Název: Identifikace neznámých bakteriálních genomů pomocí online databázového nástroje
Překlad názvu: Identification of unknown bacterial genomes using an online database tool
Autoři: Nejezchlebová, Julie ; Čejková, Darina (oponent) ; Schwarzerová, Jana (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2024
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Diplomová práce se zabývá vytvořením automatického softwarového nástroje Bacterial Explorer, který umožňuje odhalení nových bakterií za pomoci dostupných bioinformatických nástrojů. Nástroj je vytvořen v souladu s požadavky Výzkumného ústavu veterinárního lékařství (VÚVeL) a je testován na datech z poskytnuté VÚVeL databáze. Teoretická část je věnována popisu bakteriální typizace, metodám, které se používají pro genomickou analýzu a již dostupným nástrojům pro bakteriální typizaci. V praktické části se práce zaměřuje na implementaci automatického softwarového nástroje s názvem Bacterial Explorer zahrnující popis nástrojů na pozadí vytvořeného nástroje, uživatelské prostředí a implementaci do online databáze VÚVeL. V poslední části se praktická část zabývá testováním nástroje a diskusí výsledků. This master's thesis deals with the develop of an automatic software tool - Bacterial Explorer which allows the discovery of unknown bacteria using available bioinformatics tools. The tool is developed in accordance with the requirements of the Veterinary Research Institute (VRI) and is tested on data from the provided VRI database. The theoretical part is dedicated to the description of bacterial typing, methods used for genomic analysis, and already available tools for bacterial typing. In the practical part, the thesis focuses on the implementation of the automatic software tool called Bacterial Explorer, including a description of the tools behind the created tool, the user interface and implementation in the online database of VRI . The final part of the practical section deals with tool testing and discussion of the results.
Klíčová slova: Bacterial Explorer; Bakterie; Bioinformatika; Genomická analýza; VÚVeL (Výzkumný ústav veterinárního lékařství); Bacteria; Bacterial Explorer; Bioinformatics; Genomic Analysis; VRI (Veterinary Research Institute)

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: https://hdl.handle.net/11012/246228

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-618123


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce