Original title: Vliv vyřazení genu yxkO při adaptaci na enviromentální stres u rodu Bacillus.
Translated title: Effect of knock out of yxkO gene on environmental stress adaptation in genus Bacillus
Authors: Tkadlec, Jan ; Lichá, Irena (advisor) ; Krásný, Libor (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2011
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
V předchozích letech jsme v naší laboratoři popsali mutanta Bacillus subtilis, který vykazoval snížený růst při vystavení osmotickému stresu za limitující koncentrace K+ . Tento mutantní kmen nesl přerušení v genu yxkO kódujícím předpokládanou ribokinázu. Tento gen patřící do sigma B operonu je indukován osmotickým, teplotním a etanolovým šokem. Při srovnání s divokým kmenem, má tato mutace pleiotropní vliv na fenotyp nositelského kmenu. Kromě osmosenzitivity se mutant liší tvarem buňky, schopností motility a sporulace. Naším cílem bylo zaměřit se na projevy mutace v genu yxkO u dalších bakterií z rodu Bacillus. Připravili jsme mutanty s přerušením tohoto genu, pomocí plazmidu pMUTIN4, odvozené od kmenů lišících se okolím tohoto genu a úrovní laboratorní domestikace Bacillus amyloliquefaciens a Bacillus subtilis subsp. spizizenii. Obdobně jako v předchozích studijích (u laboratorního kmenu Bacillus subtilis 168) jsme popsali u mutantního kmenu odvozeného od Bacillus amyloliquefaciens zhoršenou schopnost růstu při limitaci draslíkem a za osmotického šoku. Tento fenomén jsme studovali na úrovni dynamiky růstu bakteriální kultury. Dále jsme detekovali zvýšenou citlivost kmenu odvozeného od Bacillus amyloliquefaciens k tetracyklinu, změnu morfologie těchto buněk a jejich motility. Mutace v přírodním... We have previously characterized a Bacillus subtilis mutant defective in growth and osmoadaptation under limited K+ concentrations. In this mutant, the yxkO gene encoding a putative ribokinase is disrupted. This gene is supposed to belong to the sigma B operon and its expression is induced after osmotic, heat and ethanol shock. In comparison to the wild type, this mutation causes pleiotropic changes in host phenotype. In addition to its osmosensitivity, the mutant differs in cell shape, motility and ability to produce endospores. Our goal was to focus on manifestations of the mutation in the yxkO gene in other bacteria of the genus Bacillus. Using plasmid pMUTIN4 we have prepared mutants with disruptions of this gene derived from Bacillus amyloliquefaciens and Bacillus subtilis subsp. spizizenii strains differing in the yxkO surroundings and in the level of laboratory domestication. As in the previous study (with laboratory strain Bacillus subtilis 168) we demonstrate impaired ability of the mutant strain derived from Bacillus amyloliquefaciens to grow in potassium limitation and osmotic shock. We have studied this phenomenon at the level of the growth dynamics of the bacterial culture. We have also detected an increased sensitivity of the strain derived from Bacillus amyloliquefaciens to...
Keywords: Bacillus amyloliquefaciens; Bacillus subtilis; Bacillus subtilis subsp. spizizenii; general stress response; motility; osmoadaptation; yxkO; Bacillus amyloliquefaciens; Bacillus subtilis; Bacillus subtilis subsp. spizizenii; motilita; obecná stresová odpověď; osmoadaptace; yxkO

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/48408

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-465556


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses