Original title: Analýza DNA izolované z různých typů probiotických výrobků s využitím PCR v reálném čase a HRM analýzy
Translated title: The analysis of DNA isolated from different types of probiotic products using real-time PCR and HRM analysis
Authors: Sedláková, Lucie ; Rittich, Bohuslav (referee) ; Trachtová, Štěpánka (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2016
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract: [cze] [eng]
Cílem této práce bylo zavedení metody PCR v reálném čase s vysokorozlišovací analýzou křivek tání pro rod Bifidobacterium. V současné době je dostupné malé množství publikací, které se zabývají rozlišením kmenů rodu Bifidobacterium pomocí vysokorozlišovací analýzy křivek tání. Dle publikací, které byly zaměřeny na rozlišení bakterií mléčného kvašení, byly vybrány primery P1V1 a P2V1, LAC1 a LAC2, LsppUPF a LsppUPR, V3F a V3R, V6F a V6R. Bakteriální DNA sbírkových kmenů byla pomocí těchto primerů amplifikována metodou PCR v reálném čase s vysokorozlišovací analýzou křivek tání. Po vyhodnocení naměřených výsledků byla účinnost vybraných primerů rovněž ověřena na DNA izolované z komplexního vzorku probiotického výrobku. Po další optimalizaci by za pomoci vybraných primerů mohla být metoda PCR v reálném čase s vysokorozlišovací analýzou křivek tání vhodná i pro rod Bifidobacterium. The aim of this diploma thesis was to introduce real-time PCR with high-resolution melting analysis for Bifidobacterium species. Currently a small number of publication, dealing with identification of Bifidobacterium species using high-resolution melting analysis, is available. According to publications dealing with identification of lactic acid bacteria were selected primers P1V1 and P2V1, LAC1 and LAC2, LsppUPF and LsppUPR, V3F and V3R, V6F and V6R. Using this primers bacterial DNA was amplified by real-time PCR with high-resolution melting analysis. After evaluation of the measured results efficiency of selected primers was verified on DNA izolated from complex sample of probiotic product. After further optimisation real-time PCR with high-resolution melting analysis could be suitable using selected primers for Bifidobacterium species.
Keywords: Bifidobacterium; High-resolution melting analysis; lactic acid bakteria; polymerase chain reaction; probiotics; bakterie mléčného kvašení; Bifidobacterium; polymerázová řetězová reakce; probiotika; Vysokorozlišovací analýza křivek tání

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/58384

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-587607


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses