Original title:
Rekombinantní příprava proteinu RhoA s afinitní sondou.
Translated title:
Recombinant expression of RhoA protein with affinity tag.
Authors:
Filipová, Barbora ; Novák, Petr (advisor) ; Šulc, Miroslav (referee) Document type: Bachelor's theses
Year:
2018
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Počet střevních infekcí spojených s užíváním antibiotik u lidí rapidně roste. Virulentní toxiny C. difficile, Yersinií a mnoha dalších bakterií cílí na protein RhoA. Jedná se o GTPasu, která je součástí signálních buněčných drah a její hlavní funkcí je regulace aktinového cytoskeletu. Zmíněné toxiny činí tento protein nefunkčním, což může vést až k fatální destrukci buňky. V dnešní době je diagnostika popsaných infekcí nedostačující. Využití proteinových čipů a hmotnostní spektrometrie k určení modifikace proteinu RhoA se jeví jako možný způsob stanovení těchto střevních bakteriálních onemocnění. A proto je cílem této práce rekombinantně připravit kýžený protein RhoA s navázanou afinitní sondou, která bude sloužit k jeho imobilizaci na biočip. Takto připravený protein bude dále využit v diagnostice popsaných onemocnění.The rate of intestinal infections associated with antibiotics has been rising steeply. Virulent toxins of C. difficile, Yersinia and many other bacteria target the RhoA protein. The protein is a GTPase involved in signalling pathways, its major function being the regulation of the actin cytoskeleton. The above mentioned toxins render this protein non- functional, which may lead up to a fatal destruction of the cell. The present diagnostic methods of these infections are insufficient. The use of protein chips and mass spectrometry to detect any RhoA protein modifications seems to provide a feasible method of determining these intestinal bacterial diseases. Therefore the purpose of this study is to use recombinant methods to prepare the desired RhoA protein with a bound affinity probe which will serve to its immobilisation on a biochip. The thus prepared protein will be subsequently used to diagnose the previously described diseases. In Czech.
Keywords:
affinity purification; Biotin; recombinant expression; RhoA; afinitní purifikace; Biotin; rekombinatní exprese; RhoA
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/103506