Original title:
Temporální změny genetické a morfologické diverzity křemičitých zlativek (Stramenopiles, Chrysophyceae)
Translated title:
Temporal changes in the genetic and morphological diversity of silica-scaled chrysomonads (Stramenopiles, Chrysophyceae)
Authors:
Tučková, Kateřina ; Škaloud, Pavel (advisor) ; Nedbalová, Linda (referee) Document type: Master’s theses
Year:
2023
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Temporální dynamika na malé časové škále je velmi zajímavou oblastí výzkumu. Většinou jsou temporální studie dělány na škále v řádu měsíců či let. Mikroorganismy mají však mnohem kratší generační dobu a jejich změny se tudíž mohou odehrávat i na mnohem menší časové škále. Zároveň téměř žádná z temporálních studií nejde na druhovou úroveň a většinou se drží na úrovni tříd. To, že se mění dynamika druhů v rámci dní víme z pozorování, ale nebylo to nikdy řádně ověřeno. Pro studium změn na této jemné úrovni byly vybrány rody Mallomonas a Synura ze třídy Chrysophyceae. Tyto dva rody se vyznačují tvorbou křemičitých šupin na povrchu svých buněk, podle kterých jsou dobře morfologicky určitelné na druhovou úroveň. Jelikož je však určování druhů pomocí mikroskopu starou ale však tradiční metodou, byla použita i nová molekulární metoda pro určování druhů na lokalitě, tj. metabarcoding. Ukázalo se, že tyto metody přináší pro popis společenstva zlativek podobné výsledky. Zároveň se potvrdilo, že temporální dynamika probíhá na úrovni druhů, ale i na úrovni sekcí u rodu Synura. Následně se podařilo přiřadit k temporálním změnám ve společenstvu enviromentální faktory, které je způsobují. Klíčová slova: temporální dynamika na malé časové škále, Chrysophyceae, Synura, Mallomonas, transmisní elektronová mikroskopie,...Temporal dynamics on short time scales is a very interesting area of research. Usually, temporal studies are done on a scale of months or years. However, microorganisms have a much shorter generation time and therefore changes can take place on a much smaller time scales. At the same time, almost none of the temporal studies go to the species level and mostly stay at the class level. That species dynamics change within days we know from observation, but this has never been properly verified. The genera Mallomonas and Synura from the class Chrysophyceae were chosen to study short-term temporal changes These two genera are characterized by the formation of siliceous scales on the surface of their cells, by which they are well morphologically identifiable to the species level. However, since species identification by microscopy is an old but traditional method, a new molecular method for species identification at the locality, i.e. metabarcoding, was also used. These two methods have been shown similar results for describing the golden algae community. At the same time, it was confirmed that temporal dynamics occur at the species level, but also at the section level in the genus Synura. Subsequently, it was possible to relate the environmental factors that cause temporal changes in the community to...
Keywords:
Chrysophyceae; enviromental conditions; Mallomonas; metabarcoding; short-term temporal dynamics; Synura; time-lag analysis; transmision electron microscopy; turnover; Chrysophyceae; enviromentální podmínky; Mallomonas; metabarcoding; Synura; temporální dynamika na malé časové škále; time-lag analýza; transmisní elektronová mikroskopie; turnover
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/184618