|
|
Synthesis of Purine - Amino Acid Conjugates
Čapek, Petr ; Hocek, Michal (vedoucí práce) ; Kotora, Martin (oponent) ; Dvořák, Dalimil (oponent) ; Mazal, Ctibor (oponent)
4. Conclusions A simple and efficient approach to the synthesis of (purin-6-yl)alanines based on Negishi cross-coupling reactions of 6-iodopurines and iodozinc- alanines applicable to the synthesis of both racemic and optically pure compounds was developed. Though analogous reactions were used before for the synthesis of some simple aryl- or hetarylaranines, this was the first successful use in the functionalization ofprotected nucleobases and nucleosides. A practical method for synthesis of enantiomerically pure (purin-6_ yl)phenylalanines by palladium catalyzeď, copper mediated Stille cross-coupling reactions ofprotected 4-(trimethylstanyl)phenylalanines and 6-iodopurines was developed. This method was used in the synthesis of series of (purin_6_ yl)phenylalanines (bases and nucleosides) varying in substitution in position 9 of purine scaffold and in absolute configuration on o-carbon ofphenylalanine. The shaughnessy method for the Suzuki cross-coupling reactions in aqueous media was further optimized and applied to the single-step synthesis of novel optically pure (adenin-8-yl)phenylalanines and (purine_6_yl)phenyl_ alanines. wide tolerance of this methodology towards variety of functionalities and its applicability to 1abile systems was demonstrated particularly by the very first examples of couplings...
|
|
| |
|
|
Mutation Screening in Familial Cardiovascular Diseases
Čapek, Pavel ; Brdička, Radim (vedoucí práce) ; Gregor, Pavel (oponent) ; Baxová, Alice (oponent)
Úvod: Hypertrofická kardiomyopatie je vrozené srdeční onemocnění s autozomálně dominantním typem dědičnosti a neúplnou penetrancí. Se znalostí odpovědných genů, schopností detekovat genetické změny, které jsou podkladem vzniku tohoto onemocnění, a studiem funkční analýzy defektních proteinů, můžeme stanovit, zda konkrétní genotypy vedou ke vzniku odlišných fenotypových projevů hypertrofické kardiomyopatie. Cíle práce: Analyzovat mechanismy vzniku hypertrofické kardiomyopatie u českých pacientů postižených tímto onemocněním z molekulárně genetického hlediska (geny MYH7, TNNT2), až po funkční analýzu 3D molekulárního modelu defektního proteinu těžkého řetězce β-myosinu in silico. Dalším cílem práce bylo studium možnosti snížení tvorby zánětlivých agregátů v kardiovaskulárním systému u pacientů s diabetem mellitem 2. typu. Studie prověřovala možnosti terapeutického ovlivnění vybraných kardiovaskulárních rizik u pacientů s hypertrofickou kardiomyopatií, současně trpících diabetem mellitem 2. typu. Obě tyto skupiny pacientů jsou ohroženy podstatně vyšším rizikem vzniku kardiovaskulárních onemocnění vzhledem k vývoji předčasné aterosklerózy. Materiál a metody: Do studie genu MYH7 bylo zařazeno 170 probandů. Vzorky DNA těchto jedinců byly podrobeny mutačnímu screeningu (PCR, sekvenční analýza)...
|
|
|
Polymorfismus STR lokusů na X chromosomu a jeho využití ve forenzní genetice.
Kotrčová, Eva ; Čapek, Pavel (vedoucí práce) ; Zachová, Markéta (oponent)
Identifikace osob a příbuznosti, pomocí STR (short tandem repeat) lokusů, patří v současné době k rutinně užívaným metodám a to nejen ve forenzní praxi. Běžně jsou analyzovány STR na autozomech a velmi populární je i Y chromozom, který má, bez možnosti rekombinace, velký význam především v genealogii. Chromozom X byl dosud v tomto ohledu využíván nejméně, přestože je ve specifických případech popisnější než autozomální lokusy. Cílem této práce je poskytnout základní přehled o X STR a o metodách běžně používaných k analýze mikrosatelitů s důrazem na jejich specifické chování, pokud jsou lokalizovány na X chromozomu a následných možnostech využití těchto specifit zejména ve forenzní genetice.
|
|
|
Measurement of \kur{in situ}Phasporus Availability in Acidified Soils using Iron-Infused Resin soils.
ČAPEK, Petr
A hybrid anion resin was tested for in situ phosphorus (P) availability measurement in soils of two stands recovering from acidification and having different P-sorption characteristics. The phosphate (P-PO4) sorption capacity of the resin (before saturation) was 48 mol g-1. Sorption and elution were tested under P-PO4 concentrations common in acidic soils (0 0.42 mmol l-1) either with or without the presence of sulfate (0.2 mmol l-1). The efficiency of P-PO4 sorption was independent of the sulfate and was 100 +/- 0.2% (n = 56, +/- SD). The P-PO4 recovery stabilized after six elution steps (each: 50 ml of 0.5 M sodium hydroxide, resin/solution 5:1). The efficiency of P-PO4 recovery was 80 +/- 7% and was used to evaluate field measurements. We determined the amount of P-PO4 in the field using resin bags in three consecutive years. The results indicate that bioavailable P is negatively related to the soil ability to retain P.
|
|
|
Role fosforu v biologické aktivitě kryogenních půd
ČAPEK, Petr
The combined effect of temperature, moisture and phosphorus availability on soil organic matter mineralization in permafrost affected soils of northern circumpolar region was investigated. This study was a part of research activities of the European project CryoCARB and it was primarily focused on the cryoturbated organic horizons of permafrost affected soils. During this study, the temperature sensitivity of the organic matter mineralization and its relation to the soil moisture and phosphorus availability was investigated using series of incubation experiments and field measurements.
|
|
| |
|
|
Polyfunkční dům v Dobříši
Čapek, Pavel ; Vlček, Karel (oponent) ; Vlček, Milan (vedoucí práce)
Diplomová práce je zaměřena na návrh a vypracování projektové dokumentace polyfunkčního domu ve městě Dobříš. Polyfunkční dům dům je pravidelného obdélníkového tvaru o rozměrech 16,12m x 26,12m. Dům má jedno podzemní a tři nadzemní podlaží, poslední nadzemní podlaží je obytné podkroví. Vodorovný i svislý konstrukční systém je z BS Klatovy, střecha je sedlová s vikýři.
|
|
|
Structure of an immunoactive polysaccharide isolated from Korean mulberry fruit (Morus alba L.)
Bleha, R. ; Lee, J. S. ; Capek, P. ; Pohl, Radek ; Kim, H. B. ; Choi, D. J. ; Lee, S. ; Lee, J. ; Jang, S. J. ; Synytsya, A. ; Park, Y. I.
A water-soluble polysaccharide (JS-MP-1) was isolated from the water extract of Korean white mulberry fruits (Morus alba L.) by ethanol precipitation and then purified by DEAE-cellulose ion exchange chromatography. Obtained final polysaccharide (1600 KDa) consisted of galactose, arabinose and rhamnose as major neutral sugars. JS-MP-1 also contains galacturonic and glucuronic acids (4:1). Sugar linkage, FTIR and correlation NMR analyses confirmed that it is a rhamnogalacturonan type I (RG I), which contains the alternating sequence of 1,4-alpha-D-GalAp and 1,2-alpha-L-Rhap units in the backbone. Neutral sugar side chains of JS-MP1 were identified as (1 -> 5)-alpha-L-arabinan and arabinogalactan type II (AG II) having the (1 -> 6)-beta-D-galactan core. The arabinan side chains are bound to the backbone at the O-4 position of some alpha-L-Rhap units, while the way of linkage between RG I and AG II chains is unclear. It was demonstrated that JS-MP-1 significantly stimulates murine macrophage RAW 264.7 cells to release chemokines (RANTES and MIP-1 alpha) and proinflammatory cytokines like INF-alpha and IL-6, and induce the iNOS and COX-2 gene expression, which are responsible for the production of NO and prostaglandin PGE2, respectively. These results suggest that JS-MP-1 can act as a potent immunomodulator and these observations may support the applicability of this polysaccharide or the water extracts of mulberry fruit can be used as an immunotherapeutic adjuvant or health beneficial food material.
|
|
|
Srovnání nástrojů pro animaci algoritmů
Čápek, Pavel ; Buchalcevová, Alena (vedoucí práce) ; Mittner, Jan (oponent)
Tato práce se zaměřuje na nástroje umožňující vytvářet animace algoritmů. V teoretické části je nejdříve představeno několik způsobů, kterými je možné algoritmy prezentovat. Dále je představen obor animace algoritmů, jeho historie, vývoj a současný stav. V poslední části teoretické práce jsou ukázány možnosti, jak využít animaci algoritmů ve výuce. Praktická část diplomové práce se zaměřuje na porovnání vybraných nástrojů pro animaci algoritmů. Vybrané nástroje jsou hodnoceny podle několika zvolených kritérií a následně vzájemně porovnány podle metod vícekriteriálního rozhodování. Hlavním cílem této práce je zhodnotit vybrané nástroje pro animaci algoritmů. Dílčí cíle práce jsou představit čtenáři, jaké výhody může přinést použití nástrojů pro animaci algoritmů oproti zápisu algoritmu textovou formou.
|
host ::
RSS.