Název: Identifikace efektorů sekrečního systému typu III u bakterií rodu Aeromonas
Překlad názvu: Identification of type III secretion effectors in Aeromonas spp.
Autoři: Jirsová, Anežka ; Kamanová, Jana (vedoucí práce) ; Lišková, Petra (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2023
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Bakterie rodu Aeromonas jsou gramnegativní tyčinkovité bakterie, které jsou všudypřítomné ve vodním prostředí. Mezofilní druhy tohoto rodu, reprezentované A. hydrophila, A. dhakensis, A. veronii a A. schubertii, jsou nejen důležitými patogeny u ryb, ale jsou patogenní rovněž u lidí. Jsou původci gastrointestinálních a systémových infekcí a infikují rovněž rány. Jejich virulence byla popsána jako multifaktoriální a spojená s přítomností sekrečního systému typu 3. O efektorových proteinech, které jsou tímto systémem dopravovány do hostitelské buňky, však není mnoho známo. Cílem této práce bylo charakterizovat dva různé sekreční systémy typu 3, a to API-1 a API-2 u A. schubertii s ohledem na jejich buněčnou cytotoxicitu a identifikovat efektorové proteiny, které transportují do hostitelské buňky. K dosažení těchto cílů byla použita řada metod, včetně mikrobiologických technik, molekulárního klonování, práce s tkáňovou kulturou, elektroforézy na SDS polyakrylamidovém gelu a hmotnostní spektrometrie. Úspěšná konstrukce mutantních kmenů A. schubertii s inaktivovanými systémy API-1 nebo API-2 a kmene s delecí genu kódujícího negativní regulátor API-1 mi umožnila identifikovat potenciální efektorové proteiny typu 3 tohoto druhu. Mezi identifikovanými proteiny byly homology známých efektorových proteinů... Bacteria of the genus Aeromonas are Gram-negative, rod-shaped bacteria that are ubiquitous in the aquatic environment. The mesophilic species of this genus, represented by A. hydrophila, A. dhakensis, A. veronii and A. schubertii, are not only important pathogens in fish but also emerging pathogens in humans. They are associated with various gastrointestinal, systemic and wound infections. Their virulence has been described as multifactorial and associated with the presence of a type 3 secretion system. However, not much is known about the effector proteins that are introduced into the host cell by this system. The aim of this work was to characterize the two different type 3 secretion systems API-1 and API-2 of A. schubertii with respect to their cellular cytotoxicity and to identify the effector proteins that they transport into the host cell. To achieve these goals, a variety of methods were used, including microbiological techniques, molecular cloning, tissue culture techniques, SDS polyacrylamide gel electrophoresis, and mass spectrometry. Successful construction of mutant strains of A. schubertii with inactivated API-1 or API-2 and a strain with deletion of the gene encoding the negative regulator of API-1 enabled me to identify potential type 3 effector proteins of this species. Among the...
Klíčová slova: Aeromonas; efektorový protein; sekreční systém typu III; Aeromonas; effector protein; type III secretion system

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/181434

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-527969


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce