Original title: Příprava DNA vazebné domény transkripčního faktoru FOXK2
Translated title: Preparation of transcription factor FOXK2 - DNA binding domain
Authors: Kobrle, Lukáš ; Kukačka, Zdeněk (advisor) ; Bělonožníková, Kateřina (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2021
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Transkripční faktory jsou specifické proteiny, které jsou schopny regulovat trankripci a které se na základě strukturních motivů dělí do jednotlivých rodin. Jednou z těchto rodin je i rodina FOX, do které se řadí i transkripční faktor FOXK2, jež byl předmětem studia této práce. Protein FOXK2 reguluje mnoho buněčných dějů včetně buněčné proliferace a metabolismu a má neméně důležitou roli při karcinogenezi, neboť jeho zvýšená exprese byla zaznamenána v případech rakoviny plic, jater a ledvin. V rámci této práce byla připravena DNA vazebná doména trakripčního faktoru FOXK2 rekombinantní expresí v buňkách Escherichia coli. Získaný protein byl poté purifikován a byla studována jeho interakce s DNA pomocí nativní hmotnostní spektrometrie. Transcription factors are specific proteins, which are able to regulate transcription and which are divided into individual families based on structural motifs. One of these families is the FOX family, which also includes the transcription factor FOXK2, which was the studying subject of this work. The FOXK2 protein regulates many cellular processes, including cell proliferation and metabolism and plays an important role in carcinogenesis, as its high expression has been reported in cases of lung, liver and kidney cancer. In this work, the DNA binding domain of the transcription factor FOXK2 was prepared by recombinant expression of Escherichia coli cells. The obtained protein was afterwards purified and its interaction with DNA was studied by native mass spectrometry.
Keywords: DNA binding domain; FOX family; FOXK2; recombinant expression; transcription factor; DNA vazebná doména; FOX rodina; FOXK2; rekombinantní exprese; transkripční faktor

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/151030

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-451575


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses