Original title: Využití mikroskopie atomárních sil ke studiu vybraného bakteriálního kmene
Translated title: The utilization of atomic force miscroscopy to study of selected bacterial strain
Authors: Nováková, Simona ; Slaninová, Eva (referee) ; Smilek, Jiří (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2024
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract: [cze] [eng]
Předmětem bakalářské práce bylo studium vybraných bakteriálních kmenů prostřednictvím mikroskopie atomárních sil. Zkoumány byly termofilní purpurové bakterie – Rhodobaca Barguzinensis, Rhodoblastus acidophilus. Hlavním cílem bylo optimalizovat vybranou mikroskopickou metodu pro zobrazení ve vodném prostředí s nejvhodnějším výběrem fixace vzorku. Pro studium bakteriálních kmenů bylo nutné zachovat viabilitu buněčných mikroorganismů a dodržet optimální podmínky pro zachování nativního stavu při procesu měření. Dále byly vyhodnoceny mechanické vlastnosti – Youngův modul a adheze. Morfologie jednotlivých vzorků byla srovnávána u vzorků stejného druhu v odlišném pH kapalného prostředí a v prostředích s různou koncentrací rozpuštěné soli NaCl. Cíleno bylo i na schopnost produkce PHA granulí u purpurových bakterií, ovšem kvůli absenci PHA-syntázy první třídy nebylo PHA detekováno. Byly porovnány vlivy různých parametrů kultivace jako odlišná doba kultivace či rozdílné pH prostředí. Snímkování bakterií probíhalo pomocí hrotu SNL-10, který je vhodný pro bakteriální vzorky v kapalném prostředí a samotné měření probíhalo v módu QITM. K imobilizaci byl použit skleněný substrát pokrytý vrstvou Poly-L-lysinu. Na závěr byly vyhodnoceny mechanické vlastnosti prostřednictvím Youngova modulu a adheze u vzorků s různě proměnlivými faktory prostředí. The subject of the bachelor’s thesis was the study of selected bacterial strains by a selected method of atomic force microscopy. Thermophilic purple bacteria – Rhodoblastus acidophilus, Rhodobaca barguzinensis – were investigated. The main aim of this theses was focused on optimizing the usage of this microscopic method for imaging in an aqueous environment with the most appropriate fixation of sample. Focusing on bacterial strains demanded to preserve the viability of microorganisms and to observe optimal conditions for maintaining the native state during the measurement process. Furthermore, mechanical properties were evaluated – Young’s modulus and adhesion. The morphology of individual samples was compared for samples of the same species in different pH liquid environments and in environments with different concentrations of dissolved NaCl salt. The ability to produce PHA granules in purple bacteria was also targeted, however, due to the absence of first-class PHA synthase, PHA was not detected. The effects of different cultivation parameters such as different cultivation time or different pH of the environment were compared. Imaging of bacteria was carried out using the SNL-10 tip, which is suitable for bacterial samples in a liquid environment, and the measurement itself was carried out in QITM mode. A glass substance covered with a layer of Poly-L-lysin was used for immobilization. Finally, the mechanical properties were evaluated through Young’s modulus and adhesion for samples with various environmental factors.
Keywords: Atomic force microscopy; extremophilic purple bacteria; polyhydroxyalkanoates; Rhodobaca barguzinensis; Rhodoblastus acidophilus; extremofilní purpurové bakterie; Mikroskopie atomárních sil; polyhydroxyalkanoáty; Rhodobaca barguzinensis; Rhodoblastus acidophilus

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: https://hdl.handle.net/11012/246422

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-619592


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses