Název:
Identifikace trichologického materiálu metodou High Resolution Melting vybranými SNPs ve forenzní praxi
Překlad názvu:
Forensic SNP identification of trichological material by High Resolution Melting analysis
Autoři:
Strobachová, Joanne ; Stenzl, Vlastimil (vedoucí práce) ; Korabečná, Marie (oponent) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2013
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Analýza mitochondriální DNA (mtDNA) vlasů v telogenní fázi hraje důležitou úlohu ve forenzním vyšetřování především z důvodu, že vlasy v této fázi jsou běžným typem biologických stop zanechaných na místě činu. Tento typ stop se vyznačuje častou absencí jaderné DNA (nDNA), a proto je obvykle možná pouze analýza mtDNA. Vzhledem k časové a finanční náročnosti analýzy mtDNA však není možné tuto analýzu standardně provádět u všech relevantních vzorků. Z tohoto důvodu jsme se rozhodli analyzovat mtDNA izolovanou z trichologického materiálu a identifikovat jej na základě analýzy vybraných jednobázových polymorfismů (SNPs) metodou High Resolution Melting (HRM). Abychom potvrdili robustnost metody HRM u různého typu biologického materiálu jednotlivce, byl analyzován trichologický materiál v anagenní a telogenní fázi. Z celkového množství pěti vybraných SNP markerů se podařila optimalizace analýzy tří SNP lokalizovaných na mtDNA. U SNP pozice C14766T se potvrdila možnost analýzy trichologického materiálu v anagenní a telogenní fázi. Možnost analýzy SNP C7028T a G3010A je potvrzena pouze u trichologického materiálu v anagenní fázi. Analýzou vybraných SNP markerů pomocí námi optimalizované metody HRM se prokázala nezávislost genotypizační metody na typu biologického materiálu jedince a pro užití těchto SNP byl...The analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) from shed hairs has gained high importance in forensic casework since telogen hairs are one of the common type of evidence left at the crime scene. This type of evidence very often lack of nuclear DNA (nDNA), so the analysis of mtDNA is the only possibility. The analysis of trichological material lacking nDNA is not commonly done in the forensic practice because of the high price of the regularly used mtDNA analysis method, as well as the time demandingness. For these reasons we decided to analyze the mtDNA and identify the trichological material by analysis of chosen single based polymorphism's (SNP) followed by High Resolution Melting (HRM). In order to verify the robustness of the HRM analysis method on several types of biological material that belongs to one person, we tested trichological material in anagen and telogen. From total number of 5 selected SNP's, this paper was able to optimize analysis of 3 SNP's. Due to the analysis of SNP C14766T (applicable for the trichological material in anagen and telogen), SNPs C7028T and G3010A (applicable only for the trichological material in anagen). The mtDNA sequences of different biological materials did not show intra-individual differences. Protocol that could be used for the forensic practice with the use...