|
|
Dashboard pro hodnocení výsledků metatranskriptomické analýzy nástroji bioBakery
Hýl, Jan ; Jurečková, Kateřina (oponent) ; Bartoň, Vojtěch (vedoucí práce)
Metatranskriptomická analýza poskytuje informaci o právě exprimovaných genech organismu v době odebrání analyzovaného vzorku. Rozmach zkoumání genů přišel s vývojem sekvenačních technologií a technologickým pokrokem. Tato práce pojednává o nukleových kyselinách a jejich významu v genetice. Zabývá se pojmy metatranskriptom, metagenom a mikrobiom. Popisuje metodu sekvenování od značky Illumina a představuje software vhodný pro metatranskriptomickou analýzu. Následně práce zahrnuje vytvoření testovacího datasetu, vytvoření dashboardu pro vizualizaci dat a vyzkoušení tohoto dashboardu na testovacím datasetu.
|
|
|
Malý bytový dům
Bartoň, Vojtěch ; Bečkovský, David (oponent) ; Vystrčil, Jan (vedoucí práce)
Předmětem bakalářské práce je zpracování projektové dokumentace pro provedení stavby bytového domu. Objekt se nachází na okraji městské části Prštné města Zlín. Budova je navržena jako samostatně stojící zděný objekt zastřešený plochou zelenou střechou. Novostavba bytového domu má 3 nadzemní a 1 podzemní podlaží. Je navrženo 13 bytových jednotek různých velikostí a dispozic pro celkově 30 osob. Budova je navržena jako tradiční zděná stavba. Suterén, stropní konstrukce a schodiště jsou navrženy jako monolitický železobeton. Celý bytový dům je opatřen kontaktním zateplovacím systémem ETICS. Objekt byl posouzen z hlediska stavební fyziky a požární bezpečnosti.
|
|
|
Identification and analysis of regulon’s structures in Arabidopsis thaliana
Janigová, Patrícia ; Bartoň, Vojtěch (oponent) ; Schwarzerová, Jana (vedoucí práce)
This bachelor thesis focuses on the identification and analysis of regulon structures in a model organism from the plant kingdom Arabidopsis thaliana. The first part of the thesis deals with the regulation of gene expression in eukaryotes, techniques for inferring transcriptional units and tools for the analysis of these units. Subsequently, the laboratory data from Arabidopsis thaliana, including their preparation and preprocessing, are described in detail. The next section describes the process of deriving regulons using specific methods such as correlation coefficient and mutual information. This is followed by a detailed description of a custom algorithm for inferring potential regulon structures in Arabidopsis thaliana, which is implemented in Python. In the conclusion of the bachelor thesis, the obtained results are visualized, evaluated and compared with the available literature. The identification of potential MBF1 and ABI3 regulons is also discussed in detail, thus confirming the correctness and efficiency of the proposed approach.
|
|
|
Metagenomic analysis of animal gut microbioma based on diet
Spanakis, Martin Nikolaos ; Čejková, Darina (oponent) ; Bartoň, Vojtěch (vedoucí práce)
This bachelor’s thesis deals with the sequencing of the microbiome and its composi- tion. It focuses on the gut microbiome of animals, which differs among animals with different diets. The work describes theoretical knowledge about metagenomic analysis of the microbiome, such as sampling procedures, various sequencing methods and data processing. The practical part of the work includes the preparation of the dataset, which includes the collection of data and their preparation for the following metagenomic anal- ysis. The result of the work is the taxonomic classification of bacterial species in the samples and the analysis of their diversity according to the type of diet of individual animals.
|
|
|
Metodika zkoušek historických cihel a zdiva
Bartoň, Vojtěch ; Anton, Ondřej (oponent) ; Cikrle, Petr (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá metodikou třídění cihel plných pálených pro rekonstrukce historických staveb. V teoretické části je popsána technologie výroby cihel plných pálených a diagnostické metody, a to včetně jejich vyhodnocení. V praktické části této práce jsou tyto metody aplikované na vzorcích určených pro rekonstrukci cihelného mostu v Sedleci. Jsou sledovány změny ve struktuře cihel plných pálených v závislosti na opakovaném zmrazovaní a rozmrazování. Tyto změny jsou sledovány pomocí rezonanční metody a ultrazvukové impulsové metody.
|
|
|
The impact of cannabidiol consumption on oral microbiome composition
Richweissová, Viktória ; Bartoň, Vojtěch (oponent) ; Čejková, Darina (vedoucí práce)
The composition of oral microbiome plays a significant role in maintaining both oral, and overall systemic health. When in equilibrium, the oral microbiome maintains the oral cavity in health. However, certain ecological shifts in the microbiota allow pathogens to manifest and cause various oral and systemic diseases. The analysis of the oral microbiome makes it possible to define the role of its components in health and disease, and the effect of various therapeutic techniques on its composition. This bachelor's thesis investigates the possible effect of toothpaste with cannabidiol on oral microbiome. The aim of this work is the bioinformatics analysis of oral microbiome communities before and after using CBD toothpaste using pipeline QIIME 2.
|
|
|
Techniky mapování genomu k referenční sekvenci
Petrovský, Jan ; Sedlář, Karel (oponent) ; Bartoň, Vojtěch (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá nástroji používanými pro mapování genomu k referenční sekvenci. V teoretické části jsou popsány aktuálně využívané sekvenační technologie, ať už první generace nebo nejnovější technologie třetí generace, přehled nástrojů používaných pro sestavování genomu de novo, používané přístupy a nástroje pro mapování k referenci, program ART a s ním související datové formáty. Praktická část sestává z vytvoření testovacího datasetu NGS dat, vytvoření metrik vhodných pro vyhodnocení kvality mapování a jejich následné použití na vybrané mapovací nástroje.
|
|
|
Mobilní aplikace pro monitorování depresivních stavů
Kamenská, Veronika ; Bartoň, Vojtěch (oponent) ; Škutková, Helena (vedoucí práce)
Bakalářská práce Mobilní aplikace pro monitorování depresivních stavů má za cíl vytvořit funkční mobilní aplikaci v prostředí MIT app inventor. Tato aplikace nabízí několik testů pro zhodnocení psychického stavu a možností tato data odeslat. Součástí práce je následně vytvoření počítačového softwaru v prostředí Python, který slouží pro psychology, kteří mají možnost data z mobilní aplikace zobrazit a vyhodnotit psychický stav pacienta. V návaznosti na aplikaci také zhotovit PC software pro vyhodnocování stavu psychology, pro zefektivnění práce mezi jednotlivými konzultacemi. A v závěru práce statisticky vyhodnotit výsledky testovaní získané během zimního semestru roku 2020.
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.