Název:
Synthesa peptidů jako potenciálních ligandů proteinu GCPII, identifikovaných metodou phage-display
Překlad názvu:
Synthesis of peptides as potential ligands of GCPII protein as identified by phage-display method
Autoři:
Trajhan, Filip ; Konvalinka, Jan (vedoucí práce) ; Žáková, Lenka (oponent) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2021
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Glutamátkarboxypeptidasa II (GCPII, PSMA, membránový marker specifický pro prostatu) je lidská transmembránová metaloproteasa, která je ve velké míře exprimována v karcinomu prostaty, což z ní činí vhodný cíl pro diagnostiku nebo cílenou terapii. Pro takové použití jsou však zapotřebí specifické a pevně se vážící ligandy GCPII. Jedním ze způsobů hledání nízkomolekulárních peptidových ligandů je screening kombinatoriálních knihoven. Metodou umožňující takovéto testování je například fágový displej, který pro studium interakcí peptidů s cílovým proteinem využívá geneticky modifikované bakteriofágy. Na základě výsledků fágového displeje cílenému proti různým formám proteinu GCPII byla připravena knihovna potenciálních peptidových ligandů. Pro syntézu lineárních peptidů a jejich následnou cyklizaci byl využit paralelní peptidový syntetizátor SPENSER. Připravený bicyklický modelový peptid byl charakterizován a byla ověřena jeho vazebná afinita vůči studovanému enzymu. Dále jsou diskutovány možnosti vylepšení účinnosti cyklizace a případného využití optimalizovaného cyklizačního kroku pro syntézy dalších peptidových knihoven. Klíčová slova Glutamátkarboxypeptidasa II, fágový displej, peptidová syntéza, bicyklické peptidy, kombinatoriální chemieGlutamate carboxypeptidase II (GCPII, PSMA-prostate-specific membrane antigen) is a human transmembrane metalloprotease highly expressed in prostate cancer, which makes it a suitable target for diagnostics or targeted cancer therapy. Therefore, specific and tight-binding ligands of GCPII are needed. One way of finding potential low molecular weight peptide ligands is the screening of combinatorial libraries. One of the methods of high-throughput screening is phage display, which uses genetically modified bacteriophages for the study of interaction between peptides and target protein. A library of potential peptide ligands was prepared based on the results of phage display targeted against various forms of GCPII. Parallel peptide synthesiser SPENSER was used for the synthesis and subsequent cyclization of linear peptides. The prepared bicyclic model peptide was characterised and his binding affinity for studied enzyme was confirmed. The possibilities of enhancing the cyclisation efficiency and the use of optimized cyclisation step for preparation of other peptide libraries are discussed. Key words Glutamate carboxypeptidase II, phage display, peptide synthesis, bicyclic peptides, combinatorial chemistry