Název: Minoritní proteiny viru hepatitidy typu C
Překlad názvu: Novel hepatitis C virus proteins
Autoři: Zeman, Jakub ; Vopálenský, Václav (vedoucí práce) ; Horníková, Lenka (oponent)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2011
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Virus žloutenky typu C (HCV) je hlavním původcem chronických onemocnění jater. Po celém světě je v současnosti více než 170 milionů chronicky infikovaných osob, u více jak 100 tisíc z nich se ročně rozvine hepatocelulární karcinom. HCV náležící do čeledi Flaviviridae je obalený jednořetězcový RNA virus s pozitivním vláknem (+ssRNA virus), jehož genom kóduje polyproteinový prekursor, z kterého vzniká pro štěpení buněčnými a virovými proteasami 10 virových proteinů. Mimo to je však virem kódován ještě minoritní protein v alternativním čtecím rámci. Tento protein vzniká v několika možných variantách posunem čtecího rámce či iniciací translace na vnitřních startovacích kodonech. Přes deset let výzkumu není jeho role in vivo v současné době známa. Ukazuje se, že pro robustní virovou translaci a replikaci jsou spíše než přítomnost minoritních proteinů důležité sekundární struktury v core oblasti genomu HCV. Mutace narušující tyto struktury můžou mít za následek zpomalení kinetiky virového cyklu, ale i, jak naznačuje nejnovější studie, zcela neobvyklý sérologický profil u pacientů a zvýšenou míru exprese minoritního proteinu. The hepatitis C virus (HCV) is a major etiological agent of chronic liver diseases. More than 170 million people worldwide are chronically infected, and more than 100 thousand of them develop hepatocellular carcinoma a year. HCV is an enveloped, positive-sense single-stranded RNA virus (+ssRNA virus) of the family Flaviviridae. Its genome is translated to produce a single polyprotein precursor that is further processed by cellular and viral proteases to form 10 viral proteins. Moreover, there is another protein encoded in an alternative reading frame. Two alternative translation mechanisms have been proposed for expression of this alternative reading frame protein (ARFP): a frameshift mechanism and translation initiating from internal start codons. Despite ten years of research its role in vivo is not yet explained. It appears that secondary structures in the core encoding region of HCV genome but not ARFP expression are required for robust viral translation and replication. The results of recent studies suggest that mutations distorting these structures may result not only in slowing down the viral cycle but also in a brand new and utterly unusual serological profile in patients as well as an increased level of expression of ARFP.
Klíčová slova: ARFP; core protein; core+1 protein; HCV; iniciace translace; sekundární struktura RNA; virus hepatitidy typu C; ARFP; core protein; core+1 protein; HCV; hepatitis C virus; RNA secondary structure; translation initiation

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/36677

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-492916


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce