|
|
Identifikace efektorů sekrečního systému typu III u bakterií rodu Aeromonas
Jirsová, Anežka ; Kamanová, Jana (vedoucí práce) ; Lišková, Petra (oponent)
Bakterie rodu Aeromonas jsou gramnegativní tyčinkovité bakterie, které jsou všudypřítomné ve vodním prostředí. Mezofilní druhy tohoto rodu, reprezentované A. hydrophila, A. dhakensis, A. veronii a A. schubertii, jsou nejen důležitými patogeny u ryb, ale jsou patogenní rovněž u lidí. Jsou původci gastrointestinálních a systémových infekcí a infikují rovněž rány. Jejich virulence byla popsána jako multifaktoriální a spojená s přítomností sekrečního systému typu 3. O efektorových proteinech, které jsou tímto systémem dopravovány do hostitelské buňky, však není mnoho známo. Cílem této práce bylo charakterizovat dva různé sekreční systémy typu 3, a to API-1 a API-2 u A. schubertii s ohledem na jejich buněčnou cytotoxicitu a identifikovat efektorové proteiny, které transportují do hostitelské buňky. K dosažení těchto cílů byla použita řada metod, včetně mikrobiologických technik, molekulárního klonování, práce s tkáňovou kulturou, elektroforézy na SDS polyakrylamidovém gelu a hmotnostní spektrometrie. Úspěšná konstrukce mutantních kmenů A. schubertii s inaktivovanými systémy API-1 nebo API-2 a kmene s delecí genu kódujícího negativní regulátor API-1 mi umožnila identifikovat potenciální efektorové proteiny typu 3 tohoto druhu. Mezi identifikovanými proteiny byly homology známých efektorových proteinů...
|
|
|
Molekulární mechanizmy perzistence bakterií k antibiotikům
Jirsová, Anežka ; Lichá, Irena (vedoucí práce) ; Branny, Pavel (oponent)
Schopnost perzistovat je vlastní naprosté většině druhů bakterií. Perzisteři představují malou heterogenní frakci bakteriální populace, jež dokáže tolerovat působení antibiotik. Na rozdíl od rezistentních buněk, které se geneticky odlišují od zbytku populace citlivé na působení antibiotik, tvoří perzistentní buňky geneticky nerozlišitelnou subpopulaci. Perzisteři vznikají buď v důsledku působení stresu vyvolaného nepříznivými podmínkami okolního prostředí, nebo perzistentní subpopulace vzniká v důsledku stochastické indukce nezávislé na přítomnosti stresujících podmínek. Existují různé mechanizmy, u nichž bylo prokázáno, že s jejich působením dochází u bakteriálních buněk k nastolení perzistentního stavu. Důležitou roli během vzniku perzistence hrají toxin-antitoxin systémy a jejich interakce s efektory stringentní odpovědi. Perzistentní stav je také ovlivňován změnami v protonmotivní síle (PMF) a kolísáním hladiny exprese energii generujících enzymů Krebsova cyklu (TCA). V této práci jsou charakterizovány perzistentní buňky a shrnuty dosavadní poznatky o molekulárních mechanizmech vedoucích k navození perzistence u bakterií. Klíčová slova: bakterie, perzistence, antibiotika, stringentní odpověď, PMF, TCA
|
host ::
RSS.