Název: Zpracování a analýza lidského plicního mikrobiomu z nanopórových sekvenačních dat
Překlad názvu: Processing and analysis of the human lung microbiome from nanopore sequencing data
Autoři: Molíková, Anna ; Bartoň, Vojtěch (oponent) ; Nykrýnová, Markéta (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2023
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se věnuje zpracování a analýze plicního mikrobiomu z nanopórových sekvenačních dat. V úvodu čtenáře seznamuje s plicním mikrobiomem a jeho složením při zdraví i nemoci. Dále se pak věnuje jednotlivým sekvenačním technologiím se zaměřením na nanopórovou sekvenaci. Na závěr se práce zaměřuje na několik metod analýzy plicního mikrobiomu. V praktické části bakalářské práce je provedeno základní zpracování sekvenačních dat a následně jejich taxonomická analýza a nalezení genů antibiotické rezistence. Ze získaných výsledků je pak vyhodnoceno složení plicního mikrobiomu v každém ze zpracovávaných vzorků. This bachelor’s thesis deals with processing and analysis of the human lung microbiome from nanopore sequencing data. Firstly this thesis introduces the lung microbiome and its composition in health and illness. Then it focuses on generations of sequencing technologies, mainly describing nanopore sequencing. The last chapter discusses different methods used for lung microbiome analysis. The practical part of this thesis preprocesses sequencing data, followed by their taxonomic analysis and the search for antibiotic resistance genes. From the obtained results, the composition of the lung microbiome in each of the processed samples is then evaluated.
Klíčová slova: geny antibiotické rezistence; mikroorganismus; nanopórová sekvenace; plicní mikrobiom; antibiotic resistance genes; lung micriobiome; microorganism; nanopore sequencing

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/210840

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-529121


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce