Název: Predikce sekundární struktury RNA sekvencí
Překlad názvu: Prediction of RNA secondary structure
Autoři: Klímová, Markéta ; Provazník, Ivo (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2015
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Sekundární struktura RNA hraje roli v mnoha biologických procesech. Efektivní predikce této struktury může poskytnout informace pro další zkoumání těchto procesů. V současnosti existuje mnoho dostupných programů pro predikci sekundární struktury RNA, některé pracují s jednou sekvencí RNA, jiné využívají více zarovnaných sekvencí organismů se společným předkem. U většiny metod jsou stále problémem pseudouzly. Tato práce představuje některé metody, veřejně dostupný software a popisuje vlastní realizaci metody minimalizace volné energie. RNA secondary structure is very important in many biological processes. Efficient structure prediction can give information for experimental investigations of these processes. Many available programs for secondary structure prediction exist. Some of them use single sequence, the others use more related sequences. Pseudoknots are still problematic for most methods. This work presents several methods and publicly available software and the implementation of minimum free energy method is described.
Klíčová slova: mfold; minimalizace volné energie; Nussinov-Jacobson; predikce sekundární struktury; RNA; RNAfold; Sfold; Zuker; free energy minimization; mfold; Nussinov-Jacobson; RNA; RNAfold; secondary structure prediction; Sfold; Zuker

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/38951

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-573836


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce