Název: Homologsearch: R Package For Identifying Homologous Sequences Between Model And Non-Model Organisms
Autoři: Musilová, Jana
Typ dokumentu: Příspěvky z konference
Jazyk: eng
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: In this paper, I present the R package HomologSearch. The package serves for searching similarities between two sequences (protein or nucleotide) in a fasta format. The evaluation is computed using the BLAST algorithm and output is a table of homologous locus tags and genes (if available). The HomologSearch is available in the GitHub repository under the name ‘Jana- Mus/HomologSearch’ and can be installed as a library into the R language.
Klíčová slova: R package; sequence homology; sequence similarity
Zdrojový dokument: Proceedings I of the 26st Conference STUDENT EEICT 2020: General papers, ISBN 978-80-214-5867-3

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/200587

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-447639


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Konferenční materiály > Příspěvky z konference