|
|
tRNA synthetases as potential RNA capping enzymes
Říha, Jan ; Macíčková Cahová, Hana (vedoucí práce) ; Brázdovič, Filip (oponent)
(CZ) V naší laboratoři byl nedávno objeven nový typ nekanonických RNA čepiček, obsahujících dinukleosid polyfosfáty. Abychom mohli objasnit jejich fyziologickou roli, je potřeba získat více informací o jejich syntéze v buňkách. Na základě nedávno publikovaných výsledků, dinukleosid polyfosfátové RNA (NpnN-RNA) mohou vznikat při transkripci přímou inkorporací dinukleosid polyfosfátů pomocí RNA polymerázy na počátek nově vznikajícího transkriptu (takzvaný nekanonický iniciační nukleotid). Nelze vyloučit i jiné možnosti syntézy NpnN čepičkované RNA, především jejich enzymatickou post-transkripční syntézu. Jedny z nejpravděpodobnějších kandidátů pro enzym vytvářející NpnN-RNA jsou aminoacyl-tRNA syntetázy. Tyto enzymy jsou, kromě své esenciální role v translaci, odpovědny za syntézu volných dinukleosid polyfosfátů v buňce. V této práci jsme vybrali čtyři tRNA syntetázy, klonovali je do plazmidů a purifikovali pomocí proteinové kapalinové chromatografie (fast protein liquid chromatography - FPLC). Následně byly tRNA syntetázy testovány pro syntézu volných dinukleosid polyfosfátů, díky čemuž jsme zjistili optimální reakční podmínky. Za daných reakčních podmínek jsme následně testovali, zda jsou tRNA syntetázy schopny vytvořit NpnN-RNA, a to pomocí reakce tRNA syntetáz s radioaktivně značenou RNA. Získané...
|
|
|
Zaměstnanecké benefity
Matuška, František ; Říha, Jan (oponent) ; Křížová, Zuzana (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá deskripcí zaměstnaneckých benefitů, způsobem jejich používání ze strany zaměstnavatelů a čerpání ze strany zaměstnanců a v neposlední řadě charakterizuje důvody jejich používání. Práce řeší daňové a účetní aspekty zaměstnaneckých výhod a u vybraných druhů benefitů stanovuje jejich řešení z pohledu české legislativy.
|
|
|
Systémy pro synchronizaci souborů a adresářů
Říha, Jan ; Lattenberg, Ivo (oponent) ; Pfeifer, Václav (vedoucí práce)
Bakalářská práce je zaměřena na zjištění současného stavu v oblasti synchronizace souborů a adresářů na různých platformách. První část se věnuje nástrojům pro zrcadlení, nástrojům pro správu verzí a webovým úložištím. V druhou kapitole se autor zabývá adresářovými službami. Poslední třetí kapitola je věnována praktické části s popisem autorova skriptu.
|
|
| |
|
| |
|
|
Způsoby likvidace Lýkožrouta smrkového
ŘÍHA, Jan
Bakalářská práce se zabývá morfologií a životním cyklem lýkožrouta smrkového. Hlavní záměr je kladen na opatření proti boji s lýkožroutem smrkovým a přehledem takových technik a technologií k tomu určených. Popisuji zde problematiku rojení, zimování a jaké má kůrovec přirozené nepřátele. V bakalářské práci uvádím, jak s lýkožroutem zacházet, jak mu předcházet, a hlavně jsou zde uvedeny návody, jak jednotlivé technologie k jeho likvidaci použít. Jedná se o mechanickou technologii likvidace nebo chemickou likvidaci. Dále je zde uveden rešeržní přehled článků z mezinárodních databází a výtažky z nich. Cílem této práce je vytvoření rešeršního přehledu o biologii a způsobech likvidace lýkožrouta smrkového.
|
|
|
Intracellular dinucleoside polyphosphates and methods of their detection
Říha, Jan ; Macíčková Cahová, Hana (vedoucí práce) ; Šanderová, Hana (oponent)
(CZ) Dinukleosid polyfosfáty jsou látky objeveny před více jak 50 lety, ale jejich role v buňce zatím není zcela pochopena. Některé teorie předpokládají, že hrají roli takzvaných alarmonů při vystavení stresovým faktorům, jiné teorie předpokládají jejich zapojení v buněčné proliferaci či v odpovědi na poškození DNA. Jedna z nových teorií předpokládá, že dinukleosid polyfosfáty fungují jako 5' RNA čepičky. K zjištění role těchto látek v organismu je potřeba znát jejich koncentraci v normálních i stresových podmínkách. V této práci se pokusím stanovit basální hladinu dinukleosid polyfosfátů v buňce a jejich změny v důsledky stresových podmínek, a to vše z již publikovaných dat. Důležitou součástí měření koncentrace jakýchkoliv látek je způsob, jakým jsou měřeny. Proto také podám základní přehled metod jejich měření, od starších metod postavených na reakcích luciferázy, k moderním a přesným metodám založených na hmotnostní spektrometrii. Klíčová slova: dinukleosid polyfosfáty, Ap4A, RNA čepičky, buněčný stress, LC-MS detekce a kvantifikace
|
|
|
Konstrukce a kryptoanalýza AES (Advanced Encyption Standard)
Říha, Jan ; Tůma, Jiří (vedoucí práce) ; Vábek, Jiří (oponent)
Nazev prace: Konstrukce a kryptoanalyza AES (Advanced Encyption Standard) Autor: Jan Říha Katedra: Katedra Algebry Vedouci bakalafske prace: Doc. RNDr. Jin Tuma, DrSc. E-mail vedouciho bakalafske prace: Jiri.Tuma@mff.cuni.cz Abstrakt: V pfedlozene praci studujeme nejnovejsi symetrickou blokovou sifru AES. Nejprve se zabyvame vyvojem a vznikem sifry od vypsani souteze a2 po vyhlaseni vitezneho kandidata. Pote se venujeme jejf konstrukci, ve ktere se vyuziva nekterych netrivialnich poznatku algebry pfi praci s polynomy nad konecnym telesem. V teto kapitole je tez popsana prima inverzni sifra a ekvivalentni inverzni sifra slou^ici k desifrovani zasifrovanych dat. Ve tfeti kapitole zkoumame navrhovane implementace sifry AES na jednotlive platformy a nakonec rozebirame mozne utoky a odolnost Sifry AES vuci nim. Klicova slova: AES, sifra, implementace, kryptoanalyza Title: The design and cryptanalysis of the AES (Advanced Encyption Standard) Autor: Jan ftiha Department: Department of Algebra Supervisor: Doc. RNDr. Jin Tuma, DrSc. Supervisor's e-mail address: Jiri.Tuma@mff.cuni.cz Abstract: In the present work we study the newest symetric block cipher AES. At first we consider development and creation of the cipher from the start of selection proces till announcement of winning candidate. Then we turn to its...
|
|
| |
|
|
Pokročilé metody lineární kryptoanalýzy
Říha, Jan ; Rudolf, Bohuslav (vedoucí práce) ; Hojsík, Michal (oponent)
V předložené práci studujeme pokročilé metody lineární kryptoanalýzy. Nejprve popisujeme samotný princip Matsuiho lineární kryptoanalýzy, její základní dva algoritmy - Algoritmus 1 a Algoritmus 2, proti šifře DES. Dále je popsáno zobecnění lineární kryptoanalýzy a navazující partiční a statistická kryptoanalýza. Poté následuje pohled na lineární aproximace přes korelační matice. Dále se věnujeme zrychlení Matsuiho Algoritmu 2 s použitím Rychlé Fourierovy transformace, založeném na teorii cirkulantních matic. Na závěr se zabýváme Multidimenzionální kryptoanalýzou, která používá více lineárních aproximací a na úplný závěr předkládáme vlastní návrh zrychlení multidimenzionálního rozšíření Algoritmu 2 pomocí Rychlé Fourierovy transformace.
|
host ::
RSS.