|
|
Xantofylový cyklus u rostlin a zelených řas: jeho role ve fotosyntetickém aparátu
Masojídek, Jiří ; Kopecký, Jiří ; Koblížek, Michal ; Torzillo, G.
: Světlem indukovaná konverze violaxantinu na zeaxantin, tzv. xantofylový cyklus, slouží jako krátkodobý fotoaklimační mechanismus u rostlin. Role xantofylů v termální disipaci excitační energie byla odvozena z lineární závislosti mezi tvorbou zeaxantinu a rozsahem nefotochemického zhášení. Studovali jsme roli xantofylového cyklu při adaptaci několika kmenů zelených řas (Chlorella, Scenedesmus, Haematococcus, Chlorococcum, Spongiochloris) k vysoké ozářenosti. Xantofylový cyklus byl funkční ve všech zkoumaných kmenech řas, ale jeho podíl na nefotochemickém zhášení nebyl tak významný jako u vyšších rostlin. Učinili jsme závěr, že řasy používají k disipaci energie i jiné mechanismy, které pracují souběžně s xantofylovým cyklem
|
|
|
B.1. Nesyt
Bubík, M. ; Balík, Vladimír ; Kopecký, J.
Wetland near the western margin of the Nesyt Lake is the most important and one of the last salt meadows of south Moravia. Many taxa of halophyte plants and halophilous insects have there the only locality within Czech Republic. Sulphates and chlorides in soil come from Miocene sediments with primary marine salt mineralization. The area of salt meadows is State protected as National Nature Reserve "Slanisko u Nesytu". Recently in the incidentally take sample from surface of filled part of lake frequent agglutinated forminifer Haplophragmoides wilberti Andersen were found. Also some other samples taken later near the western margin of the Nesyt Lake were positive. This is the first find of modern foraminifer fauna in the territory of Czech Republic. Similar find reported Bartenstein (1939) from salt ponds from vicinity of Erfurt, Germany. He assigned his find to Haplophragmoides canariensis. His figure shows, nevertheless very similar forms.
|
|
| |
|
|
Geny kodující acetyhydroxy syntázu u Streptomyces cinnamonensis a jejich regulační oblast:Mutace v katalytické podjednotce zjią»ující necitlivost k inhibici konečného produktu
Kyselková, Martina ; Kopecký, Jan ; Šigutová, Lucie ; Pospíšil, Stanislav ; Felsberg, Jürgen ; Spížek, Jaroslav ; Janata, Jiří
Geny ilvB kódující katalytickou podjednotku AHAS u rodičovského kmene S. cinnamonensis a čtyř mutantů s deregulovanou biosyntetickou drahou valinu byly sekvenovány. Mutace byly nalezeny u dvou kmenů, jejichž AHAS byla v hrubém buněčném extraktu zdánlivě aktivována valinem. U kmene BVR-18 byla nalezena mutace C574A vedoucí v proteinu k substituci E139A. U kmene ACB-NLR-2 došlo k deleci tripletu AGC v pozici 805-807, což v proteinu vedlo k deleci Q217. Podle homologního modelu katalytické podjednotky, vytvořeného na základě krystalové struktury dimeru katalytických podjednotek AHAS u Saccharomyces cerevisiae, se substituce E139A vyskytla ve smyčce na rozhraní podjednotek poblíž TPP vazebného místa, zatímco ?Q217 v helixu odlehlém od aktivního místa. Jednotlivé podjednotky byly exprimovány v E. coli za účelem rekonstituce enzymů in vitro, jejichž aktivita v přítomnosti a nepřítomnosti 10 mM valinu byla měřena. Podařilo se prokázat, že substituce E139A je zodpovědná za zdánlivou aktivaci AHAS valinem pozorovanou u kmene BVR-18. U kmenů ACBR-2 a NLR-3 se zvýšenou hladinou aktivity AHAS nebyla zjištěna žádná mutace v katalytické podjednotce. Regulační oblast před genem ilvB těchto dvou kmenů a kmene rodičovského byla sekvenována. V rámci této oblasti byly nalezeny některé prvky atenuátoru, ale sekvence se u kmenů ACBR-2 a NLR-3 shodovala se sekvencí rodičovského kmene. Zdá se tedy, že regulace exprese AHAS je zajištěna ještě jiným mechanismem, než je atenuace.
|
|
|
Analýza genového clusteru anthramycinových a lincosamidových antibiotik
Jelínková, Markéta ; Koběrská, Markéta ; Čermák, Lukáš ; Kopecký, Jan ; Janata, Jiří ; Spížek, Jaroslav
Ve shluku genů kódujících biosyntézu linkomycinu bylo zjištěno 27 otevřených čtecích rámců s biosyntetickou či regulační funkcí a 3 rezistenční geny. Ze srovnání chemické struktury linkomycinu a celesticetinu vyplývá, že v biosyntetické dráze chybí dráha vedoucí k propylprolinu a prolin je přímo substrátem kondenzační reakce. Část biosyntetické dráhy zahrnující přeměnu L-tyrosinu na propyl-L-prolin by měla být přítomna v biosyntetické dráze funkčně odlišných antramycinových antibiotik. Byla zjišťováno rozvržení genu linkomycinového biosyntetického shluku do transkripčních jednotek. Dále byla na základě sekvence tohoto shluku navržena sada sond, pomocí nichž byly vyhlédávány analogy genů v producentech celesticetinu Streptomyces caelestis a antramycinů Streptomyces refuineus, Streptomyces albus and Streptosporangium sibiricum.
|
|
|
Metodika navrhování řasových fotobioreaktorů: matematické modelování hydrodynamického míchání a předpověď parametrů světelného režimu
Papáček, Š. ; Rálek, P. ; Kopecký, Jiří ; Masojídek, Jiří ; Štys, Dalibor ; Petera, K.
Počítačová dynamika tekutin (CFD) a simulace procesů jsou důležité nástroje pro návrh a optimalizaci biochemických procesů. Tento příspěvek se zabývá vypracováním metodologie návrhu fotobioreaktorů. CFD kód Fluent 6.1 poskytuje numerickou aproximaci trajektorií mikrořas uvnitř tubulárního fotobioreaktoru. Složením trajektorií s odpovídajícími světelnými podmínkami lze obdržet záznamy tzv. světelné historie pro jednotlivé buňky. Tyto záznamy obsahují kompletní informaci o světelném režimu ve fotobioreaktoru. Numerické simulace pro různé kombinace konstrukčních parametrů fotobioreaktoru a operačních podmínek umožňují vyjádřit kvantitativní závislost mezi proměnnými representujícími konstrukční a operační parametry a parametry světelného režimu. Takto pak lze následně vyřešit problém optimálního návrhu fotobioreaktoru.
|
|
| |
|
|
Systémové změny v českém ZO a jejich vliv na jeho strukturu
Kopecký, Jan ; Sato, Alexej (vedoucí práce) ; Laláková, Eva (oponent)
Bakalářská práce se skládá ze šesti kapitol. V první kapitole jsou popsány základní problémy transformace ekonomiky a charakteristické rysy československého hospodářství. Monopol československého zahraničnho obchodu a jeho odstranění na počátku devadesátých let jsou popisovány v druhé kapitole. V třetí kapitole se autor zabývá změnami kurzové politiky a směřováním ke konvertibilitě. V páté a šesté kapitole jsou objasněny změny obchodní politiky zahrnující cla, kvóty, nástroje obchodní politiky na smluvním základě a státní podporu vývozu. V poslední kapitole je graficky znázorněn a popsán vliv transformace na strukturu českého zahraničního obchodu.
|
|
|
Energetická závislost ve světové ekonomice a dopady na energetickou bezpečnost České republiky
Kopecký, Jan ; Bič, Josef (vedoucí práce) ; Vondrušková, Barbora (oponent)
Udržitelný rozvoj společnosti je stále více závislý na energetických zdrojích. Na jedné straně stoupá poptávka po energetických zdrojích, na druhé straně je dostupnost energetických zdrojů stále náročnější. Je to dáno nejenom tím, že se zmenšují zásoby neobnovitelných zdrojů energie, ale i faktorem ekonomickým, ekologickým, technologickým, a politickým, kdy míra vlastnictví energetických zdrojů se promítá do upevňování ekonomické moci a prosazování politických zájmů. Proto je nutné zabývat se energetickou závislostí Evropy, jako regionu, protože řešení tohoto problému v Evropě se bezprostředně dotýká i České republiky, která svoji energetickou závislost nemůže řešit izolovaně na národní úrovni.
|
|
|
Analýza webových stránek oboru Informatika, nový návrh
Kopecký, Jaroslav ; Benáčanová, Helena (vedoucí práce) ; Nedomová, Lea (oponent)
Ve své práci se zabývám problematikou prezentace informací na webových stránkách oboru informatika na Fakultě informatiky a statistiky na Vysoké škole ekonomické v Praze. Předmět práce je zaměřen na vhodné prezentování jak z vizuálního hlediska, tak i z hlediska struktury informací. Dále se zabývám problematikou analýzy elektronických informačních zdrojů a hodnocením kvality. Vycházím z obecné teorie prezentace a postupuji podle daných bodů analýzy. Důraz je kladen na stručnost, přehlednost, srozumitelnost a přívětivost pro uživatele. Práce se orientuje do oblasti zajištění informací pro studenty a zájemce v hlavních bodech jejich zájmu. Cílem je analyzovat současný stav a podat návrhy směřující ke zlepšení webové prezentace oboru informatika.
|
host ::
RSS.