|
|
FcεRI and Kit signal to actin cytoskeleton via different pathways
Šimíček, Michal ; Drbal, Karel (oponent) ; Dráber, Petr (vedoucí práce)
Žírné buňky jsou klíčovými hráči na poli vrozené imunity. V minulosti byly tyto buňky zmiňovány zejména jako iniciátory alergických a zánětlivých reakcí. Současné poznatky ovšem naznačují jejich významnou roli též v boji proti bakteriím a virům. Nyní se navíc ukazuje unikátní postavení žírných buněk v regulaci adaptivní složky imunity. Z těchto důvodů je velmi důležité důkladné pochopení signálních dějů vedoucích k diferenciaci, lokalizaci a aktivaci žírných buněk. Poznání může ve výsledku vést k vývoji nových terapeutických přístupů. Stimulace povrchových receptorů žírných buněk, FcεRI a Kit, vede k fosforylaci transmembránového adaptorového proteinu NTAL a mimo jiné k rozprostírání žírných buněk na extracelulární matrix. Morfologické studie žírných buněk postrádajících protein NTAL odhalily výrazně snížené rozprostírání těchto buněk na fibronektinu po stimulaci Ag a kombinací Ag a SCF. Následná kvantifikace plochy pokryté buňkou a dalších morfologických parametrů potvrdila předchozí pozorování. Tento fenomén byl doprovázen poruchami v polymeraci actinu. Po blokaci integrínů specifickými protilátkami nebyly pozorovány poruchy v adhezi buněk bez exprese proteinu NTAL po aktivaci Ag nebo SCF. Pozorované defekty v buněčném rozprostírání tak byly pravděpodobně z důvodu pozměněné signalizace k...
|
|
|
Komparativní genomická předpověď nových transmembránových adaptorových proteinů a jejich expresní analýza.
Pitule, Pavel ; Novotný, Marian (oponent) ; Drbal, Karel (vedoucí práce)
Transmembránové adaptorové proteiny (TRAP) jsou důležitou složkou signálních drah vedoucích od imunoreceptorů směrem k efektorovým mechanizmům uvnitř buňky. Přestože nemají vlastní enzymatickou aktivitu, obsahují interakční motivy, kterými organizují další proteiny v čase a prostoru a iniciují efektivní tvorbu signalizačních komplexů. Funkčně nejvýznamnější TRAP jsou ty, které přímo tvoří s receptory nekovalentní komplexy a poskytují svoje intracelulární vazebné motivy, včetně tyrosinového aktivačního motivu (ITAM). Jejich deficit má výrazné dopady na přenos signálu a knockout myši vykazují zřetelný fenotyp. Podobně tomu je i u prvního objeveného TRAP, který není konstitutivně asociovaný s receptory - proteinu LAT. Obsahuje jiné typy motivů, rovněž založené na fosforylovatelném tyrosinu. Podobné strukturální vlastnosti jako protein LAT má v současnosti dalších sedm popsaných proteinů, řazených mezi TRAP. Ani jeden z nich ovšem nevykazuje výrazný fenotyp u deficitních myší. Cílem mojí diplomové práce bylo bioinformaticky prohledat proteinové databáze a identifikovat co nejvíce proteinů, které by svými charakteristikami odpovídali TRAP. Z dosavadních výsledků vyplývá, že skupina TRAP již byla téměř kompletně popsána - v genomu jsme kromě známých TRAP objevili jen málo dalších proteinů, které přesně...
|
|
|
Analýza kandidátních transmembránových adaptorových proteinů
Šulcová, Jitka ; Černý, Jan (oponent) ; Drbal, Karel (vedoucí práce)
Transmembránové adaptorové proteiny (TRAP) fungují jako kotvící místa pro různé signalizační molekuly a umožňují tak vznik velkých signalizačních komplexů v blízkosti plasmatické membrány. Časově a prostorově regulují signalizační události, a tím napomáhají rychlému a efektivnímu přenosu signálu z receptorů na povrchu buněk do buněčného nitra. Důležitá role známých TRAP v závislosti na jejich lokalizaci v lipidových raftech pro správný vývoj a funkci buněk imunitního systému je stále diskutována. Důvodem je absence výrazného fenotypu u knock-out myší. Jedinými výjimkami jsou deficience ITAMobsahujících adaptorů imunoreceptorů a adaptoru Lat asociovaného s lipidovými rafty, které vedou k poruchám ve vývoji T-lymfocytů a jejich snížené TCR signalizaci. Cílem mé diplomové práce bylo bioinformaticky vyhledat, provést filtrování kandidátních genů na základě predikovaných a publikovaných dat a vybrané kandidátní TRAP poté částečně funkčně charakterizovat. Zjišťovala jsem jejich přítomnost na plasmatické membráně a zda-li jejich ektopická zvýšená exprese uvnitř buněk bude mít roli na expresi povrchového aktivačního znaku T-lymfocytů CD69. Ze 14 kandidátních TRAP může být pouze jediný protein Pdzk1ip1 lokalizován na plasmatické membráně, avšak jeho zvýšená exprese nemá vliv na expresi CD69 v buňkách po TCR...
|
|
| |
|
| |
|
|
Mapy rizik vyplývajících z povodňového nebezpečí v ČR
Český statistický úřad, Praha ; Vysoká škola ekonomická v Praze, Institut pro ekonomickou a ekologickou politiku při FNH, Praha ; Masarykova univerzita v Brně, ESF, Brno ; České vysoké učení technické v Praze, Fakulta stavební, Praha ; Vysoké učení technické v Brně, Fakulta stavební, Praha ; Výzkumný ústav vodohospodářský T.G. Masaryka, v.v.i., Praha ; Drbal, Karel
Obsahem projektu je povodňová problematika nahlížená z mnoha směrů a vodních disciplín. Zpráva obsahuje kapitoly: Citlivostní analýza semi-kvantitativního vyjádření rizik i kvantitativního přístupu na případech z pilotních oblastí, Nástroje multikriteriálního hodnocení variant vhodné k tvorbě plánů pro zvládání povodňových rizik, Vyjádření rizik vyplývajících z ohrožení obyvatelstva během povodňových událostí, Aplikace semi-kvantitativní metody pro odhad rizika vyplývajícícho z ohrožení obyvatelstva během povodňových událostí, Mapa koncetrovaných místních rizik, Změna režimu podzemních vod v inundačním území v souvislosti s povodňovými událostmi a opatřeními proti jejich negativním dopadům, Povodňové situace v ekonomických souvislostech.
|
|
|
Mapy rizik vyplývajících z povodňového nebezpečí v ČR: Metodika tvorby map povodňového nebezpečí a povodňových rizik
Český statistický úřad, Praha ; Vysoká škola ekonomická v Praze, Institut pro ekonomickou a ekologickou politiku při FNH, Praha ; Masarykova univerzita v Brně, ESF, Brno ; České vysoké učení technické v Praze, Fakulta stavební, Praha ; Vysoké učení technické v Brně, Fakulta stavební, Praha ; Výzkumný ústav vodohospodářský T.G. Masaryka, v.v.i., Praha ; Drbal, Karel
Obsahem metodiky jsou zásady a postupy rizikové analýzy záplavových území doporučované k efektivní splnění úkolů předepisovaných Povodňovou směrnicí. metodika představuje určité schéma postupů zaměřených na ohrožená území. Zaměřuje se na stanovení míry povodňových rizik v záplavových území a výše potenciálních povodňových škod především na bytovém fondu, stavebních objektech, na další infrastruktuře , v průmyslové i zemědělské výrobě. Metodika je určena všem odborníkům, pracovníkům státní správy i samosprávy, kteří budou zpracovateli nebo uživateli map povodňového nebezpečí a povodňových rizik a plánů, jak efektivně zvládat rizika vyplývající z povodňového nebezpečí.
|
|
|
Stanovení závislosti jeskynního mikroklimatu na vnějších klimatických podmínkách ve zpřístupněných jeskyních ČR
Český hydrometeorologický ústav, pobočka Brno ; Správa jeskyní České republiky, Průhonice ; Lejska, Stanislav ; Hora, Petr ; Kohut, Mojmír ; Rožnovský, Jaroslav ; Piasecki jacek, Wladyslaw ; Sládek, Petr ; Zajíček, Petr ; Hebelka, Jiří ; Drbal, Karel
V rámci dvou dílčích úkolů DÚ 1 Vyhodnocení mikroklimatu jeskyní a vazby na vnější prostředí a DÚ 2 Vytvoření a ověření funkčnosti jednotného kontinuálního sledování mikroklimatických poměrů jeskyní proběhla měření v Kateřinské, Amatérské a Punkevní jeskyni a ve Slopsko-šošůvských jeskyních. Byly popsány klimatické poměry Moravského krasu a vyhodnoceny změny mikroklimatu jeskyní v závislosti na návštěvnosti. je popsána údržba a kalibrace měřicích systémů
|
|
|
Stanovení závislosti jeskynního mikroklimatu na vnějších klimatických podmínkách ve zpřístupněných jeskyních ČR
Český hydrometeorologický ústav, pobočka Brno ; Správa jeskyní České republiky, Průhonice ; Lejska, Stanislav ; Zahradníček, Pavel ; Kohut, Mojmír ; Rožnovský, Jaroslav ; Jacek, Wladyslaw ; Sládek, Petr ; Zajíček, Petr ; Hebelka, Jiří ; Drbal, Karel
Jsou popsány mikroklimatické poměry sledovaných jeskyní a mezoklimatické poměry oblasti. Jsou uvedeny výsledky měření mikroklimatu Punkevních, Sloupsko-šošůvských jeskyních, Amatérské a Kateřinské jeskyně. Je zhodnocen vliv návštěvnosti na změnu mikroklimatu a vazba na vnější prostředí. V závěru je diskutován současný stav možné scénáře vývoje.
|
|
|
Stanovení závislosti jeskynního mikroklimatu na vnějších klimatických podmínkách ve zpřístupněných jeskyních ČR
Český hydrometeorologický ústav, pobočka Brno ; Správa jeskyní České republiky, Průhonice ; Lejska, Stanislav ; Hora, Petr ; Kohut, Mojmír ; Rožnovský, Jaroslav ; Piasecki jacek, Wladyslaw ; Sládek, Petr ; Zajíček, Petr ; Hebelka, Jiří ; Drbal, Karel
Zákonitosti pohybu a změn ovzduší a jejich vliv na krasové procesy jsou předmětem studia krasové klimatologie. Monitorování jednotlivých parametrů kryptoklimatu je snaha sladit množství návštěvníků v jednotlivých skupinách a frekvenci vstupů tak, aby nedocházelo k výraznějšímu ovlivnění tohoto kryptoklimatu a narušení ekologické stability jeskynního systému. kromě návštěvníků ovlivňuje hodnoty i okolní prostředí. Naměřené hodnoty klimatických prvků z různých míst krasového území lze kromě poznání vzájemných vazeb mezi vnitřním a vnějším prostředím využít i k bližšímu poznání mezoklimatických podmínek jednotlivých biotopů typických pro krasový reliéf.
|
host ::
