Název: Využití numerických reprezentací ve zpracování nukleotidových sekvencí
Překlad názvu: The use of numerical representations in processing of nucleotide sequences
Autoři: Košíček, Adam ; Maděránková, Denisa (oponent) ; Kubicová, Vladimíra (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2014
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Převod sekvencí DNA na vhodnou reprezentaci je důležitou úkolem před samotným započetím analýzy a dalšího zpracování. Hlavním úkolem této práce bylo se seznámit s typy numerických a grafických reprezentací a jejich využitím pro analýzu DNA. Vzhledem k velkému množství metod a postupů, byly do této práce vybrány pouze některé. Některé metody nelze přímo klasifikovat jako numerické nebo grafické, protože obsahují možnost obojí reprezentace. Tyto metody byly zařazeny mezi grafické reprezentace. Pro vybrané metody byly vytvořeny fylogenetické stromy pro porovnání přesnosti. Závěrem práce je zhodnocení získaných výsledků. Conversion of DNA sequences for appropriate representation is important task before initiation of analyzes and further processing. The main goal of this work was to get familiar with types of numerical and graphical representations and their application for DNA analyzes. In consideration of great volume of methods and procedures, only a few were chosen for this work. Some methods can not be classified only as numerical or graphical representations, because of option allowing them to be converted into both of these representations. These methods were classified as graphical representations. Phylogenetic trees were programmed for chosen methods to compare its precision. Outcome of this work is summing up the results.
Klíčová slova: CpG ostrůvky; dendrogram; DNA sekvence; grafická reprezentace; kritérium; kódující sekvence; numerická reprezentace; podobnost; coding sequence; CpG islands; criterion; DNA sequence; graphical representation; numerical representation; phylogenetic tree; similarity

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/33397

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-611162


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce