|
|
Predikce efektu bodových mutací na interakci proteinu s nukleovými kyselinami
Štěpánková, Věra Tereza ; Novotný, Marian (vedoucí práce) ; Neuwirthová, Tereza (oponent)
Bodové mutace jsou nejčastějším typem mutací a mnohé z nich mohou mít patogenní efekt, je proto užitečné umět kvalitně a efektivně predikovat jejich vliv na daný protein, a právě proteiny interagující s nukleovými kyselinami jsou nezbytné pro většinu buněčných procesů. Pokrok ve výpočetních metodách a strojovém učení umožňuje vývoj stále kvalitnějších nástrojů pro predikci vlivu mutací na proteiny. Důležitou kategorií těchto prediktorů jsou nástroje pro predikci vlivu bodových mutací na interakce proteinů s nukleovými kyselinami. Tato práce se zaměřuje na aktuálně dostupné prediktory vlivu missense mutací na protein-NK interakce, které predikují kvantitativní změnu afinity proteinu a nukleové kyseliny a na základě této změny odhadují závažnost mutace. Pozornost je též věnována způsobům hodnocení kvality predikcí jednotlivých nástrojů. Klíčová slova: bodová mutace, predikce, interakce, mechanismus
|
|
|
Design, preparation and structural studies of biologically relevant protein variants of cancer-related Carbonic Anhydrase IX
Fejfarová, Adéla ; Maloy Řezáčová, Pavlína (vedoucí práce) ; Novotný, Marian (oponent)
4 Abstrakt Lidská karbonát lyáza IX (CA IX) je enzym nadměrně produkovaný v různých typech nádorů, díky čemuž představuje atraktivní cíl pro vývoj protinádorových léčiv. Nádorovým buňkám tento enzym pomáhá udržovat optimální intracelulární pH a okyselováním vnějšího prostředí podporuje růst nádoru. V lidském těle existuje 12 enzymaticky aktivních izoforem karbonát lyáz, které sdílejí sekvenčně a strukturně konzervovanou katalytickou doménu tvořenou převážně β-listy. Přestože je aktivita těchto enzymů účinně inhibovaná látkami obsahující sulfonamidovou funkční skupinu, vysoká sekvenční konzervovanost katalytické domény znesnadňuje návrh inhibitorů selektivních pro CA IX. K vývoji selektivních léčiv by mohl pomoc výzkum specifických vlastností CA IX. CA IX je transmembránový protein typu I tvořící dimer a obsahující unikátní N-koncovou "proteoglycan-like" doménu, mimobuněčnou katalytickou doménu a krátký cytoplazmatický C-koncovým segment. Z výše popsaných důvodů je karbonát lyáza IX předmětem pro strukturou-inspirovaný návrh léčiv. Avšak exprese a purifikace tohoto proteinu ve vysokých výtěžcích, stejně jako jeho krystalizace se ukázala být komplikovaná. Z tohoto důvodu byla připravena varianta CA IX obsahující šest aminokyselinových záměn pro rekombinantní expresi v E. coli. Některé z těchto šesti...
|
|
| |
|
|
Bytový dům Rozdrojovice
Zavřelová, Martina ; Sukop, Lukáš (oponent) ; Novotný, Miloslav (vedoucí práce)
Předmětem bakalářské práce je vypracování projektové dokumentace pro novostavbu bytového domu v Rozdrojovicích. Bytový dům je samostatně stojící objekt o devíti bytových jednotkách, čtyřpodlažní, podsklepený. Hlavní vstup do budovy je z jižní strany objektu. V nadzemních podlažích se nachází devět bytových jednotek, které jsou propojeny společnou hlavní chodbou se schodištěm a výtahem. V suterénu jsou společenské místnosti, sklepní kóje, kočárkárna, technická místnost a strojovna vzduchotechniky. Součástí každého bytu ve druhém až čtvrtém podlaží je balkon nebo terasa. Konstrukční systém objektu je stěnový zděný, příčný. Objekt je založen na železobetonové základové desce. Svislé nosné konstrukce jsou z keramického zdiva. Zateplení obvodových stěn tvořících obálku budovy je navržený certifikovaný systém ETICS. Stropy jsou navrženy jako monolitické železobetonové desky po obvodě vetknuté. Střecha je plochá jednoplášťová vegetační. Žádná z bytových jednotek není řešena jako bezbariérová pro osoby s omezenou schopností pohybu, avšak přístup do objektu bezbariérový je. V případě nutnosti je možné díky prostorným místnostem a chodbách v přízemních bytech změnit dispozici některého z bytů na byt bezbariérový. Materiál i barevnost fasády bere v potaz provedení okolní zástavby. Každý blok je odlišen jinou barvou fasády. Dešťová voda bude ze střechy odváděna do akumulační nádrže. Následně bude použita ve vnitřním odděleném dešťovém vodovodu pro splachování WC a zavlažování zahrady. Přebytečná voda bude vsakována na pozemku do vsakovací jímky. Součástí projektu je také energetický štítek. Navržený bytový dům spadá do klasifikační třídy "A - mimořádně úsporná".
|
|
| |
|
|
Rodinný dům Pohořelice
Čech, Patrik ; Novotný, Miloslav (oponent) ; Novotný, Miloslav (vedoucí práce)
Předmětem této bakalářské práce je zpracování projektové dokumentace pro provádění stavby rodinného domu v Pohořelicích. Dům je navržen jako dvoupodlažní. Konstrukční systém je stěnový, tvořený z pórobetonových tvárnic. Objekt je založen na základových pasech z prostého betonu. Stropní konstrukce jsou navrženy jako monolitické železobetonové. Objekt je zastřešen plochou jednoplášťovou střechou. Vnější stěny jsou zatepleny kontaktním zateplovacím systémem.
|
|
|
Rodinný dům Brno-Dolní Heršpice
Nazaruk, David Mychajlovyč ; Novotný, Miloslav (oponent) ; Novotný, Miloslav (vedoucí práce)
Předmětem zadané bakalářské práce je projektová dokumentace pro provedení stavby rodinného domu ve městě Brně v městské části Dolní Heršpice. Budova má stát v rozvíjející oblasti pro stavbu rodinných domů. Objekt je samostatně stojící a měl by sloužit pro život až 6 osobám. Budova je navržena jako dvoupodlažní s terasou a zahradou. Obě patra jsou nadzemní. Zastřešení tvoří jednoplášťová plochá střecha. Konstrukční systém domu je příčný stěnový, tvořený z broušených keramických cihelných bloků typu HELUZ FAMILY 2IN1 s integrovaným pěnovým polystyrenem. Objekt je založen na základových pasech z prostého betonu. Stropní konstrukce je navržena z keramických stropních panelů HELUZ. Schodiště spojující všechna podlaží je monolitické.
|
|
|
Kazuistika fyzioterapeutické péče o pacienta s diagnózou TEP kolenního kloubu
Novotný, Matyáš ; Martínek, Milan (vedoucí práce) ; Nováková, Tereza (oponent)
Autor: Matyáš Novotný Vedoucí práce: Mgr. Milan Martínek, Ph.D. Název: Kazuistika fyzioterapeutické péče o pacienta s diagnózou TEP kolenního kloubu Cíle: Cílem této bakalářské práce je zpracovat teoretické podklady vztahující se k diagnóze TEP kolenního kloubu. Speciální část bakalářské práce je zpracována za účelem vedení kazuistiky pacienta po implantaci TEP kolenního kloubu a zaznamenáním efektů vybraných postupů fyzioterapeutické péče. Metody: Tato bakalářská práce je složena z teoretické a speciální části. Teoretická část se zabývá rešerší odborné literatury pro pochopení stavby a funkce kolenního kloubu z pohledu anatomie, kineziologie a biomechaniky. Práce dále popisuje problematiku osteoartrózy a jejích léčebných intervencí, typy totální endoprotézy kolenního kloubu a operační postup při její implantaci. Teoretická část se ve svém závěru soustředí na možnosti řešení následné rehabilitace po implantaci TEP kolenního kloubu. Speciální část obsahuje vstupní a výstupní kineziologické vyšetření, cíle terapeutické péče a důkladný záznam terapeutických jednotek. Data pro vypracování speciální části byla sbírána v souvislosti plnění odborné souvislé praxe v Rehabilitační klinice Malvazinky. Výsledky: Užití vybraných fyzioterapeutických postupů vedlo ke zlepšení klinického stavu pacienta ve většině...
|
|
|
Vertikální zelené stěny
Utíkalová, Ivana ; Dulenčín, Juraj (oponent) ; Novotný, Marek (oponent) ; Košíčková, Ivana (vedoucí práce)
ABSTRAKT Pojmy vertikální zahrady, vertikální stěny, zelené stěny, živé stěny nebo zelené fasády lze označit jako názvy pro pěstování rostlin umístěných ve vertikální rovině, díky kterým se zakrývají stěny či sloupy různých objektů. Jsou definovány pod názvem vertikálně situované rostlinné výsadby, které dle použitých taxonů lze aplikovat do interiéru i exteriéru. Současná architektura stále více hledá způsoby, jak vracet zeleň do lidských sídel, a vertikální zahrady jsou jedním z řešení, která dokáží reagovat i na nedostatek volných ploch pro zeleň, zejména při řešení zástavby uvnitř sídelních celků a vracet tak alespoň část přírody do vnitřního prostoru měst a obcí. V neposlední řadě systémová řešení vertikálních zahrad pro vytvoření vegetačních svislých stěn v interiéru a na fasádách objektů nabízí možnost zhotovení rozmanitých a z architektonického hlediska zajímavých ploch trvale porostlých vegetací. Disertační práce se věnuje tématu ozeleňování fasád, zejména pomocí systémů nespojených s volnou půdou – tzv. vertikálními zahradami. Jelikož jsou poznatky k této problematice zatím málo zdokumentované a realizací zelených fasád těchto systémů v naší republice zatím není mnoho, jsem se na základě těchto skutečností rozhodla vytvořit vlastní reálný model fasádního systému vegetačních vertikálních stěn v klimatických podmínkách České republiky s místními taxony rostlin. V prvotní fázi práce je provedena analýza dostupných systémů zelených stěn a navržen plošný panel vertikální zelené stěny. V následující fázi je pak pomocí sledování růstu rostlin a měření teplot na zelené fasádě konkrétního objektu ověřován vliv těchto stěn na teplotu obvodového pláště a okolí budovy v porovnání s fasádou bez zeleně. Vyhodnocení experimentů a získané poznatky poskytly informaci, jak zelená fasáda ovlivňuje své okolí a jaký by mohla mít vliv nejen na tepelnou pohodu objektu v jednotlivých ročních obdobích.
|
|
|
Trojka
Štefanigová, Denisa ; Novotný, Michal (oponent) ; Malý, Břetislav (vedoucí práce)
Akt malování jako akt milování Bakalářskou prací je série maleb na plátně, která usiluje o zpřítomnění erotických představ, jež si každý z nás den ode dne vytváří na základě vlastní imaginace. Jsou neuskutečněné, čili vysněné a nejsou ukotveny v realitě, tudíž novou realitu tvoří, fungují v prostoru našich hlav. Takto pro mě funguje i malba. Jako prostor, ve kterém se může dít něco, co reálně neexistuje.
|
host ::
RSS.