Original title:
Fuzzy klasifikace DNA sekvencí
Translated title:
Fuzzy classification of DNA sequences
Authors:
Těthal, Jiří ; Maděránková, Denisa (referee) ; Škutková, Helena (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2013
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Práce se zabývá Fuzzy klasifikací sekvencí DNA. V první části práce jsou teoreticky shrnuty informace o fuzzy logice a metodách jejího využití v klasifikaci biologických sekvenčních dat. Druhá část se již prakticky zabývá řešením klasifikačního algoritmu pro posouzení podobnosti sekvencí. Konkrétně pro rozdělení kódujících a nekódujících částí sekvence a využití fuzzy klasifikace v DNA barcodingu.
The work deals with the fuzzy classification of DNA sequences. In the first part the theory summarized information about Fuzzy logic and methods of its use in the classification of biological sequence data. The second part is practically deal with the classification algorithm for assessing the similarity of sequences. Specifically, the dividing of coding and non-coding parts of the sequence and the use of fuzzy classification in DNA barcoding.
Keywords:
beta-globin; BOLD; cytochrome c-oxidase; DNA; DNA barcoding; EMBL; exon; Fuzzy; GC content; genome; intron.; sequence motif; beta-globin; BOLD; cytochrom c-oxydáza; DNA; DNA barcoding; EMBL; exon; Fuzzy; GC obsah; genom; intron.; sekvenční motiv
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/25932