Original title: Mikrobiota hostitele, zánětlivá imunitní odpověď a fyziologická senescence u volně žijících ptáků
Translated title: Host-microbiota, pro-inflammatory immunity and physiological senescence in wild birds
Authors: Těšický, Martin ; Vinkler, Michal (advisor) ; Tschirren, Barbara (referee) ; Štěpánek, Ondřej (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2023
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Triggered by microbial ligands, inflammation serves as a "double-edged sword" to fight infections on the one hand, but on the other hand causing tissue damage due to oxidative stress if it is dysregulated. For example, chronic inflammation can contribute to inflammaging, which is now widely regarded as one of the causes of ageing. In my interdisciplinary dissertation, my colleagues and I investigated three interrelated aspects of inflammation, using an evolutionary framework and various free-living birds as models: (1) ecological and evolutionary determinants of gut microbiota (GM) composition and diversity, a driver of wild bird immunity, (2) diversity in immune genes affecting inflammatory responses in wild birds and (3) inflammation-related physiological senescence in a free-living passerine bird, the great tit (Parus major). Firstly, using 16S rRNA gene metabarcoding, we revealed high intra- and interspecific variation in passerine gut microbiota (GM) dominated by the major phyla Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria and Bacteroidetes. Although in mammals GM depends strongly on host phylogeny and diet, in birds we found only moderate effects of phylogeny and very limited effects of host geography and ecology on GM composition. While microbiota diverged between the upper and lower... Mikrobiálními ligandy vyvolaný zánět je klíčový imunologický proces, který na jedné straně zajišťuje obranyschopnost proti infekčním onemocněním, ale jeho dysregulace může vést také k oxidačnímu poškození tkání. K tomu dochází např. během chronického zánětu, který může způsobovat tzv. inflammaeging, o němž se nyní uvažuje jako o možné příčině stárnutí. Ve své multidisciplinární disertaci jsem za využití evolučně-komparativních přístupů a ptáků jako modelové skupiny zkoumal tři vzájemně propojené aspekty zánětu: (1) evoluční a ekologické determinanty vnitro- a mezidruhové variability střevní mikrobioty (SM), které ovlivňují evoluci ptačí imunity, (2) genetickou diverzitu imunitních genů ovlivňující zánětlivou imunitní odpověď u ptáků a (3) stárnutí ve fyziologických znacích spojených s tzv. inflammagingem na modelu volně žijícího pěvce, sýkory koňadry (Parus major). (1) Pomocí sekvenování bakteriální 16S rRNA jsme zjistili značnou vnitro- i mezidruhovou diverzitu ve složení SM u pěvců a dominanci taxononů z kmenů Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria and Bacteroidetes. V porovnání se savčí SM, které je do velké míry determinována fylogenezí hostitele a jeho stravou, naše výsledky u pěvců ukazují pouze na středně silný vliv fylogeneze hostitele a velmi slabý vliv ekologických faktorů (potrava a...
Keywords: adaptive convergence; ageing; antioxidants; birds; gene loss; great tit; host microbiota; inflammaging; inflammation; innate immunity; microbiome; oxidative stress; Parus major; passerines; pattern-recognition receptors; positive selection; redox balance; senescence; structural bioinformatics; adaptivní konvergence; antioxidanty; genová ztráta; inflammaging; mikrobiom; mikrobiota hostitele; oxidativní stress; Parus major; pattern-recognition receptory; positivní selekce; ptáci; pěvci; redoxní rovnováha; senescence; strukturní bioinformatika; stárnutí; sýkora koňadra; vrozená imunita; zánět

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/180048

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-522028


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses