvořenkomp|exníprotoko| optima|izovanýproimunof|uorescenčníznačeníproteinůkapřícha jeseteříchspermií. Tento protoko|'vycházejícíz postupupro imunof|uorescenčníznačenína savčích spermiích,ref|ektujepředevŠímjednoduššía snáze poŠkodite|noustruktururybích spermií.Je tak minima|izovánomoŽnépoškozeníběhemzpracovánívzorkůa vznik nespecifickýchartefaktů,kteréby moh|ynegativněov|ivňovatvýs|edky.Vytvoření vhodnéhoprotoko|upro imunof|uorescenčníznačeníje tak dů|eŽiténejen pro výzkumnéexperimenty,a|ei proap|ikačnívyuŽití'např.při hodnoceníkva|ityspermií' kdyje reprodukovate|nostmetodynezbytná. Při studiu energetickéhometabo|ismu,zajišťujícíhopohyb kapříchspermií,by|a s vyuŽitímspecifickémonok|onálníproti|átkypotvrzenapřítomnostminimá|nědvou isoforem kreatin kinasy (cK)' tvořícíchATP-transportníkyvad|o.Na modeIu demembranizovanýchkapříchspermiíby| prokázánvýznamtohototransportního mechanismua schopnostcytop|asmatickéCK umoŽnitcAMP_nezávis|ouiniciaci f|age|árníhopohybua jeho udÉení.Vdalšíprácizbýváověřitpředevšímhypotézu, zda-lije ú|ohafosfokreatinuv kapříchspermiíchprimárnětransportnínebose jedná předevŠímo energetickézásoby. Studiumspermiíchrupavčitýchryb by|ozaměřeno na strukturuspermiíjesetera ma|éhos vyuŽitímskenovacíhoi...
|
|
|
Molekulární fylogeografie lína obecného Tinca tinca (Linnaeus, 1758)
Lajbner, Zdeněk ; Kotlík, Petr (vedoucí práce) ; Flajšhans, Martin (oponent) ; Macholán, Miloš (oponent)
Lín obecný Tinca tinca (Linnaeus, 1758) je ceněná konzumní ryba, jejíž oblastí přirozeného výskytu jsou Evropa a Asie, ale v současnosti se díky introdukcím vyskytuje v mnoha oblastech mírného a subtropického pásma po celém světě. Prostorová genetická analýza variability sekvencí čtyř nezávislých genů (intronů tří jaderných genů a mitochondriální DNA) odhalila dvě hlavní skupiny populací, z nich každá je jen málo geograficky strukturovaná, ale které se vzájemně významně liší. Lokalizovala rovněž hlavní geografické bariéry v toku genů (shodující se ve více genech), které jsou způsobeny pouze částečně se překrývajícím rozšířením dvou relativně vzdálených evolučních linií-Západní a Východní. Tyto linie mají pravděpodobně původ v odlišných glaciálních refugiích, ze kterých kolonizovaly své současné areály. Geny obou evolučních linií jsou také přítomny v evropských kulturních liniích. Východní evoluční linie se navíc vyskytuje v příměsích vpopulacích z volných vod západní Evropy, kde v některých oblastech dokonce početně převládá nad Západní linií. Toto je s největší pravděpodobností důsledek migrace zprostředkované lidskou činností. Ryby, lína nevyjímaje, jsou často vysazovány daleko od místa jejich původu, nehledě na genetickou podobnost a lokální adaptace. Nezřídka dokonce dochází k zarybňování...
|
|
| |
|
|
Diploidní, triploidní a tetraploidní karas stříbřitý Carassius auratus z dolního toku Dyje: první výsledky reprodukční charakteristiky a experimentální hybridizace
Flajšhans, Martin ; Lusková, Věra ; Vetešník, Lukáš ; Halačka, Karel ; Rodina, Marek ; Lusk, Stanislav ; Gela, David
Diploidní, triploidní a tetraploidní samci karasa stříbřitého Carassius auratus produkovali živé, pohyblivé spermie, schopné oplození. Spermie diploidního karasa byly haploidní, spermie triploidního karasa byly aneuploidní, spermie tetraploidního karasa byly hodnoceny jako aneuploidní nebo diploidní. U koncentrace spermií a podílu živých spermií se jevila tendence poklesu se vzrůstající ploidií a tento rozdíl byl průkazný u tetraploida.
|
|
|
Ploidie karasa stříbřitého v ČR z pohledu umělé reprodukce
Halačka, Karel ; Vetešník, Lukáš ; Flajšhans, M.
Populace karasa stříbřitého na území ČR prošla výraznými změnami - čistě triploidní unisexuální gynogenetická populace se změnila v diploidně-polyploidní komplex, v němž výrazné místo patří diploidům (na některých lokalitách takřka 80%) a ztrácí se v ní podíl (v první fázi tohoto přerodu relativně častých) triploidních samců a tetraploidů. Jedinci tohoto komplexu mají různou strategii rozmnožování, naznačující, že naše dělení jedinců karasa stříbřitého pouze na základě jejich ploidie je příliš hrubé a nevystihuje přesně poměry v populaci. Je pravděpodobné, že v budoucnosti bude možno (zejména na základě geneticko-molekulárních metod) rozdělit dané jedince jemněji a vyřešit tak i další otázky týkající se karasa stříbřitého, jako jeho původ a systematické zařazení.
|
host ::
RSS.